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2LGF
Solution structure of Ca2+/calmodulin complexed with a peptide representing the calmodulin-binding domain of L-selectin
提交 2011-07-25
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构建体不同
聚集状态不同
配体/离子不同
实验方法不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
蛋白异源复合物
异源复合物；蛋白 × 2
PDB 声明：dimeric
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链 B
349–363（15 aa）
片段：sequence database residues 349-363
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未记录
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CA CALCIUM ION × 4
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SOLUTION NMR
NMR测量条件
pH 6.8；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.1；压力 ambient
NMR测量条件
pH 6.8；303 K；离子强度（mmCIF原始值）0.3；压力 ambient
NMR样品组成
0.5-0.8 mM [U-13C; U-15N] protein_1, 0.5-0.8 mM protein_2, 4 mM CALCIUM ION, 0.5 mM DSS, 100 mM potassium chloride, 0.03 % sodium azide, 20 mM Bis-Tris, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5-0.8 mM [U-2H; U-15N] protein_1, 0.5-0.8 mM protein_2, 4 mM CALCIUM ION, 0.5 mM DSS, 100 mM potassium chloride, 0.03 % sodium azide, 20 mM Bis-Tris, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5-0.8 mM [1H/13C-methyl Met; U-2H; U-15N] protein_1, 0.5-0.8 mM protein_2, 4 mM CALCIUM ION, 0.5 mM DSS, 100 mM potassium chloride, 0.03 % sodium azide, 20 mM Bis-Tris, 100% D2O | 100% D2O
NMR样品组成
0.5-0.8 mM [U-13C; U-15N] protein_1, 0.5-0.8 mM protein_2, 4 mM CALCIUM ION, 0.5 mM DSS, 300 mM potassium chloride, 0.03 % sodium azide, 20 mM Bis-Tris, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
NMR样品组成
0.5-0.8 mM [U-13C; U-15N] protein_1, 0.5-0.8 mM protein_2, 4 mM CALCIUM ION, 0.5 mM DSS, 300 mM potassium chloride, 0.03 % sodium azide, 20 mM Bis-Tris, 16 w/v Pf1 phage, 90% H2O/10% D2O | 90% H2O/10% D2O
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分辨率未提供
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5VC1
Crystal structure of L-selectin lectin/EGF domains
提交 2017-03-30
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构建体不同
突变/修饰不同
配体/离子不同
实验环境不同
结构质量不同
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Assembly 1
其他组合
单体；蛋白 × 1
PDB 声明：monomeric
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链 A
39–195（157 aa）
片段：UNP residues 39-195
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突变：N22Q, N139Q
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PG4 TETRAETHYLENE GLYCOL × 1
PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1
GOL GLYCEROL × 1
CA CALCIUM ION × 1
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X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件
VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；293 K；100 mM sodium cacodylate pH 7.5, 200 mM calcium acetate, 40% (v/v) PEG 600
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分辨率 1.94 Å
R-free 0.231
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