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3dft

Phosphate ions in D33S mutant fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle

Method: X-RAY DIFFRACTION Dmax: 112.2 Å Quality: GOOD
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Fructose-bisphosphate aldolase A

Oryctolagus cuniculus

UniProt P00883

当前结构中的状态

Assembly 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与共同组分 实验方法与环境 结构质量
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric（4） 与蛋白拷贝数一致 链 A； UniProt 2–364 链 B； UniProt 2–364 链 C； UniProt 2–364 链 D； UniProt 2–364 突变：D33S PO4 PHOSPHATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；sodium HEPES, PEG 4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K 分辨率 1.94 Å R-free 0.205

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB 相对当前条目 3DFT Assembly / 聚集状态 构建体 突变与修饰 配体、离子与非聚合物 实验方法与环境 结构质量
11NH Rabbit muscle Aldolase (C1 symmetry) determined using the SPT Labtech chameleon in the presence of 0x SurfACT 提交 2026-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 3–345（343 aa）
链 B 3–345（343 aa）
链 C 3–345（343 aa）
链 D 3–345（343 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Samples were frozen with the SPT Labtech chameleon
分辨率 2.42 Å
11NI Rabbit muscle Aldolase (D2 symmetry) determined using the SPT Labtech chameleon in the presence of 0x SurfACT 提交 2026-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 3–345（343 aa）
链 B 3–345（343 aa）
链 C 3–345（343 aa）
链 D 3–345（343 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Samples were frozen with the SPT Labtech chameleon
分辨率 2.27 Å
11NJ Rabbit muscle Aldolase (C1 symmetry) determined using the SPT Labtech chameleon in the presence of 0.25x SurfACT 提交 2026-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 3–345（343 aa）
链 B 3–345（343 aa）
链 C 3–345（343 aa）
链 D 3–345（343 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Samples were frozen with the SPT Labtech chameleon
分辨率 2.40 Å
11NK Rabbit muscle Aldolase (D2 symmetry) determined using the SPT Labtech chameleon in the presence of 0.25x SurfACT 提交 2026-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 3–345（343 aa）
链 B 3–345（343 aa）
链 C 3–345（343 aa）
链 D 3–345（343 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Samples were frozen with the SPT Labtech chameleon
分辨率 2.17 Å
11NL Rabbit muscle Aldolase (C1 symmetry) determined using the SPT Labtech chameleon in the presence of 0.5x SurfACT 提交 2026-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 3–345（343 aa）
链 B 3–345（343 aa）
链 C 3–345（343 aa）
链 D 3–345（343 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Samples were frozen with the SPT Labtech chameleon
分辨率 2.41 Å
11NM Rabbit muscle Aldolase (D2 symmetry) determined using the SPT Labtech chameleon in the presence of 0.5x SurfACT 提交 2026-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 3–345（343 aa）
链 B 3–345（343 aa）
链 C 3–345（343 aa）
链 D 3–345（343 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Samples were frozen with the SPT Labtech chameleon
分辨率 2.19 Å
11NN Rabbit muscle Aldolase (C1 symmetry) determined using the SPT Labtech chameleon in the presence of 1x SurfACT 提交 2026-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 3–345（343 aa）
链 B 3–345（343 aa）
链 C 3–345（343 aa）
链 D 3–345（343 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Samples were frozen with the SPT Labtech chameleon
分辨率 2.34 Å
11NO Rabbit muscle Aldolase (D2 symmetry) determined using the SPT Labtech chameleon in the presence of 1x SurfACT 提交 2026-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 3–345（343 aa）
链 B 3–345（343 aa）
链 C 3–345（343 aa）
链 D 3–345（343 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
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cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Samples were frozen with the SPT Labtech chameleon
分辨率 2.10 Å
11NP Rabbit muscle Aldolase (C1 symmetry) determined using the SPT Labtech chameleon (gold-coated grids) in the presence of 1x SurfACT 提交 2026-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 3–345（343 aa）
链 B 3–345（343 aa）
链 C 3–345（343 aa）
链 D 3–345（343 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Samples were frozen with the SPT Labtech chameleon
分辨率 2.43 Å
11NR Rabbit muscle Aldolase (D2 symmetry) determined using the SPT Labtech chameleon (gold-coated grids) in the presence of 1x SurfACT 提交 2026-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 3–345（343 aa）
链 B 3–345（343 aa）
链 C 3–345（343 aa）
链 D 3–345（343 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Samples were frozen with the SPT Labtech chameleon
分辨率 2.17 Å
11NT Rabbit muscle Aldolase (C1 symmetry) determined using the TFS Vitrobot Mark IV in the presence of 0x SurfACT 提交 2026-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 3–345（343 aa）
链 B 3–345（343 aa）
链 C 3–345（343 aa）
链 D 3–345（343 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Samples were frozen with the TFS Vitrobot Mark IV
分辨率 2.25 Å
11NU Rabbit muscle Aldolase (D2 symmetry) determined using the TFS Vitrobot Mark IV in the presence of 0x SurfACT 提交 2026-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 3–345（343 aa）
链 B 3–345（343 aa）
链 C 3–345（343 aa）
链 D 3–345（343 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Samples were frozen with the TFS Vitrobot Mark IV
分辨率 1.97 Å
11NW Rabbit muscle Aldolase (C1 symmetry) determined using the TFS Vitrobot Mark IV in the presence of 1x SurfACT 提交 2026-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 3–345（343 aa）
链 B 3–345（343 aa）
链 C 3–345（343 aa）
链 D 3–345（343 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Samples were frozen with the TFS Vitrobot Mark IV
分辨率 2.16 Å
11NX Rabbit muscle Aldolase (D2 symmetry) determined using the TFS Vitrobot Mark IV in the presence of 1x SurfACT 提交 2026-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 3–345（343 aa）
链 B 3–345（343 aa）
链 C 3–345（343 aa）
链 D 3–345（343 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Samples were frozen with the TFS Vitrobot Mark IV
分辨率 1.98 Å
11OB Rabbit muscle Aldolase (C1 symmetry) determined using a manually-operated plunging device in the presence of 0.25x SurfACT 提交 2026-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 3–345（343 aa）
链 B 3–345（343 aa）
链 C 3–345（343 aa）
链 D 3–345（343 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Samples were frozen using a manually-operated plunging device
分辨率 2.38 Å
11OC Rabbit muscle Aldolase (D2 symmetry) determined using a manually-operated plunging device in the presence of 0.25x SurfACT 提交 2026-03-05 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 3–345（343 aa）
链 B 3–345（343 aa）
链 C 3–345（343 aa）
链 D 3–345（343 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE-PROPANE；Samples were frozen using a manually-operated plunging device
分辨率 2.18 Å
1ADO FRUCTOSE 1,6-BISPHOSPHATE ALDOLASE FROM RABBIT MUSCLE 提交 1996-12-02 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–363（363 aa）
链 B 1–363（363 aa）
链 C 1–363（363 aa）
链 D 1–363（363 aa）
未记录 13P 1,3-DIHYDROXYACETONEPHOSPHATE × 2 SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；RABBIT MUSCLE ALDOLASE WAS CRYSTALLIZED FROM A 42% SATURATED AMMONIUM SULFATE SOLUTION, pH 7.5
分辨率 1.90 Å R-free 0.203
1EWD FRUCTOSE 1,6-BISPHOSPHATE ALDOLASE FROM RABBIT MUSCLE 提交 2000-04-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–363（363 aa）
链 B 1–363（363 aa）
链 C 1–363（363 aa）
链 D 1–363（363 aa）
突变：K107M 突变：K107M 突变：K107M 突变：K107M 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 SMALL TUBES；pH 7.4；293 K；Ammonium sulfate 43%, EDTA 5mM, TRIETHYLAMINE 100mM, pH 7.4, SMALL TUBES, temperature 293K
分辨率 2.46 Å R-free 0.234
1EWE Fructose 1,6-Bisphosphate Aldolase from Rabbit Muscle 提交 2000-04-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–363（363 aa）
链 B 1–363（363 aa）
链 C 1–363（363 aa）
链 D 1–363（363 aa）
突变：K107M 突变：K107M 突变：K107M 突变：K107M SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 SMALL TUBES；pH 7.4；293 K；Ammonium sulfate, 43 percent 5mM EDTA, pH 7.4, SMALL TUBES, temperature 293K
分辨率 2.60 Å R-free 0.237
1EX5 FRUCTOSE 1,6-BISPHOSPHATE ALDOLASE FROM RABBIT MUSCLE 提交 2000-04-25 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–363（363 aa）
链 B 1–363（363 aa）
链 C 1–363（363 aa）
链 D 1–363（363 aa）
突变：E187A 突变：E187A 突变：E187A 突变：E187A 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 SMALL TUBES；pH 7.4；293 K；40% ammonium sulphate, 5mM EDTA, pH 7.4, SMALL TUBES, temperature 293K
分辨率 2.20 Å R-free 0.229
1J4E FRUCTOSE-1,6-BISPHOSPHATE ALDOLASE COVALENTLY BOUND TO THE SUBSTRATE DIHYDROXYACETONE PHOSPHATE 提交 2001-09-19 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–363（363 aa）
链 B 1–363（363 aa）
链 C 1–363（363 aa）
链 D 1–363（363 aa）
突变：C72A, C239A, C289A, C338A 突变：C72A, C239A, C289A, C338A 突变：C72A, C239A, C289A, C338A 突变：C72A, C239A, C289A, C338A 13P 1,3-DIHYDROXYACETONEPHOSPHATE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.4；pH 7.4
分辨率 2.65 Å R-free 0.249
1ZAH Fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle 提交 2005-04-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–363（363 aa）
链 B 1–363（363 aa）
链 C 1–363（363 aa）
链 D 1–363（363 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；sodium HEPES, PEG 4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
分辨率 1.80 Å R-free 0.205
1ZAI Fructose-1,6-bisphosphate Schiff base intermediate in FBP aldolase from rabbit muscle 提交 2005-04-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–363（363 aa）
链 B 1–363（363 aa）
链 C 1–363（363 aa）
链 D 1–363（363 aa）
未记录 2FP 1,6-FRUCTOSE DIPHOSPHATE (LINEAR FORM) × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；sodium HEPES, PEG 4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
分辨率 1.76 Å R-free 0.190
1ZAJ Fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle in complex with mannitol-1,6-bisphosphate, a competitive inhibitor 提交 2005-04-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–363（363 aa）
链 B 1–363（363 aa）
链 C 1–363（363 aa）
链 D 1–363（363 aa）
未记录 M2P D-MANNITOL-1,6-DIPHOSPHATE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；sodium HEPES, PEG 4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
分辨率 1.89 Å R-free 0.204
1ZAL Fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle in complex with partially disordered tagatose-1,6-bisphosphate, a weak competitive inhibitor 提交 2005-04-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–363（363 aa）
链 B 1–363（363 aa）
链 C 1–363（363 aa）
链 D 1–363（363 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 8 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；sodium HEPES, PEG 4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
分辨率 1.89 Å R-free 0.211
2OT0 Fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle in complex with a C-terminal peptide of Wiskott-Aldrich syndrome protein 提交 2007-02-07 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 2–364（363 aa）
链 B 2–364（363 aa）
链 C 2–364（363 aa）
链 D 2–364（363 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；HEPES, MgCl2, PEG 550 MME, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.05 Å R-free 0.200
2OT1 Fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle in complex with naphthol AS-E phosphate, a competitive inhibitor 提交 2007-02-07 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–364（363 aa）
链 B 2–364（363 aa）
链 C 2–364（363 aa）
链 D 2–364（363 aa）
未记录 N3P N-(4-CHLOROPHENYL)-3-(PHOSPHONOOXY)NAPHTHALENE-2-CARBOXAMIDE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；HEPES, PEG 4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
分辨率 2.05 Å R-free 0.197
2QUT Dihydroxyacetone phosphate enamine intermediate in fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle 提交 2007-08-06 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–364（363 aa）
链 B 2–364（363 aa）
链 C 2–364（363 aa）
链 D 2–364（363 aa）
未记录 13P 1,3-DIHYDROXYACETONEPHOSPHATE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；sodium HEPES, PEG 4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
分辨率 1.88 Å R-free 0.191
2QUU Dihydroxyacetone phosphate Schiff base intermediate in mutant fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle 提交 2007-08-06 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–364（363 aa）
链 B 2–364（363 aa）
链 C 2–364（363 aa）
链 D 2–364（363 aa）
突变：K146M 突变：K146M 突变：K146M 突变：K146M 13P 1,3-DIHYDROXYACETONEPHOSPHATE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；sodium HEPES, PEG 4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
分辨率 1.98 Å R-free 0.195
2QUV Phosphate ions in fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle 提交 2007-08-06 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–364（363 aa）
链 B 2–364（363 aa）
链 C 2–364（363 aa）
链 D 2–364（363 aa）
未记录 PO4 PHOSPHATE ION × 7 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；sodium HEPES, PEG 4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
分辨率 2.22 Å R-free 0.191
3B8D Fructose 1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle 提交 2007-11-01 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–364（363 aa）
链 B 2–364（363 aa）
链 C 2–364（363 aa）
链 D 2–364（363 aa）
突变：E188Q 突变：E188Q 突变：E188Q 突变：E188Q SO4 SULFATE ION × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 SMALL TUBES；pH 7.4；293 K；40% ammonium sulphate 5mM EDTA, 100mM triethylamine, pH 7.4, SMALL TUBES, temperature 293K
分辨率 2.00 Å R-free 0.238
3BV4 Crystal structure of a rabbit muscle fructose-1,6-bisphosphate aldolase A dimer variant 提交 2008-01-04 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 5–344（340 aa）
突变：D128V SO4 SULFATE ION × 12 13P 1,3-DIHYDROXYACETONEPHOSPHATE × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 5.1；291 K；0.2 M ammonium sulfate, 25% PEG 2K monomethyl ether, 100 mM sodium acetate, pH 5.1, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 291K
分辨率 1.70 Å R-free 0.215
3DFN D33N mutant fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle 提交 2008-06-12 突变/修饰不同 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–364（363 aa）
链 B 2–364（363 aa）
链 C 2–364（363 aa）
链 D 2–364（363 aa）
突变：D33N 突变：D33N 突变：D33N 突变：D33N 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；sodium HEPES, PEG 4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
分辨率 1.86 Å R-free 0.188
3DFO Dihydroxyacetone phosphate Schiff base and enamine intermediates in D33N mutant fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle 提交 2008-06-12 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–364（363 aa）
链 B 2–364（363 aa）
链 C 2–364（363 aa）
链 D 2–364（363 aa）
突变：D33N 突变：D33N 突变：D33N 突变：D33N 13P 1,3-DIHYDROXYACETONEPHOSPHATE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.5；296 K；sodium HEPES, PEG 4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K, pH 7.50
分辨率 1.94 Å R-free 0.199
3DFP Phosphate ions in D33N mutant fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle 提交 2008-06-12 突变/修饰不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–364（363 aa）
链 B 2–364（363 aa）
链 C 2–364（363 aa）
链 D 2–364（363 aa）
突变：D33N 突变：D33N 突变：D33N 突变：D33N PO4 PHOSPHATE ION × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；sodium HEPES, PEG 4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
分辨率 2.05 Å R-free 0.214
3DFQ D33S mutant fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle 提交 2008-06-12 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–364（363 aa）
链 B 2–364（363 aa）
链 C 2–364（363 aa）
链 D 2–364（363 aa）
突变：D33S 突变：D33S 突变：D33S 突变：D33S 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；sodium HEPES, PEG 4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
分辨率 1.82 Å R-free 0.188
3DFS Dihydroxyacetone phosphate Schiff base intermediate in D33S mutant fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle 提交 2008-06-12 配体/离子不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–364（363 aa）
链 B 2–364（363 aa）
链 C 2–364（363 aa）
链 D 2–364（363 aa）
突变：D33S 突变：D33S 突变：D33S 突变：D33S 13P 1,3-DIHYDROXYACETONEPHOSPHATE × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；sodium HEPES, PEG 4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
分辨率 2.03 Å R-free 0.187
3LGE Crystal structure of rabbit muscle aldolase-SNX9 LC4 complex 提交 2010-01-20 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 8 PDB 声明：octameric
链 A 2–364（363 aa）
链 B 2–364（363 aa）
链 C 2–364（363 aa）
链 D 2–364（363 aa）
未记录 未记录非水小分子 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；PEG-MME 550, MgCl2, pH 7, Vapor Diffusion, Hanging drop, temperature 277K
分辨率 2.20 Å R-free 0.189
3TU9 Crystal structure of rabbit muscle aldolase bound with 5-O-methyl mannitol 1,6-phosphate 提交 2011-09-16 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–364（363 aa）
链 B 2–364（363 aa）
链 C 2–364（363 aa）
链 D 2–364（363 aa）
未记录 5MM 2-O-methyl-1,6-di-O-phosphono-D-mannitol × 4 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；17.5% PEG4000, 0.1 M HEPES sodium, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K
分辨率 2.09 Å R-free 0.201
5F4X Fructose-1,6-bisphosphate aldolase K229M mutant from rabbit muscle 提交 2015-12-03 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–364（363 aa）
链 B 2–364（363 aa）
链 C 2–364（363 aa）
链 D 2–364（363 aa）
突变：K229M 突变：K229M 突变：K229M 突变：K229M GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；Sodium HEPES, PEG 4000, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 296K
分辨率 1.84 Å R-free 0.174
5TLE Fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle in complex with the inhibitor 2-phosphate-naphthalene 6-bisphosphonate 提交 2016-10-11 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–364（363 aa）
链 B 2–364（363 aa）
链 C 2–364（363 aa）
链 D 2–364（363 aa）
未记录 RD1 {[6-(phosphonooxy)naphthalen-2-yl]methylene}bis(phosphonic acid) × 4 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；0.1M Sodium HEPES, 17.5% PEG 4000
分辨率 1.58 Å R-free 0.158
5TLH Fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle in complex with the inhibitor 2-naphthol 6-bisphosphonate 提交 2016-10-11 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–364（363 aa）
链 B 2–364（363 aa）
链 C 2–364（363 aa）
链 D 2–364（363 aa）
未记录 RD2 [(6-hydroxynaphthalen-2-yl)methylene]bis(phosphonic acid) × 4 MDN METHYLENEDIPHOSPHONIC ACID × 4 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；0.1M Sodium HEPES, 17.5% PEG 4000
分辨率 2.20 Å R-free 0.188
5TLW Fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle in complex with the inhibitor 1-phosphate-benzene 4-bisphosphonate 提交 2016-10-12 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–364（363 aa）
链 B 2–364（363 aa）
链 C 2–364（363 aa）
链 D 2–364（363 aa）
未记录 RD3 {[4-(phosphonooxy)phenyl]methylene}bis(phosphonic acid) × 4 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；0.1M Sodium HEPES, 17.5% PEG 4000
分辨率 2.29 Å R-free 0.191
5TLZ Fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle in complex with the inhibitor naphthalene 2,6-bisphosphate 提交 2016-10-12 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–364（363 aa）
链 B 2–364（363 aa）
链 C 2–364（363 aa）
链 D 2–364（363 aa）
未记录 N26 naphthalene-2,6-diyl bis[dihydrogen (phosphate)] × 4 GOL GLYCEROL × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；296 K；0.1M Sodium HEPES, 17.5% PEG 4000
分辨率 1.97 Å R-free 0.166
5VY5 Rabbit muscle aldolase using 200keV 提交 2017-05-24 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–364（363 aa）
链 B 2–364（363 aa）
链 C 2–364（363 aa）
链 D 2–364（363 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 uL of sample/grid was manually blotted for 4 seconds prior to immediate plunge-freezing in liquid nitrogen-cooled ethane.
分辨率 2.60 Å
6ALD RABBIT MUSCLE ALDOLASE A/FRUCTOSE-1,6-BISPHOSPHATE COMPLEX 提交 1998-12-23 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–363（363 aa）
链 B 1–363（363 aa）
链 C 1–363（363 aa）
链 D 1–363（363 aa）
突变：K146A 突变：K146A 突变：K146A 突变：K146A 2FP 1,6-FRUCTOSE DIPHOSPHATE (LINEAR FORM) × 2 X-RAY DIFFRACTION
X-ray结晶条件 pH 7.4；pH 7.4
分辨率 2.30 Å R-free 0.274
6MWQ Single particle cryoEM structure of a DARPin-aldolase platform in complex with GFP 提交 2018-10-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 A 16–348（333 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were frozen on a manual plunger at the Scripps Research Institute Core Microscopy Facility in a 4 degrees C cold room humidified to >95%.
分辨率 3.00 Å
6MWQ Single particle cryoEM structure of a DARPin-aldolase platform in complex with GFP 提交 2018-10-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 2 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 B 16–348（333 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were frozen on a manual plunger at the Scripps Research Institute Core Microscopy Facility in a 4 degrees C cold room humidified to >95%.
分辨率 3.00 Å
6MWQ Single particle cryoEM structure of a DARPin-aldolase platform in complex with GFP 提交 2018-10-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 3 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 C 16–348（333 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were frozen on a manual plunger at the Scripps Research Institute Core Microscopy Facility in a 4 degrees C cold room humidified to >95%.
分辨率 3.00 Å
6MWQ Single particle cryoEM structure of a DARPin-aldolase platform in complex with GFP 提交 2018-10-30 构建体不同 突变/修饰不同 聚集状态不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 4 蛋白异源复合物 异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric
链 D 16–348（333 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 8
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；Grids were frozen on a manual plunger at the Scripps Research Institute Core Microscopy Facility in a 4 degrees C cold room humidified to >95%.
分辨率 3.00 Å
6V20 Rabbit muscle aldolase determined using single-particle cryo-EM at 200 keV 提交 2019-11-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 3–345（343 aa）
链 B 3–345（343 aa）
链 C 3–345（343 aa）
链 D 3–345（343 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE；3 uL of sample/grid was manually blotted for 4 seconds prior to immediate plunge-freezing in liquid nitrogen-cooled ethane.
分辨率 2.13 Å
7K9L Aldolase, rabbit muscle (no beam-tilt refinement) 提交 2020-09-29 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–364（363 aa）
链 B 2–364（363 aa）
链 C 2–364（363 aa）
链 D 2–364（363 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 4.90 Å
7K9X Aldolase, rabbit muscle (beam-tilt refinement x1) 提交 2020-09-29 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–364（363 aa）
链 B 2–364（363 aa）
链 C 2–364（363 aa）
链 D 2–364（363 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.80 Å
7KA2 Aldolase, rabbit muscle (beam-tilt refinement x2) 提交 2020-09-29 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–364（363 aa）
链 B 2–364（363 aa）
链 C 2–364（363 aa）
链 D 2–364（363 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.60 Å
7KA3 Aldolase, rabbit muscle (beam-tilt refinement x3) 提交 2020-09-29 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–364（363 aa）
链 B 2–364（363 aa）
链 C 2–364（363 aa）
链 D 2–364（363 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.30 Å
7KA4 Aldolase, rabbit muscle (beam-tilt refinement x4) 提交 2020-09-29 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–364（363 aa）
链 B 2–364（363 aa）
链 C 2–364（363 aa）
链 D 2–364（363 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.80 Å
7VDC 3.28 A structure of the rabbit muscle aldolase 提交 2021-09-06 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–364（364 aa）
链 B 1–364（364 aa）
链 C 1–364（364 aa）
链 D 1–364（364 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.28 Å
8EHG Rabbit muscle aldolase determined using single-particle cryo-EM with Apollo camera. 提交 2022-09-14 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 1–364（364 aa）
链 B 1–364（364 aa）
链 C 1–364（364 aa）
链 D 1–364（364 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；DTT are added freshly before use.
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.24 Å
8EW2 Cryo-EM structure of Aldolase embedded in crystalline ice 提交 2022-10-21 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–364（363 aa）
链 B 2–364（363 aa）
链 C 2–364（363 aa）
链 D 2–364（363 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5；20 mM HEPES pH 7.5, 50-mM NaCl
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 3.10 Å
8TWK Cryo-EM structure of Aldolase collected by EPU on Glacios at 2.6 Angstrom resolution 提交 2023-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–345（344 aa）
链 B 2–345（344 aa）
链 C 2–345（344 aa）
链 D 2–345（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å
8TWL Cryo-EM structure of Aldolase collected by SerialEM on Glacios at 2.7 Angstrom resolution 提交 2023-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–345（344 aa）
链 B 2–345（344 aa）
链 C 2–345（344 aa）
链 D 2–345（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.70 Å
8TWM Cryo-EM structure of Aldolase collected by Leginon on Glacios at 2.6 Angstrom resolution 提交 2023-08-21 构建体不同 突变/修饰不同 配体/离子不同 实验方法不同 实验环境不同 结构质量不同 Assembly 1 蛋白同源多聚体 同源多聚体；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric
链 A 2–345（344 aa）
链 B 2–345（344 aa）
链 C 2–345（344 aa）
链 D 2–345（344 aa）
未记录 未记录非水小分子 ELECTRON MICROSCOPY
cryo-EM缓冲液 pH 7.5
cryo-EM玻璃化条件 冷冻剂 ETHANE
分辨率 2.60 Å

共 59 个其他 PDB 条目、62 个 assembly。 打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ALDOA_RABIT
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–363； UniProt 2–364 作者链 B； PDB构建体 1–363； UniProt 2–364 作者链 C； PDB构建体 1–363； UniProt 2–364 作者链 D； PDB构建体 1–363； UniProt 2–364

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

SAXS profile for 3dft

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

P(r) distribution for 3dft
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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3dft
沉积日期 deposition_date2008-06-12
结构标题 titlePhosphate ions in D33S mutant fructose-1,6-bisphosphate aldolase from rabbit muscle
关键词 keywordsaldolase, mutant, phosphate, ion, Acetylation, Glycolysis, Lyase, Phosphoprotein, Schiff base; LYASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier35.31 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron34.50 Å
零角强度 I(0) i0365004000.00
分子量 molecular_weight153320.0 kDa
排除体积 excluded_volume191540 ų
包络体积 envelope_volume231360 ų
水化壳体积 shell_volume55062 ų
包络直径 envelope_diameter114.9 Å
壳层 Rg shell_rg41.98 Å
包络 Rg envelope_rg34.52 Å
形状 Rg shape_rg34.51 Å
总 Rg total_rg34.95 Å
总原子数 total_atoms10774
残基数 n_residues1412
球谐函数阶数 n_harmonics20
q 范围 q_range— – 0.5000 Å−1
数据点数 n_points101
壳层类型 shell_typedirectional
溶剂电子密度 solvent_density0.3340 e/ų
壳层衬度 contrast_shell0.0300 e/ų
CRYSOL 版本 crysol_version4.1.3
▼

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax112.2 Å
Rg (实空间) rg_real35.17 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error0.68 Å
I(0) (实空间) i0_real3.6500e+08
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error5.8260e+06
Rg (倒空间) rg_reciprocal35.26 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal365000000.0000
解质量估计 total_estimate0.8970
解质量评级 solution_quality GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks1
主峰位置 r_peak_primary42.4 Å
偏度 Skewness skewness0.186
峰度 Kurtosis kurtosis-0.492
角度范围 angular_range— – 0.2250 Å−1
当前正则化参数 α current_alpha0.0001
最高正则化参数 α highest_alpha66330000.0000
实空间数据点数 n_real_points46
GNOM 版本 gnom_version4.1.3
质量判据 quality_criteria AN1: 0.000; Oscil: 0.921; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.994; Smooth: 0.900
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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd3dfta_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamilyc.1.10 — Aldolase
家族 Family familyc.1.10.1 — Class I aldolase
结构域编号 domain_idd3dftb_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamilyc.1.10 — Aldolase
家族 Family familyc.1.10.1 — Class I aldolase
结构域编号 domain_idd3dftc_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamilyc.1.10 — Aldolase
家族 Family familyc.1.10.1 — Class I aldolase
结构域编号 domain_idd3dftd_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.1 — TIM beta/alpha-barrel
超家族 Superfamily superfamilyc.1.10 — Aldolase
家族 Family familyc.1.10.1 — Class I aldolase

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id3dftA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily70 — Aldolase class I
结构域编号 domain_id3dftB00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily70 — Aldolase class I
结构域编号 domain_id3dftC00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily70 — Aldolase class I
结构域编号 domain_id3dftD00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture20 — Alpha-Beta Barrel
拓扑 Topology topology20 — TIM Barrel
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily70 — Aldolase class I
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8. 引用文献 (1)

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9. 文件与曲线 (10)