Porphyromonas gingivalis
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 2 | ACETATE ION × 1 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 2 GLYCEROL × 1 water × 2 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白同源多聚体 | 同源多聚体 | 蛋白 6 | ACETATE ION × 3 4-(2-HYDROXYETHYL)-1-PIPERAZINE ETHANESULFONIC ACID × 6 GLYCEROL × 3 water × 6 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | Q7MW40_PORGI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 4–304； UniProt 1–301 作者链 B； PDB构建体 4–304； UniProt 1–301 |
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| 条目编号 entry_id | 3bio |
| 沉积日期 deposition_date | 2007-11-30 |
| 结构标题 title | Crystal structure of oxidoreductase (Gfo/Idh/MocA family member) from Porphyromonas gingivalis W83 |
| 关键词 keywords | ;structural genomics, oxidoreductase, MCSG, PSI-2, Gfo/Idh/MocA family, Protein Structure Initiative, Midwest Center for Structural Genomics ;; OXIDOREDUCTASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 26.94 Å |
| Rg（电子密度） | 26.47 Å |
| 总 Rg | 26.89 Å |
| 原子数 | 4427 |
| 残基数 | 561 |
| 排除体积 | 79236 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 3bioA01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 50 — Rossmann fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain |
| 结构域编号 domain_id | 3bioA02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 360 — Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2 |
| 结构域编号 domain_id | 3bioB01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 50 — Rossmann fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 720 — NAD(P)-binding Rossmann-like Domain |
| 结构域编号 domain_id | 3bioB02 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 360 — Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Dihydrodipicolinate Reductase; domain 2 |