3bfj

Crystal structure analysis of 1,3-propanediol oxidoreductase

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

1,3-propanediol oxidoreductase

Klebsiella pneumoniae

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 10	FE (II) ION × 10 water × 10	与蛋白数一致
10	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	FE (II) ION × 2 water × 2	与蛋白数一致
11	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	FE (II) ION × 2 water × 2	与蛋白数一致
12	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	FE (II) ION × 2 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 10	FE (II) ION × 10 water × 10	与蛋白数一致
3	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	FE (II) ION × 2 water × 2	与蛋白数一致
4	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	FE (II) ION × 2 water × 2	与蛋白数一致
5	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	FE (II) ION × 2 water × 2	与蛋白数一致
6	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	FE (II) ION × 2 water × 2	与蛋白数一致
7	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	FE (II) ION × 2 water × 2	与蛋白数一致
8	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	FE (II) ION × 2 water × 2	与蛋白数一致
9	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	FE (II) ION × 2 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q7WRJ3_KLEPN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–387； UniProt 1–387 作者链 B； PDB构建体 1–387； UniProt 1–387 作者链 C； PDB构建体 1–387； UniProt 1–387 作者链 D； PDB构建体 1–387； UniProt 1–387 作者链 E； PDB构建体 1–387； UniProt 1–387 作者链 F； PDB构建体 1–387； UniProt 1–387 作者链 G； PDB构建体 1–387； UniProt 1–387 作者链 H； PDB构建体 1–387； UniProt 1–387 作者链 I； PDB构建体 1–387； UniProt 1–387 作者链 J； PDB构建体 1–387； UniProt 1–387 作者链 K； PDB构建体 1–387； UniProt 1–387 作者链 L； PDB构建体 1–387； UniProt 1–387 作者链 M； PDB构建体 1–387； UniProt 1–387 作者链 N； PDB构建体 1–387； UniProt 1–387 作者链 O； PDB构建体 1–387； UniProt 1–387 作者链 P； PDB构建体 1–387； UniProt 1–387 作者链 Q； PDB构建体 1–387； UniProt 1–387 作者链 R； PDB构建体 1–387； UniProt 1–387 作者链 S； PDB构建体 1–387； UniProt 1–387 作者链 T； PDB构建体 1–387； UniProt 1–387

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3bfj
沉积日期 deposition_date	2007-11-21
结构标题 title	Crystal structure analysis of 1,3-propanediol oxidoreductase
关键词 keywords	OPPORTUNISTIC PATHOGENS, DECAMER, STRUCTURAL GENOMICS, STRUCTURAL PROTEOMICS IN EUROPE, SPINE, Oxidoreductase; OXIDOREDUCTASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3bfj__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3bfj__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3bfj__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	49.80 Å
Rg（电子密度）	49.15 Å
总 Rg	49.36 Å
原子数	28720
残基数	3820
排除体积	511720 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3bfj__assembly_1__model_1`	decameric （10）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`3bfj__assembly_2__model_1`	decameric （10）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`3bfj__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`3bfj__assembly_4__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
5	1	`3bfj__assembly_5__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
6	1	`3bfj__assembly_6__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
7	1	`3bfj__assembly_7__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
8	1	`3bfj__assembly_8__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
9	1	`3bfj__assembly_9__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
10	1	`3bfj__assembly_10__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
11	1	`3bfj__assembly_11__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
12	1	`3bfj__assembly_12__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	1,3-propanediol oxidoreductase
分子量 formula_weight	41588.6 kDa
EC 编号 ec_number	1.1.1.202
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	20

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L,M,N,O,P,Q,R,S,T
原子数 atom_count	58348

MSYRMFDYLVPNVNFFGPNAISVVGERCQLLGGKKALLVTDKGLRAIKDGAVDKTLHYLREAGIEVAIFDGVEPNPKDTNVRDGLAVFRREQCDIIVTVGGGSPHDCGKGIGIAATHEGDLYQYAGIETLTNPLPPIVAVNTTAGTASEVTRHCVLTNTETKVKFVIVSWRNLPSVSINDPLLMIGKPAALTAATGMDALTHAVEAYISKDANPVTDAAAMQAIRLIARNLRQAVALGSNLQAREYMAYASLLAGMAFNNANLGYVHAMAHQLGGLYDMPHGVANAVLLPHVARYNLIANPEKFADIAELMGENITGLSTLDAAEKAIAAITRLSMDIGIPQHLRDLGVKETDFPYMAEMALKDGNAFSNPRKGNEQEIAAIFRQAF

来源 Source

来源生物 organism	Klebsiella pneumoniae
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	573
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	FE (II) ION
分子量 formula_weight	55.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	20

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	908

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 60 domains

SCOP 2.08 (20 domains)

结构域编号 domain_id	d3bfja_
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.22 — Dehydroquinate synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	e.22.1 — Dehydroquinate synthase-like
家族 Family family	e.22.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3bfjb_
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.22 — Dehydroquinate synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	e.22.1 — Dehydroquinate synthase-like
家族 Family family	e.22.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3bfjc_
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.22 — Dehydroquinate synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	e.22.1 — Dehydroquinate synthase-like
家族 Family family	e.22.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3bfjd_
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.22 — Dehydroquinate synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	e.22.1 — Dehydroquinate synthase-like
家族 Family family	e.22.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3bfje_
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.22 — Dehydroquinate synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	e.22.1 — Dehydroquinate synthase-like
家族 Family family	e.22.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3bfjf_
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.22 — Dehydroquinate synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	e.22.1 — Dehydroquinate synthase-like
家族 Family family	e.22.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3bfjg_
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.22 — Dehydroquinate synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	e.22.1 — Dehydroquinate synthase-like
家族 Family family	e.22.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3bfjh_
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.22 — Dehydroquinate synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	e.22.1 — Dehydroquinate synthase-like
家族 Family family	e.22.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3bfji_
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.22 — Dehydroquinate synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	e.22.1 — Dehydroquinate synthase-like
家族 Family family	e.22.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3bfjj_
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.22 — Dehydroquinate synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	e.22.1 — Dehydroquinate synthase-like
家族 Family family	e.22.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3bfjk_
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.22 — Dehydroquinate synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	e.22.1 — Dehydroquinate synthase-like
家族 Family family	e.22.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3bfjl_
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.22 — Dehydroquinate synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	e.22.1 — Dehydroquinate synthase-like
家族 Family family	e.22.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3bfjm_
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.22 — Dehydroquinate synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	e.22.1 — Dehydroquinate synthase-like
家族 Family family	e.22.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3bfjn_
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.22 — Dehydroquinate synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	e.22.1 — Dehydroquinate synthase-like
家族 Family family	e.22.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3bfjo_
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.22 — Dehydroquinate synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	e.22.1 — Dehydroquinate synthase-like
家族 Family family	e.22.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3bfjp_
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.22 — Dehydroquinate synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	e.22.1 — Dehydroquinate synthase-like
家族 Family family	e.22.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3bfjq_
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.22 — Dehydroquinate synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	e.22.1 — Dehydroquinate synthase-like
家族 Family family	e.22.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3bfjr_
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.22 — Dehydroquinate synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	e.22.1 — Dehydroquinate synthase-like
家族 Family family	e.22.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3bfjs_
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.22 — Dehydroquinate synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	e.22.1 — Dehydroquinate synthase-like
家族 Family family	e.22.1.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3bfjt_
类 Class class	e — Multi-domain proteins (alpha and beta)
折叠类型 Fold fold	e.22 — Dehydroquinate synthase-like
超家族 Superfamily superfamily	e.22.1 — Dehydroquinate synthase-like
家族 Family family	e.22.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (40 domains)

结构域编号 domain_id	3bfjA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1970 —

结构域编号 domain_id	3bfjA02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1090 — Dehydroquinate synthase-like, alpha domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dehydroquinate synthase-like - alpha domain

结构域编号 domain_id	3bfjB01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1970 —

结构域编号 domain_id	3bfjB02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1090 — Dehydroquinate synthase-like, alpha domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dehydroquinate synthase-like - alpha domain

结构域编号 domain_id	3bfjC01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1970 —

结构域编号 domain_id	3bfjC02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1090 — Dehydroquinate synthase-like, alpha domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dehydroquinate synthase-like - alpha domain

结构域编号 domain_id	3bfjD01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1970 —

结构域编号 domain_id	3bfjD02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1090 — Dehydroquinate synthase-like, alpha domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dehydroquinate synthase-like - alpha domain

结构域编号 domain_id	3bfjE01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1970 —

结构域编号 domain_id	3bfjE02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1090 — Dehydroquinate synthase-like, alpha domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dehydroquinate synthase-like - alpha domain

结构域编号 domain_id	3bfjF01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1970 —

结构域编号 domain_id	3bfjF02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1090 — Dehydroquinate synthase-like, alpha domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dehydroquinate synthase-like - alpha domain

结构域编号 domain_id	3bfjG01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1970 —

结构域编号 domain_id	3bfjG02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1090 — Dehydroquinate synthase-like, alpha domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dehydroquinate synthase-like - alpha domain

结构域编号 domain_id	3bfjH01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1970 —

结构域编号 domain_id	3bfjH02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1090 — Dehydroquinate synthase-like, alpha domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dehydroquinate synthase-like - alpha domain

结构域编号 domain_id	3bfjI01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1970 —

结构域编号 domain_id	3bfjI02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1090 — Dehydroquinate synthase-like, alpha domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dehydroquinate synthase-like - alpha domain

结构域编号 domain_id	3bfjJ01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1970 —

结构域编号 domain_id	3bfjJ02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1090 — Dehydroquinate synthase-like, alpha domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dehydroquinate synthase-like - alpha domain

结构域编号 domain_id	3bfjK01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1970 —

结构域编号 domain_id	3bfjK02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1090 — Dehydroquinate synthase-like, alpha domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dehydroquinate synthase-like - alpha domain

结构域编号 domain_id	3bfjL01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1970 —

结构域编号 domain_id	3bfjL02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1090 — Dehydroquinate synthase-like, alpha domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dehydroquinate synthase-like - alpha domain

结构域编号 domain_id	3bfjM01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1970 —

结构域编号 domain_id	3bfjM02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1090 — Dehydroquinate synthase-like, alpha domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dehydroquinate synthase-like - alpha domain

结构域编号 domain_id	3bfjN01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1970 —

结构域编号 domain_id	3bfjN02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1090 — Dehydroquinate synthase-like, alpha domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dehydroquinate synthase-like - alpha domain

结构域编号 domain_id	3bfjO01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1970 —

结构域编号 domain_id	3bfjO02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1090 — Dehydroquinate synthase-like, alpha domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dehydroquinate synthase-like - alpha domain

结构域编号 domain_id	3bfjP01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1970 —

结构域编号 domain_id	3bfjP02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1090 — Dehydroquinate synthase-like, alpha domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dehydroquinate synthase-like - alpha domain

结构域编号 domain_id	3bfjQ01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1970 —

结构域编号 domain_id	3bfjQ02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1090 — Dehydroquinate synthase-like, alpha domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dehydroquinate synthase-like - alpha domain

结构域编号 domain_id	3bfjR01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1970 —

结构域编号 domain_id	3bfjR02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1090 — Dehydroquinate synthase-like, alpha domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dehydroquinate synthase-like - alpha domain

结构域编号 domain_id	3bfjS01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1970 —

结构域编号 domain_id	3bfjS02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1090 — Dehydroquinate synthase-like, alpha domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dehydroquinate synthase-like - alpha domain

结构域编号 domain_id	3bfjT01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1970 —

结构域编号 domain_id	3bfjT02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1090 — Dehydroquinate synthase-like, alpha domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Dehydroquinate synthase-like - alpha domain

▶

晶胞边长 a length_a	91.937 Å
晶胞边长 b length_b	226.611 Å
晶胞边长 c length_c	232.627 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	92.91 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	40

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.700 Å
最低分辨率 resolution_low	20.000 Å
R 因子 r_factor	0.2053
R_work r_work	0.2029
R_free r_free	0.2509

Crystal structure analysis of 1,3-propanediol oxidoreductase

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

1,3-propanediol oxidoreductase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3bfj__assembly_1__model_1

3bfj__assembly_1__model_1 | I(q)

3bfj__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 60 domains

SCOP 2.08 (20 domains)

CATH v4.4 (40 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure analysis of 1,3-propanediol oxidoreductase

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

1,3-propanediol oxidoreductase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3bfj__assembly_1__model_1

3bfj__assembly_1__model_1 | I(q)

3bfj__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 60 domains

SCOP 2.08 (20 domains)

CATH v4.4 (40 domains)

7. 引用文献 (1)