3d31

ModBC from Methanosarcina acetivorans

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Sulfate/molybdate ABC transporter, ATP-binding protein

Methanosarcina acetivorans

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Sulfate/molybdate ABC transporter, permease protein × 2 （Q8TTZ4） TUNGSTATE(VI)ION × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Sulfate/molybdate ABC transporter, permease protein × 1 （Q8TTZ4） TUNGSTATE(VI)ION × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Sulfate/molybdate ABC transporter, permease protein × 1 （Q8TTZ4） TUNGSTATE(VI)ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q8TTZ3_METAC
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–348； UniProt 1–348 作者链 B； PDB构建体 1–348； UniProt 1–348

Sulfate/molybdate ABC transporter, permease protein

Methanosarcina acetivorans

UniProt Q8TTZ4

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Sulfate/molybdate ABC transporter, ATP-binding protein × 2 （Q8TTZ3） TUNGSTATE(VI)ION × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Sulfate/molybdate ABC transporter, ATP-binding protein × 1 （Q8TTZ3） TUNGSTATE(VI)ION × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Sulfate/molybdate ABC transporter, ATP-binding protein × 1 （Q8TTZ3） TUNGSTATE(VI)ION × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q8TTZ4_METAC
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 24–295； UniProt 1–272 作者链 D； PDB构建体 24–295； UniProt 1–272

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3d31
沉积日期 deposition_date	2008-05-09
结构标题 title	ModBC from Methanosarcina acetivorans
关键词 keywords	ATP-binding, Nucleotide-binding, Transport, Membrane, Transmembrane, TRANSPORT PROTEIN; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3d31__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3d31__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3d31__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	35.83 Å
Rg（电子密度）	36.01 Å
总 Rg	36.35 Å
原子数	4660
残基数	596
排除体积	84756 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3d31__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`3d31__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`3d31__assembly_3__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Sulfate/molybdate ABC transporter, ATP-binding protein
分子量 formula_weight	38907.1 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	9320

MIEIESLSRKWKNFSLDNLSLKVESGEYFVILGPTGAGKTLFLELIAGFHVPDSGRILLDGKDVTDLSPEKHDIAFVYQNYSLFPHMNVKKNLEFGMRMKKIKDPKRVLDTARDLKIEHLLDRNPLTLSGGEQQRVALARALVTNPKILLLDEPLSALDPRTQENAREMLSVLHKKNKLTVLHITHDQTEARIMADRIAVVMDGKLIQVGKPEEIFEKPVEGRVASFVGFENVLKGRVISAEQGLLRIRVGEVVIDAAGDMEVGDQVYAFLRPENIALSKSSTQSSIRNSLQGRVTEAWVLGALVRVKVDCGVPLNVLITRRSAEEMELSPGVQIYARFKASSVHVLR

来源 Source

来源生物 organism	Methanosarcina acetivorans
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Sulfate/molybdate ABC transporter, permease protein
分子量 formula_weight	32841.6 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

MGHHHHHHHHHHSSGENLYFQGHMKAKNRKTRKFEPLTFVFSFLLLVLFLFIFLTLSNMIFEQITEDFSGLVKAAGNRSVISSIFLSLYAGFLATLLALLLGAPTGYILARFDFPGKRLVESIIDVPVVVPHTVAGIALLTVFGSRGLIGEPLESYIQFRDALPGIVVAMLFVSMPYLANSAREGFKSVDPRLENAARSLGAPLWKAFFFVTLPLSARYLLIGSVMTWARAISEFGAVVILAYYPMVGPTLIYDRFISYGLSASRPIAVLLILVTLSIFLVIRTLSAGWSIYDRD

来源 Source

来源生物 organism	Methanosarcina acetivorans
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	TUNGSTATE(VI)ION
分子量 formula_weight	247.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 14 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

结构域编号 domain_id	d3d31a1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.40 — OB-fold
超家族 Superfamily superfamily	b.40.6 — MOP-like
家族 Family family	b.40.6.3 — ABC-transporter additional domain

结构域编号 domain_id	d3d31a2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.12 — ABC transporter ATPase domain-like

结构域编号 domain_id	d3d31b1
类 Class class	b — All beta proteins
折叠类型 Fold fold	b.40 — OB-fold
超家族 Superfamily superfamily	b.40.6 — MOP-like
家族 Family family	b.40.6.0 — automated matches

结构域编号 domain_id	d3d31b2
类 Class class	c — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold fold	c.37 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
超家族 Superfamily superfamily	c.37.1 — P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolases
家族 Family family	c.37.1.12 — ABC transporter ATPase domain-like

结构域编号 domain_id	d3d31c1
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.58 — MetI-like
超家族 Superfamily superfamily	f.58.1 — MetI-like
家族 Family family	f.58.1.1 — MetI-like

结构域编号 domain_id	d3d31d1
类 Class class	f — Membrane and cell surface proteins and peptides
折叠类型 Fold fold	f.58 — MetI-like
超家族 Superfamily superfamily	f.58.1 — MetI-like
家族 Family family	f.58.1.1 — MetI-like

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id	3d31A01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	3d31A02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	3d31A03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain

结构域编号 domain_id	3d31B01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	3d31B02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	3d31B03
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	100 — RNA polymerase II/Efflux pump adaptor protein, barrel-sandwich hybrid domain

结构域编号 domain_id	3d31C00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3720 — MetI-like fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — MetI-like

结构域编号 domain_id	3d31D00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	3720 — MetI-like fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — MetI-like

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晶胞边长 a length_a	92.840 Å
晶胞边长 b length_b	139.460 Å
晶胞边长 c length_c	207.330 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	P 21 21 21
空间群编号 int_tables_number	19
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.000 Å
最低分辨率 resolution_low	30.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2510
R_free r_free	0.2820

ModBC from Methanosarcina acetivorans

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Sulfate/molybdate ABC transporter, ATP-binding protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Sulfate/molybdate ABC transporter, permease protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3d31__assembly_2__model_1

3d31__assembly_2__model_1 | I(q)

3d31__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 14 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)

ModBC from Methanosarcina acetivorans

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Sulfate/molybdate ABC transporter, ATP-binding protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Sulfate/molybdate ABC transporter, permease protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3d31__assembly_2__model_1

3d31__assembly_2__model_1 | I(q)

3d31__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 14 domains

SCOP 2.08 (6 domains)

CATH v4.4 (8 domains)

7. 引用文献 (1)