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3dh4

Crystal Structure of Sodium/Sugar symporter with bound Galactose from vibrio parahaemolyticus

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Sodium/glucose cotransporter

Vibrio parahaemolyticus

UniProt P96169

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 4 beta-D-galactopyranose × 4 ERBIUM (III) ION × 4 SODIUM ION × 4 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 beta-D-galactopyranose × 2 ERBIUM (III) ION × 2 SODIUM ION × 2 与蛋白数一致
3 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 beta-D-galactopyranose × 2 ERBIUM (III) ION × 2 SODIUM ION × 2 与蛋白数一致
4 蛋白单体 单体 蛋白 1 beta-D-galactopyranose × 1 ERBIUM (III) ION × 2 SODIUM ION × 1 与蛋白数一致
5 蛋白单体 单体 蛋白 1 beta-D-galactopyranose × 1 SODIUM ION × 1 与蛋白数一致
6 蛋白单体 单体 蛋白 1 beta-D-galactopyranose × 1 SODIUM ION × 1 与蛋白数一致
7 蛋白单体 单体 蛋白 1 beta-D-galactopyranose × 1 ERBIUM (III) ION × 2 SODIUM ION × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
3dh4 3dh4 3dh4 3dh4

共 4 个 assembly

同源二聚体
2xq2 3dh4 3dh4

共 3 个 assembly

同源四聚体
3dh4

共 1 个 assembly

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物

暂无

查看构建体与数据证据
UniProt名称 SGLT_VIBPA
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 18–514； UniProt 47–543 作者链 B； PDB构建体 18–514； UniProt 47–543 作者链 C； PDB构建体 18–514； UniProt 47–543 作者链 D； PDB构建体 18–514； UniProt 47–543

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3dh4
沉积日期 deposition_date2008-06-16
结构标题 titleCrystal Structure of Sodium/Sugar symporter with bound Galactose from vibrio parahaemolyticus
关键词 keywords;Membrane protein, symporter, sugar transport, SGLT, Ion transport, Membrane, Sodium transport, Symport, Transmembrane, Transport, TRANSPORT PROTEIN ;; TRANSPORT PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3dh4__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3dh4__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3dh4__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）32.94 Å
Rg（电子密度）32.15 Å
总 Rg32.73 Å
原子数7736
残基数1024
排除体积142300 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3dh4__assembly_1__model_1 tetrameric （4） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 3dh4__assembly_2__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 3dh4__assembly_3__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
4 1 3dh4__assembly_4__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
5 1 3dh4__assembly_5__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
6 1 3dh4__assembly_6__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
7 1 3dh4__assembly_7__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id3dh4A01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology1730 — Sodium/glucose cotransporter
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Sodium/glucose cotransporter
结构域编号 domain_id3dh4B01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology1730 — Sodium/glucose cotransporter
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Sodium/glucose cotransporter
结构域编号 domain_id3dh4C01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology1730 — Sodium/glucose cotransporter
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Sodium/glucose cotransporter
结构域编号 domain_id3dh4D01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology1730 — Sodium/glucose cotransporter
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Sodium/glucose cotransporter
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7. 引用文献 (1)