SAXSdb — 3bjq

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Phage-related protein

Bordetella bronchiseptica RB50

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 10	TETRAETHYLENE GLYCOL × 22 CHLORIDE ION × 1 water × 10	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q7WDF2_BORBR
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–316； UniProt 1–315 作者链 B； PDB构建体 2–316； UniProt 1–315 作者链 C； PDB构建体 2–316； UniProt 1–315 作者链 D； PDB构建体 2–316； UniProt 1–315 作者链 E； PDB构建体 2–316； UniProt 1–315 作者链 F； PDB构建体 2–316； UniProt 1–315 作者链 G； PDB构建体 2–316； UniProt 1–315 作者链 H； PDB构建体 2–316； UniProt 1–315 作者链 I； PDB构建体 2–316； UniProt 1–315 作者链 J； PDB构建体 2–316； UniProt 1–315

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3bjq
沉积日期 deposition_date	2007-12-04
结构标题 title	CRYSTAL STRUCTURE OF A PHAGE-RELATED PROTEIN (BB3626) FROM BORDETELLA BRONCHISEPTICA RB50 AT 2.05 A RESOLUTION
关键词 keywords	;PHAGE-RELATED PROTEIN, STRUCTURAL GENOMICS, JOINT CENTER FOR STRUCTURAL GENOMICS, JCSG, PROTEIN STRUCTURE INITIATIVE, PSI-2, VIRAL PROTEIN ;; VIRAL PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3bjq__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3bjq__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3bjq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	47.81 Å
Rg（电子密度）	47.10 Å
总 Rg	47.39 Å
原子数	23014
残基数	2915
排除体积	411030 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3bjq__assembly_1__model_1`	decameric （10）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Phage-related protein
分子量 formula_weight	34941.3 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	10

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H,I,J
原子数 atom_count	24467

GMSQMSPGQARVVDPILSTHARGYRQSTLIGKKLFPVAPVAQYGGKILTFGKEAFRLYNTKRAPGANTKRIDFGYEGDPYSIVPSALEAKVPRELMRDASQVPGIDLGARSVNTVLRIMALAHEHECAQIALDPAKYNADHKVKLVGSARWTSPDSDPTKDVETAKEAIADSIGMEPNRLMLSRKALSACKYHPKLIERVKYTRAESITIDMLKALWEVEEIVVGTARVATGANDSFGDVWGPDVWLGYVSDNPDPSVEEPSFGYTYQIEGHPLVEVPYWDNNAKSWIYGVSDDNTPALSGMLAGYLIEDAGLPAA

来源 Source

来源生物 organism	Bordetella bronchiseptica RB50
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	257310
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	TETRAETHYLENE GLYCOL
分子量 formula_weight	194.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	22

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	CHLORIDE ION
分子量 formula_weight	35.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1336

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

CATH v4.4 (10 domains)

结构域编号 domain_id	3bjqA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1690 — phage-related protein like fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — phage-related protein like domain

结构域编号 domain_id	3bjqB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1690 — phage-related protein like fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — phage-related protein like domain

结构域编号 domain_id	3bjqC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1690 — phage-related protein like fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — phage-related protein like domain

结构域编号 domain_id	3bjqD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1690 — phage-related protein like fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — phage-related protein like domain

结构域编号 domain_id	3bjqE00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1690 — phage-related protein like fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — phage-related protein like domain

结构域编号 domain_id	3bjqF00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1690 — phage-related protein like fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — phage-related protein like domain

结构域编号 domain_id	3bjqG00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1690 — phage-related protein like fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — phage-related protein like domain

结构域编号 domain_id	3bjqH00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1690 — phage-related protein like fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — phage-related protein like domain

结构域编号 domain_id	3bjqI00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1690 — phage-related protein like fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — phage-related protein like domain

结构域编号 domain_id	3bjqJ00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1690 — phage-related protein like fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — phage-related protein like domain

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晶胞边长 a length_a	93.390 Å
晶胞边长 b length_b	188.320 Å
晶胞边长 c length_c	105.150 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	106.60 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	20

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.050 Å
最低分辨率 resolution_low	49.147 Å
R 因子 r_factor	0.1860
R_work r_work	0.1860
R_free r_free	0.2270

CRYSTAL STRUCTURE OF A PHAGE-RELATED PROTEIN (BB3626) FROM BORDETELLA BRONCHISEPTICA RB50 AT 2.05 A RESOLUTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Phage-related protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3bjq__assembly_1__model_1

3bjq__assembly_1__model_1 | I(q)

3bjq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

CATH v4.4 (10 domains)

7. 引用文献 (1)

CRYSTAL STRUCTURE OF A PHAGE-RELATED PROTEIN (BB3626) FROM BORDETELLA BRONCHISEPTICA RB50 AT 2.05 A RESOLUTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Phage-related protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3bjq__assembly_1__model_1

3bjq__assembly_1__model_1 | I(q)

3bjq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

CATH v4.4 (10 domains)

7. 引用文献 (1)