3e43

Q138F HincII bound to GTTAAC and cocrystallized with 2.5 mM MgCl2

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Type-2 restriction enzyme HindII

Haemophilus influenzae

UniProt P44413

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 同源多聚体 蛋白 2 DNA 2 5'-D(*DGP*DCP*DCP*DGP*DGP*DTP*DTP*DAP*DAP*DCP*DCP*DGP*DGP*DC)-3' × 2 UNKNOWN ATOM OR ION × 2 water × 4 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 T2D2_HAEIN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–257; UniProt 2–258 作者链 B; PDB构建体 1–257; UniProt 2–258

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3e43
沉积日期 deposition_date2008-08-08
结构标题 titleQ138F HincII bound to GTTAAC and cocrystallized with 2.5 mM MgCl2
关键词 keywordsprotein-DNA complex, endonuclease, indirect readout, Hydrolase, Nuclease, Restriction system, HYDROLASE-DNA COMPLEX; HYDROLASE/DNA
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3e43__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 排除 — —
排除原因: 来源记录无法明确判定原子或离子的元素,因此不能可靠计算。
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd3e43a_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.52 — Restriction endonuclease-like
超家族 Superfamily superfamilyc.52.1 — Restriction endonuclease-like
家族 Family familyc.52.1.19 — Restriction endonuclease HincII
结构域编号 domain_idd3e43b_
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.52 — Restriction endonuclease-like
超家族 Superfamily superfamilyc.52.1 — Restriction endonuclease-like
家族 Family familyc.52.1.19 — Restriction endonuclease HincII

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id3e43A00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology600 — ECO RV Endonuclease; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — DNA mismatch repair MutH/Restriction endonuclease, type II
结构域编号 domain_id3e43B00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology600 — ECO RV Endonuclease; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — DNA mismatch repair MutH/Restriction endonuclease, type II
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7. 引用文献 (1)