Escherichia coli
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–RNA | 单体 | 蛋白 1 RNA 1 | ;RNA (5'-D(P*GP*CP*UP*GP*UP*GP*(5MU)P*UP*CP*GP*AP*UP*CP*CP*AP*CP*AP*GP*C)-3') ; × 1 water × 2 | 与全部聚合物一致 |
| 2 | 蛋白–RNA | 单体 | 蛋白 1 RNA 1 | ;RNA (5'-D(P*GP*CP*UP*GP*UP*GP*(5MU)P*UP*CP*GP*AP*UP*CP*CP*AP*CP*AP*GP*C)-3') ; × 1 water × 2 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | TRMA_ECOLI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 4–369； UniProt 1–366 作者链 B； PDB构建体 4–369； UniProt 1–366 |
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| 条目编号 entry_id | 3bt7 |
| 沉积日期 deposition_date | 2007-12-27 |
| 结构标题 title | Structure of E. coli 5-Methyluridine Methyltransferase TrmA in complex with 19 nucleotide T-arm analogue |
| 关键词 keywords | methyluridine, methyltransferase, TrmA, RUMT, S-adenosyl-L-methionine, tRNA processing, TRANSFERASE-RNA COMPLEX; TRANSFERASE/RNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 22.69 Å |
| Rg（电子密度） | 21.93 Å |
| 总 Rg | 22.67 Å |
| 原子数 | 3357 |
| 残基数 | 387 |
| 排除体积 | 58104 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 3bt7A01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 50 — Rossmann fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 150 — Vaccinia Virus protein VP39 |
| 结构域编号 domain_id | 3bt7A02 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 1070 — |
| 结构域编号 domain_id | 3bt7B01 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — 3-Layer(aba) Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 50 — Rossmann fold |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 150 — Vaccinia Virus protein VP39 |
| 结构域编号 domain_id | 3bt7B02 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P) |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 1070 — |