3ctd

Crystal structure of a putative AAA family ATPase from Prochlorococcus marinus subsp. pastoris

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Putative ATPase, AAA family

Prochlorococcus marinus subsp. pastoris str. CCMP1986

UniProt Q7V3J8

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 4 water × 4 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q7V3J8_PROMP
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 4–205; UniProt 228–429 作者链 B; PDB构建体 4–205; UniProt 228–429

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3ctd
沉积日期 deposition_date2008-04-11
结构标题 titleCrystal structure of a putative AAA family ATPase from Prochlorococcus marinus subsp. pastoris
关键词 keywords;STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION, PSI-2, Protein Structure Initiative, New York SGX Research Center for Structural Genomics, NYSGXRC, ATP-binding, Nucleotide-binding ;; STRUCTURAL GENOMICS, UNKNOWN FUNCTION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3ctd__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3ctd__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3ctd__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)26.71 Å
Rg(电子密度)25.66 Å
总 Rg26.46 Å
原子数4754
残基数616
排除体积84350 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3ctd__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd3ctda1
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.80 — post-AAA+ oligomerization domain-like
超家族 Superfamily superfamilya.80.1 — post-AAA+ oligomerization domain-like
家族 Family familya.80.1.2 — MgsA/YrvN C-terminal domain-like
结构域编号 domain_idd3ctdb_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.80 — post-AAA+ oligomerization domain-like
超家族 Superfamily superfamilya.80.1 — post-AAA+ oligomerization domain-like
家族 Family familya.80.1.2 — MgsA/YrvN C-terminal domain-like

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id3ctdA01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology272 — Zinc Finger, Delta Prime; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id3ctdA02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology3710 — post-AAA+ oligomerization domain-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — DNA polymerase III clamp loader subunits, C-terminal domain
结构域编号 domain_id3ctdB01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology272 — Zinc Finger, Delta Prime; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id3ctdB02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology3710 — post-AAA+ oligomerization domain-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — DNA polymerase III clamp loader subunits, C-terminal domain
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7. 引用文献 (1)