Danio rerio
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | CHOLIC ACID × 4 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| 2 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | CHOLIC ACID × 5 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | Q6IMW5_DANRE |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 5–134； UniProt 2–131 作者链 B； PDB构建体 5–134； UniProt 2–131 |
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| 条目编号 entry_id | 3em0 |
| 沉积日期 deposition_date | 2008-09-23 |
| 结构标题 title | Crystal structure of Zebrafish Ileal Bile Acid-Bindin Protein complexed with cholic acid (crystal form B). |
| 关键词 keywords | Ileal bile acid-binding protein, zebrafish (Danio rerio), cholic acid, Lipid-binding, Transport, LIPID BINDING PROTEIN; LIPID BINDING PROTEIN |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 15.80 Å |
| Rg（电子密度） | 14.28 Å |
| 总 Rg | 15.66 Å |
| 原子数 | 1127 |
| 残基数 | 131 |
| 排除体积 | 20620 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d3em0a1 |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.60 — Lipocalins |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.60.1 — Lipocalins |
| 家族 Family family | b.60.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d3em0a2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | d3em0b1 |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.60 — Lipocalins |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.60.1 — Lipocalins |
| 家族 Family family | b.60.1.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d3em0b2 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | d3em0b3 |
| 类 Class class | l — Artifacts |
| 折叠类型 Fold fold | l.1 — Tags |
| 超家族 Superfamily superfamily | l.1.1 — Tags |
| 家族 Family family | l.1.1.1 — Tags |
| 结构域编号 domain_id | 3em0A00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 128 — Lipocalin |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 20 — Calycin beta-barrel core domain |
| 结构域编号 domain_id | 3em0B00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 40 — Beta Barrel |
| 拓扑 Topology topology | 128 — Lipocalin |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 20 — Calycin beta-barrel core domain |