SAXSdb — 3cnq

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;Subtilisin BPN' ;

Bacillus amyloliquefaciens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	ZINC ION × 5 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	ZINC ION × 5 water × 2	与蛋白数一致
3	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	ZINC ION × 5 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	SUBT_BACAM
Isoform	—
PDB实体	1, 2
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 3–75； UniProt 32–106 作者链 S； PDB构建体 1–266； UniProt 108–382

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3cnq
沉积日期 deposition_date	2008-03-26
结构标题 title	Prosubtilisin Substrate Complex of Subtilisin SUBT_BACAM
关键词 keywords	uncleaved, proenzyme, substrate complex, Hydrolase, Metal-binding, Protease, Secreted, Serine protease, Sporulation, Zymogen; HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3cnq__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3cnq__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3cnq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	20.73 Å
Rg（电子密度）	19.77 Å
总 Rg	20.71 Å
原子数	2406
残基数	335
排除体积	42813 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3cnq__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`3cnq__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`3cnq__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	;Subtilisin BPN' ;
分子量 formula_weight	8786.1 kDa
突变 mutation	K27E, V37L, Q40C, K57E, H72K, V73L, A74Y, H75R, Y77L
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P
原子数 atom_count	2665

MGGKSNGEKKYIVGFKQGFKSCAKKEDVISEKGGKLQKCFKYVDAASATLNEKAVEELKKDPSVAYVEEDKLYRALSATS

来源 Source

来源生物 organism	Bacillus amyloliquefaciens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1390
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	;Subtilisin BPN' ;
分子量 formula_weight	26420.4 kDa
EC 编号 ec_number	3.4.21.62
突变 mutation	;Q2K, S3C, P5S, S9A, I31L, D32A, K43N, M50F, A73L, Y104A, G128S, E156S, G166S, G169A, S188P, Q206C, N212G, K217L, N218S, S221A, T254A, Q271E ;
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	S

AKCVSYGVAQIKAPALHSQGYTGSNVKVAVLASGIDSSHPDLNVAGGASFVPSETNPFQDNNSHGTHVAGTVLAVAPSASLYAVKVLGADGSGQASWIINGIEWAIANNMDVINMSLGSPSGSAALKAAVDKAVASGVVVVAAAGNSGTSGSSSTVSYPAKYPSVIAVGAVDSSNQRAPFSSVGPELDVMAPGVSICSTLPGGKYGALSGTAMASPHVAGAAALILSKHPNWTNTQVRSSLENTATKLGDSFYYGKGLINVEAAAQ

来源 Source

来源生物 organism	Bacillus amyloliquefaciens
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1390
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	259

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_id	d3cnqp1
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.58 — Ferredoxin-like
超家族 Superfamily superfamily	d.58.3 — Protease propeptides/inhibitors
家族 Family family	d.58.3.2 — Subtilase propeptides/inhibitors

结构域编号 domain_id	d3cnqp2
类 Class class	l — Artifacts
折叠类型 Fold fold	l.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamily	l.1.1 — Tags
家族 Family family	l.1.1.1 — Tags

结构域编号 domain_id	d3cnqs_
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.41 — Subtilisin-like
超家族 Superfamily superfamily	c.41.1 — Subtilisin-like
家族 Family family	c.41.1.1 — Subtilases

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	3cnqP00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 — Peptidase S8 propeptide/proteinase inhibitor I9

结构域编号 domain_id	3cnqS00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	200 — Peptidase S8/S53 domain

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晶胞边长 a length_a	43.195 Å
晶胞边长 b length_b	72.941 Å
晶胞边长 c length_c	93.112 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.710 Å
最低分辨率 resolution_low	10.000 Å
R 因子 r_factor	0.1930
R_work r_work	0.1910
R_free r_free	0.2320

Prosubtilisin Substrate Complex of Subtilisin SUBT_BACAM

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;Subtilisin BPN' ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3cnq__assembly_1__model_1

3cnq__assembly_1__model_1 | I(q)

3cnq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)

Prosubtilisin Substrate Complex of Subtilisin SUBT_BACAM

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;Subtilisin BPN' ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3cnq__assembly_1__model_1

3cnq__assembly_1__model_1 | I(q)

3cnq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 5 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (1)