Tomato aspermy virus
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–RNA | 同源多聚体 | 蛋白 4 RNA 4 | ;RNA (5'-R(P*CP*GP*UP*AP*CP*GP*CP*GP*GP*AP*AP*UP*AP*CP*UP*UP*CP*GP*A)-3') ; × 2 ;RNA (5'-R(P*UP*CP*GP*AP*AP*GP*UP*AP*UP*UP*CP*CP*GP*CP*GP*UP*AP*CP*G)-3') ; × 2 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | ORF2B_TAV |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 3 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 2–70； UniProt 1–69 作者链 B； PDB构建体 2–70； UniProt 1–69 作者链 C； PDB构建体 2–70； UniProt 1–69 作者链 D； PDB构建体 2–70； UniProt 1–69 |
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| 条目编号 entry_id | 3cz3 |
| 沉积日期 deposition_date | 2008-04-27 |
| 结构标题 title | Crystal structure of Tomato Aspermy Virus 2b in complex with siRNA |
| 关键词 keywords | protein-dsRNA complex, Coiled coil, Nucleus, Suppressor of RNA silencing, VIRAL PROTEIN-RNA COMPLEX; VIRAL PROTEIN/RNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 27.60 Å |
| Rg（电子密度） | 27.21 Å |
| 总 Rg | 27.56 Å |
| 原子数 | 3546 |
| 残基数 | 298 |
| 排除体积 | 56774 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | 3cz3A00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 3800 — |
| 结构域编号 domain_id | 3cz3B00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 3800 — |
| 结构域编号 domain_id | 3cz3C00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 3800 — |
| 结构域编号 domain_id | 3cz3D00 |
| 类 Class class | 1 — Mainly Alpha |
| 架构 Architecture architecture | 20 — Up-down Bundle |
| 拓扑 Topology topology | 5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 3800 — |