Human gammaherpesvirus 8
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 4 | NF-kappa-B essential modulator × 2 （Q9Y6K9） | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | P88961_HHV8 |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 6–183； UniProt 1–178 作者链 B； PDB构建体 6–183； UniProt 1–178 |
Homo sapiens
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 4 | ORF K13 × 2 （P88961） | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | NEMO_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 D； PDB构建体 8–110； UniProt 150–272 作者链 E； PDB构建体 8–110； UniProt 150–272 |
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| 条目编号 entry_id | 3cl3 |
| 沉积日期 deposition_date | 2008-03-18 |
| 结构标题 title | Crystal Structure of a vFLIP-IKKgamma complex: Insights into viral activation of the IKK signalosome |
| 关键词 keywords | ;Death effector domain, coiled-coil, Coiled coil, Cytoplasm, Disease mutation, Ectodermal dysplasia, Host-virus interaction, Nucleus, Transcription, Transcription regulation, viral protein-signaling protein COMPLEX ;; viral protein/signaling protein |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 31.24 Å |
| Rg（电子密度） | 30.75 Å |
| 总 Rg | 31.22 Å |
| 原子数 | 3477 |
| 残基数 | 454 |
| 排除体积 | 61761 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 3cl3A01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 533 — Death Domain, Fas |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Death Domain, Fas |
| 结构域编号 domain_id | 3cl3A02 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 533 — Death Domain, Fas |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Death Domain, Fas |
| 结构域编号 domain_id | 3cl3B01 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 533 — Death Domain, Fas |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Death Domain, Fas |
| 结构域编号 domain_id | 3cl3B02 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 10 — Orthogonal Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 533 — Death Domain, Fas |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 10 — Death Domain, Fas |
| 结构域编号 domain_id | 3cl3D00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 390 — L1 transposable element, trimerization domain |
| 结构域编号 domain_id | 3cl3E00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 390 — L1 transposable element, trimerization domain |