SAXSdb — 3alz

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hemagglutinin

Measles virus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	CDw150 × 4 （Q9GJT3） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	CDw150 × 6 （Q9GJT3） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	E2RZS2_9PARA
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 4–472； UniProt 149–617

CDw150

Saguinus oedipus

UniProt Q9GJT3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 8	Hemagglutinin × 4 （E2RZS2） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 8	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Hemagglutinin × 6 （E2RZS2） 2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose × 12	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9GJT3_SAGOE
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–140； UniProt 1–140

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3alz
沉积日期 deposition_date	2010-08-11
结构标题 title	Crystal structure of the measles virus hemagglutinin bound to its cellular receptor SLAM (Form I)
关键词 keywords	;viral protein-receptor complex, six-bladed beta-propeller fold, Immunoglobulin fold, beta-sandwich, viral protein-membrane protein complex ;; viral protein/membrane protein
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3alz__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3alz__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3alz__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	45.89 Å
Rg（电子密度）	45.39 Å
总 Rg	45.64 Å
原子数	16652
残基数	2104
排除体积	298630 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3alz__assembly_1__model_1`	octameric （8）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`3alz__assembly_2__model_1`	dodecameric （12）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Hemagglutinin
分子量 formula_weight	53423.7 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	4163

ETGDYDQYCADVAAEELMNALVNSTLLETRTTNQFLAVSKGNCSGPTTIRGQFSNMSLSLLDLYLGRGYNVSSIVTMTSQGMYGGTYLVEKPNLSSKRSELSQLSMYRVFEVGVIRNPGLGAPVFHMTNYLEQPVSNDLSNCMVALGELKLAALCHGEDSITIPYQGSGKGVSFQLVKLGVWKSPTDMQSWVPLSTDDPVIDRLYLSSHRGVIADNQAKWAVPTTRTDDKLRMETCFQQACKGKIQALCENPEWAPLKDNRIPSYGVLSVDLSLTVELKIKIASGFGPLITHGSGMDLYKSNHNNVYWLTIPPMKNLALGVINTLEWIPRFKVSPYLFTVPIKEAGGDCHAPTYLPAEVDGDVKLSSNLVILPGQDLQYVLATYDTSRVEHAVVYYVYSPSRSFSYFYPFRLPIKGVPIELQVECFTWDQKLWCRHFCVLADSESGGHITHSGMVGMGVSCTVTREDGTNRRGTKHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Measles virus
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	70146
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	CDw150
分子量 formula_weight	17245.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

MDPKGLFSLTFVLFLSLAFEPSYGTGGRMMNCPKIVQQLGSDVLLPLTHERINTSMNKSIHIVVTMAKSLENSVENKIVSLDPSEAGPPRYLKDRYRFYLENLSLAIRESTKKDEGWYFMTLEKNISVQRFCLHLKLYEQGTKHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Saguinus oedipus
通用名 common_name	Cotton-top tamarin
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9490
宿主生物 host_organism	Homo sapiens

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	2-acetamido-2-deoxy-beta-D-glucopyranose
分子量 formula_weight	221.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

▶

晶胞边长 a length_a	208.119 Å
晶胞边长 b length_b	208.119 Å
晶胞边长 c length_c	182.127 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 63 2 2
空间群编号 int_tables_number	182
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	4.515 Å
最低分辨率 resolution_low	30.039 Å
R 因子 r_factor	0.3263
R_work r_work	0.3258
R_free r_free	0.3376

Crystal structure of the measles virus hemagglutinin bound to its cellular receptor SLAM (Form I)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hemagglutinin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

CDw150

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3alz__assembly_1__model_1

3alz__assembly_1__model_1 | I(q)

3alz__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of the measles virus hemagglutinin bound to its cellular receptor SLAM (Form I)

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hemagglutinin

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

CDw150

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3alz__assembly_1__model_1

3alz__assembly_1__model_1 | I(q)

3alz__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

7. 引用文献 (1)