3e6q

Putative 5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate isomerase from Pseudomonas aeruginosa.

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

putative 5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate isomerase

Pseudomonas aeruginosa

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 3	1,2-ETHANEDIOL × 3 FORMIC ACID × 5 ACETATE ION × 1 SODIUM ION × 2 GLYCEROL × 2 water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 3	1,2-ETHANEDIOL × 3 FORMIC ACID × 2 ACETATE ION × 1 SODIUM ION × 1 GLYCEROL × 2 water × 3	与蛋白数一致
3	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 3	1,2-ETHANEDIOL × 6 FORMIC ACID × 5 SODIUM ION × 1 GLYCEROL × 2 water × 3	与蛋白数一致
4	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 3	1,2-ETHANEDIOL × 5 FORMIC ACID × 3 GLYCEROL × 1 IMIDAZOLE × 2 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q9I2D8_PSEAE
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 22–144； UniProt 1–123 作者链 B； PDB构建体 22–144； UniProt 1–123 作者链 C； PDB构建体 22–144； UniProt 1–123 作者链 D； PDB构建体 22–144； UniProt 1–123 作者链 E； PDB构建体 22–144； UniProt 1–123 作者链 F； PDB构建体 22–144； UniProt 1–123 作者链 G； PDB构建体 22–144； UniProt 1–123 作者链 H； PDB构建体 22–144； UniProt 1–123 作者链 I； PDB构建体 22–144； UniProt 1–123 作者链 J； PDB构建体 22–144； UniProt 1–123 作者链 K； PDB构建体 22–144； UniProt 1–123 作者链 L； PDB构建体 22–144； UniProt 1–123

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3e6q
沉积日期 deposition_date	2008-08-15
结构标题 title	Putative 5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate isomerase from Pseudomonas aeruginosa.
关键词 keywords	structural genomics, APC7683, isomerase, PSI-2, Protein Structure Initiative, Midwest Center for Structural Genomics, MCSG; ISOMERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3e6q__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3e6q__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3e6q__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	20.95 Å
Rg（电子密度）	19.83 Å
总 Rg	20.54 Å
原子数	2912
残基数	377
排除体积	51461 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3e6q__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`3e6q__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`3e6q__assembly_3__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
4	1	`3e6q__assembly_4__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	putative 5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate isomerase
分子量 formula_weight	15878.2 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	12

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F,G,H,I,J,K,L
原子数 atom_count	14344

MGSSHHHHHHSSGRENLYFQGMPHLVIEATANLRLETSPGELLEQANAALFASGQFGEADIKSRFVTLEAYRQGTAAVERAYLHACLSILDGRDAATRQALGESLCEVLAGAVAGGGEEGVQVSVEVREMERASYAKRVVARQRGS

来源 Source

来源生物 organism	Pseudomonas aeruginosa
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	287
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	17

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	FORMIC ACID
分子量 formula_weight	46.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	15

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	ACETATE ION
分子量 formula_weight	59.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	SODIUM ION
分子量 formula_weight	23.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

实体 7 Entity 7 non-polymer

描述 description	IMIDAZOLE
分子量 formula_weight	69.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 8 Entity 8 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	1863

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id	3e6qA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	429 — Macrophage Migration Inhibitory Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Macrophage Migration Inhibitory Factor

结构域编号 domain_id	3e6qB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	429 — Macrophage Migration Inhibitory Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Macrophage Migration Inhibitory Factor

结构域编号 domain_id	3e6qC00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	429 — Macrophage Migration Inhibitory Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Macrophage Migration Inhibitory Factor

结构域编号 domain_id	3e6qD00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	429 — Macrophage Migration Inhibitory Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Macrophage Migration Inhibitory Factor

结构域编号 domain_id	3e6qE00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	429 — Macrophage Migration Inhibitory Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Macrophage Migration Inhibitory Factor

结构域编号 domain_id	3e6qF00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	429 — Macrophage Migration Inhibitory Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Macrophage Migration Inhibitory Factor

结构域编号 domain_id	3e6qG00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	429 — Macrophage Migration Inhibitory Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Macrophage Migration Inhibitory Factor

结构域编号 domain_id	3e6qH00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	429 — Macrophage Migration Inhibitory Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Macrophage Migration Inhibitory Factor

结构域编号 domain_id	3e6qI00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	429 — Macrophage Migration Inhibitory Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Macrophage Migration Inhibitory Factor

结构域编号 domain_id	3e6qJ00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	429 — Macrophage Migration Inhibitory Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Macrophage Migration Inhibitory Factor

结构域编号 domain_id	3e6qK00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	429 — Macrophage Migration Inhibitory Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Macrophage Migration Inhibitory Factor

结构域编号 domain_id	3e6qL00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	429 — Macrophage Migration Inhibitory Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Macrophage Migration Inhibitory Factor

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晶胞边长 a length_a	172.796 Å
晶胞边长 b length_b	145.243 Å
晶胞边长 c length_c	122.252 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	134.91 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	48

空间群 space_group	C 1 2 1
空间群编号 int_tables_number	5
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.750 Å
最低分辨率 resolution_low	45.000 Å
R 因子 r_factor	0.1370
R_work r_work	0.1360
R_free r_free	0.1640

Putative 5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate isomerase from Pseudomonas aeruginosa.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

putative 5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate isomerase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3e6q__assembly_2__model_1

3e6q__assembly_2__model_1 | I(q)

3e6q__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

CATH v4.4 (12 domains)

7. 引用文献 (1)

Putative 5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate isomerase from Pseudomonas aeruginosa.

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

putative 5-carboxymethyl-2-hydroxymuconate isomerase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3e6q__assembly_2__model_1

3e6q__assembly_2__model_1 | I(q)

3e6q__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (8)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 non-polymer

实体 8 Entity 8 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

CATH v4.4 (12 domains)

7. 引用文献 (1)