Staphylococcus aureus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 单体 | 蛋白 1 DNA 2 | ;DNA (5'-D(*DTP*DTP*DTP*DAP*DAP*DCP*DAP*DGP*DTP*DTP*DAP*DAP*DGP*(BRU)P*DAP*DT)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(*DAP*DAP*(BRU)P*DAP*DCP*DTP*DTP*DAP*DAP*DCP*DTP*DGP*DTP*DTP*DAP*DA)-3') ; × 1 MAGNESIUM ION × 2 water × 3 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | AGRA_STAAU |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 3 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 2–103； UniProt 137–238 |
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| 条目编号 entry_id | 3bs1 |
| 沉积日期 deposition_date | 2007-12-21 |
| 结构标题 title | Structure of the Staphylococcus aureus AgrA LytTR Domain Bound to DNA Reveals a Beta Fold with a Novel Mode of Binding |
| 关键词 keywords | ;LytTR, AgrA, response regulator, DNA binding domain, Activator, Cytoplasm, DNA-binding, Phosphoprotein, Transcription, Transcription regulation, Two-component regulatory system, transcription regulator ;; transcription regulator |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 19.04 Å |
| Rg（电子密度） | 18.09 Å |
| 总 Rg | 18.91 Å |
| 原子数 | 1521 |
| 残基数 | 133 |
| 排除体积 | 24903 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 3bs1A00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 1020 — LytTr DNA-binding domain |