3ako
Crystal Structure of the Reassembled Venus
1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures
当前条目没有可用的 UniProt 蛋白身份。
七张关系表仍保留该条目的 assembly 与组成信息，但缺少统一蛋白身份时，不能可靠建立跨 PDB 的同蛋白链接。
当前条目的 assembly 组成
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 蛋白 / DNA / RNA / 其他聚合物 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 2 / 0 / 0 / 0 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 2 / 0 / 0 / 0 | 与蛋白数一致 |
| 3 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 2 / 0 / 0 / 0 | 与蛋白数一致 |
| 4 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 2 / 0 / 0 / 0 | 与蛋白数一致 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
2. 结构基本信息 2. Structure Basics
| 条目编号 entry_id | 3ako |
| 沉积日期 deposition_date | 2010-07-15 |
| 结构标题 title | Crystal Structure of the Reassembled Venus |
| 关键词 keywords | Venus, Fluorescent Protein, GFP; FLUORESCENT PROTEIN |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
3ako__assembly_2__model_1
Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
3ako__assembly_2__model_1 | I(q)
3ako__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending
| Rg（Guinier） | 18.47 Å |
| Rg（电子密度） | 17.12 Å |
| 总 Rg | 18.26 Å |
| 原子数 | 1803 |
| 残基数 | 225 |
| 排除体积 | 31934 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| Assembly | Model | 结构单元 | 聚集说明 | 状态 | CRYSOL | 操作 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 1 | 3ako__assembly_1__model_1 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 2 | 1 | 3ako__assembly_2__model_1 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 3 | 1 | 3ako__assembly_3__model_1 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
| 4 | 1 | 3ako__assembly_4__model_1 |
dimeric （2） | 成功 | 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) | 查看 下载 |
4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment
5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)
6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains
CATH v4.4 (8 domains)
| 结构域编号 domain_id | 3akoA00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 155 — Green Fluorescent Protein |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Green fluorescent protein |
| 结构域编号 domain_id | 3akoB00 |
| 类 Class class | 6 — Special |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Other non-globular |
| 拓扑 Topology topology | 160 — HSP40/DNAj peptide-binding domain |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — |
| 结构域编号 domain_id | 3akoC00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 155 — Green Fluorescent Protein |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Green fluorescent protein |
| 结构域编号 domain_id | 3akoD00 |
| 类 Class class | 6 — Special |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Other non-globular |
| 拓扑 Topology topology | 160 — HSP40/DNAj peptide-binding domain |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — |
| 结构域编号 domain_id | 3akoE00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 155 — Green Fluorescent Protein |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Green fluorescent protein |
| 结构域编号 domain_id | 3akoF00 |
| 类 Class class | 6 — Special |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Other non-globular |
| 拓扑 Topology topology | 160 — HSP40/DNAj peptide-binding domain |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — |
| 结构域编号 domain_id | 3akoG00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 155 — Green Fluorescent Protein |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Green fluorescent protein |
| 结构域编号 domain_id | 3akoH00 |
| 类 Class class | 6 — Special |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Other non-globular |
| 拓扑 Topology topology | 160 — HSP40/DNAj peptide-binding domain |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — |