SAXSdb — 3e2h

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

H-2 class I histocompatibility antigen, L-D alpha chain

Mus musculus

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	QL9 PEPTIDE × 1 T-cell receptor alpha chain V region PHDS58 × 1 （P01738） M67 TCR beta chain × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	HA1L_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–175； UniProt 25–199

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58

Mus musculus

UniProt P01738

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	H-2 class I histocompatibility antigen, L-D alpha chain × 1 （P01897） QL9 PEPTIDE × 1 M67 TCR beta chain × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	TVA1_MOUSE
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–109； UniProt 22–130

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3e2h
沉积日期 deposition_date	2008-08-05
结构标题 title	Structure of the m67 high-affinity mutant of the 2C TCR in complex with Ld/QL9
关键词 keywords	;TCR, MHC, cross-reactivity, high affinity, Glycoprotein, Immune response, Membrane, MHC I, Phosphoprotein, Transmembrane, Immunoglobulin domain, Receptor, IMMUNE SYSTEM ;; IMMUNE SYSTEM
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3e2h__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3e2h__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3e2h__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	23.09 Å
Rg（电子密度）	22.03 Å
总 Rg	23.05 Å
原子数	3227
残基数	403
排除体积	56524 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3e2h__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	H-2 class I histocompatibility antigen, L-D alpha chain
分子量 formula_weight	20541.6 kDa
突变 mutation	F8Y, V12T, P15R, I23T, N30D, A49V, I66V, R97W, K131R
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3227

GPHSMRYYETATSRRGLGEPRYTSVGYVDDKEFVRFDSDAENPRYEPQVPWMEQEGPEYWERITQVAKGQEQWFRVNLRTLLGYYNQSAGGTHTLQRMYGCDVGSDGRLLRGYEQFAYDGCDYIALNEDLRTWTAADMAAQITRRKWEQAGAAEYYRAYLEGECVEWLHRYLKNG

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	QL9 PEPTIDE
分子量 formula_weight	1063.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Q

QLSPFPFDL

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	T-cell receptor alpha chain V region PHDS58
分子量 formula_weight	12211.8 kDa
突变 mutation	L43P, W82R, G99L, F100E, A101R, S102P, A103Y
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

SVTQPDARVTVSEGASLQLRCKYSYSATPYLFWYVQYPRQGPQLLLKYYSGDPVVQGVNGFEAEFSKSNSSFHLRKASVHRSDSAVYFCAVSLERPYLTFGSGTKVIVL

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	M67 TCR beta chain
分子量 formula_weight	11910.0 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C

AAVTQSPRNKVAVTGEKVTLSCNQTNNHNNMYWYRQDTGHELRLIYYSYGAGSTEKGDIPDGYKASRPSQENFSLTLESATPSQTSVYFCASGGGGTLYFGAGTRLSVLS

来源 Source

来源生物 organism	Mus musculus
通用名 common_name	mouse
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	10090
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id	3e2hA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	500 — Murine Class I Major Histocompatibility Complex, H2-DB; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — MHC class I-like antigen recognition-like

结构域编号 domain_id	3e2hB00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

结构域编号 domain_id	3e2hC00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Immunoglobulins

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晶胞边长 a length_a	112.603 Å
晶胞边长 b length_b	112.603 Å
晶胞边长 c length_c	272.451 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 64 2 2
空间群编号 int_tables_number	181
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.800 Å
最低分辨率 resolution_low	50.000 Å
R 因子 r_factor	—
R_work r_work	0.2230
R_free r_free	0.2760

Structure of the m67 high-affinity mutant of the 2C TCR in complex with Ld/QL9

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

H-2 class I histocompatibility antigen, L-D alpha chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3e2h__assembly_1__model_1

3e2h__assembly_1__model_1 | I(q)

3e2h__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)

Structure of the m67 high-affinity mutant of the 2C TCR in complex with Ld/QL9

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

H-2 class I histocompatibility antigen, L-D alpha chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

T-cell receptor alpha chain V region PHDS58

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3e2h__assembly_1__model_1

3e2h__assembly_1__model_1 | I(q)

3e2h__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 4 Entity 4 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

7. 引用文献 (1)