3eqy

Crystal structure of human MDMX in complex with a 12-mer peptide inhibitor

Method: X-RAY DIFFRACTION D_max: 68.4 Å Quality: GOOD

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mdm4 protein

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与共同组分	实验方法与环境	结构质量
1	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 A； UniProt 24–108	片段：UNP residues residues 24-108 突变：Q68A, Q69A, E70A	12-mer peptide inhibitor × 1 GAI GUANIDINE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1M HEPES, 0.8 M sodium phosphate, 0.8 M potassium phosphate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.63 Å R-free 0.169
2	蛋白异源复合物异源复合物蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric（2）与蛋白拷贝数一致	链 B； UniProt 24–108	片段：UNP residues residues 24-108 突变：Q68A, Q69A, E70A	12-mer peptide inhibitor × 1 GAI GUANIDINE × 1 PO4 PHOSPHATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件：VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；0.1M HEPES, 0.8 M sodium phosphate, 0.8 M potassium phosphate, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.63 Å R-free 0.169

数据库中的同蛋白其他状态

以下每一行都是同一 UniProt 蛋白在另一个 PDB 条目中的 biological assembly， “相对当前条目”直接指出证据层面的不同；没有差异标签表示当前已读取字段一致。

其他 PDB	相对当前条目 3EQY	Assembly / 聚集状态	构建体	突变与修饰	配体、离子与非聚合物	实验方法与环境	结构质量
2CR8 Solution structure of the zf-RanBP domain of p53-binding protein Mdm4 提交 2005-05-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 300–339（40 aa）片段：zf-RanBP domain	未记录	ZN ZINC ION × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）120mM；压力 ambient NMR样品组成 0.42mM 13C, 15N-labeled protein; 20mM d-Tris-HCl (pH7.0); 200mM NaCl; 1mM d-DTT; 0.02% NaN3; 0.01mM ZnCl2 \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2MWY Mdmx-p53 提交 2014-12-03	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 23–111（89 aa）片段：SWIB domain residues 23-111	未记录	未记录非水小分子	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 ambient NMR样品组成 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein 1, 1.2 mM protein 2, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2N06 Mdmx-298 提交 2015-03-04	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 23–111（89 aa）片段：UNP residues 23-111	未记录	44Z 4-[[(4S,5R)-5-(4-chlorophenyl)-4-(3-methoxyphenyl)-2-(4-methoxy-2-propan-2-yloxy-phenyl)-4,5-dihydroimidazol-1-yl]carbonyl]piperazin-2-one × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 ambient NMR样品组成 1.0 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] entity_1-1, 1.0 mM SJ298-2, 0.2 mM sodium chloride-3, 0.01 mM DTT-4, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2N0U Mdmx-057 提交 2015-03-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 23–111（89 aa）片段：UNP residues 23-111	未记录	48M 4-[(4S,5R)-4-(3-chlorophenyl)-5-(4-chlorophenyl)-1-(3-oxidanylidenepiperazin-1-yl)carbonyl-4,5-dihydroimidazol-2-yl]-3-propan-2-yloxy-benzenecarbonitrile × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 ambient NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein_1, 0.6 mM protein_2, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2N0W Mdmx-SJ212 提交 2015-03-17	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 23–111（89 aa）片段：UNP residues 23-111	未记录	48L 4-({(4S,5R)-4-(5-bromo-2-fluorophenyl)-5-(4-chlorophenyl)-2-[4-methoxy-2-(propan-2-yloxy)phenyl]-4,5-dihydro-1H-imidazol-1-yl}carbonyl)piperazin-2-one × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 ambient NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein_1, 0.6 mM protein_2, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2N14 Mdmx-295 提交 2015-03-20	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 23–111（89 aa）片段：UNP residues 23-111	未记录	49H 4-({(4S,5R)-4-(3-chlorophenyl)-5-(4-chlorophenyl)-2-[4-methoxy-2-(propan-2-yloxy)phenyl]-4,5-dihydro-1H-imidazol-1-yl}carbonyl)piperazin-2-one × 1	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 6.5；298 K；离子强度（mmCIF原始值）200；压力 ambient NMR样品组成 0.5 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] protein_1, 0.6 mM protein_2, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
2VJE Crystal Structure of the MDM2-MDMX RING Domain Heterodimer 提交 2007-12-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 428–490（63 aa）片段：RESIDUES 428-490	未记录	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；1.8 M NH4(SO4)2, 0.5 M NACL, 0.1 M NA CITRATE, PH 6.5	分辨率 2.20 Å R-free 0.223
2VJE Crystal Structure of the MDM2-MDMX RING Domain Heterodimer 提交 2007-12-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 428–490（63 aa）片段：RESIDUES 428-490	未记录	ZN ZINC ION × 4 FLC CITRATE ANION × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；1.8 M NH4(SO4)2, 0.5 M NACL, 0.1 M NA CITRATE, PH 6.5	分辨率 2.20 Å R-free 0.223
2VJF Crystal Structure of the MDM2-MDMX RING Domain Heterodimer 提交 2007-12-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 428–490（63 aa）片段：RESIDUES 428-490	未记录	ZN ZINC ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；1.8 M NH4(SO4)2, 0.5 M NACL, 0.1 M NA CITRATE, PH 6.5	分辨率 2.30 Å R-free 0.234
2VJF Crystal Structure of the MDM2-MDMX RING Domain Heterodimer 提交 2007-12-10	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 D 428–490（63 aa）片段：RESIDUES 428-490	未记录	ZN ZINC ION × 4 FLC CITRATE ANION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 6.5；1.8 M NH4(SO4)2, 0.5 M NACL, 0.1 M NA CITRATE, PH 6.5	分辨率 2.30 Å R-free 0.234
2VYR Structure of human MDM4 N-terminal domain bound to a single domain antibody 提交 2008-07-28	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 12 PDB 声明：dodecameric	链 A 16–116（101 aa）片段：RESIDUES 16-116 链 B 16–116（101 aa）片段：RESIDUES 16-116 链 C 16–116（101 aa）片段：RESIDUES 16-116 链 D 16–116（101 aa）片段：RESIDUES 16-116	未记录	SO4 SULFATE ION × 4	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 pH 7；SE-MET: 20% PEG 3350, 0.2 M MGCL2, 1MM TRIS PH 7.0, 5MM B-ME, PROTEIN 10MG/ML. NATIVE: 1.6M AMMONIUM SULPHATE, 0.5M LITHIUM CHLORIDE, 1MM TRIS, PH 7.0, 5MM B-ME, PROTEIN 10MG/ML	分辨率 2.00 Å R-free 0.248
3DAB Structure of the human Mdmx protein bound to the p53 tumor suppressor transactivation domain 提交 2008-05-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 23–111（89 aa）片段：UNP residues 23-111	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；300 K；25% PEG3350, 0.1M MES, pH6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 300K	分辨率 1.90 Å R-free 0.257
3DAB Structure of the human Mdmx protein bound to the p53 tumor suppressor transactivation domain 提交 2008-05-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 23–111（89 aa）片段：UNP residues 23-111	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；300 K；25% PEG3350, 0.1M MES, pH6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 300K	分辨率 1.90 Å R-free 0.257
3DAB Structure of the human Mdmx protein bound to the p53 tumor suppressor transactivation domain 提交 2008-05-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 23–111（89 aa）片段：UNP residues 23-111	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；300 K；25% PEG3350, 0.1M MES, pH6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 300K	分辨率 1.90 Å R-free 0.257
3DAB Structure of the human Mdmx protein bound to the p53 tumor suppressor transactivation domain 提交 2008-05-29	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 23–111（89 aa）片段：UNP residues 23-111	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；300 K；25% PEG3350, 0.1M MES, pH6.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 300K	分辨率 1.90 Å R-free 0.257
3FDO Structure of human MDMX in complex with high affinity peptide 提交 2008-11-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 23–111（89 aa）片段：p53 binding domain, UNP residues 23-111	未记录	MG MAGNESIUM ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；290 K；4.3M NaCl, 100mM Hepes, pH7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K	分辨率 1.40 Å R-free 0.247
3FDO Structure of human MDMX in complex with high affinity peptide 提交 2008-11-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 23–111（89 aa）片段：p53 binding domain, UNP residues 23-111	未记录	MG MAGNESIUM ION × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；290 K；4.3M NaCl, 100mM Hepes, pH7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K	分辨率 1.40 Å R-free 0.247
3FDO Structure of human MDMX in complex with high affinity peptide 提交 2008-11-26	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 A 23–111（89 aa）片段：p53 binding domain, UNP residues 23-111	未记录	MG MAGNESIUM ION × 10	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.3；290 K；4.3M NaCl, 100mM Hepes, pH7.3, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 290K	分辨率 1.40 Å R-free 0.247
3FE7 Crystal Structure of HdmX bound to the p53-peptidomimetic Ac-Phe-Met-Aib-Pmp-Trp-Glu-Ac3c-Leu-NH2 at 1.35A 提交 2008-11-28	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 14–111（98 aa）片段：N-terminal domain, UNP residues 14-111	突变：C17S	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；3.1M AmSo4, 1% MPD, 4% polypropyleneglycol, 0.1M MES, pH6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.35 Å R-free 0.209
3FEA Crystal Structure of HdmX bound to the p53-peptidomimetic Ac-Phe-Met-Aib-Pmp-6-Cl-Trp-Glu-Ac3c-Leu-NH2 at 1.33A 提交 2008-11-28	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 14–111（98 aa）片段：N-terminal domain, UNP residues 14-111	突变：C17S	MPD (4S)-2-METHYL-2,4-PENTANEDIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；277 K；3.1M AmSo4, 1% MPD, 0.1M MES, pH6.0, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 277K	分辨率 1.33 Å R-free 0.206
3JZO Human MDMX liganded with a 12mer peptide (pDI) 提交 2009-09-23	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 23–111（89 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；292 K；1.4 M Na/K phosphate, pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.80 Å R-free 0.207
3JZP Human MDMX liganded with a 12mer peptide inhibitor (pDI6W) 提交 2009-09-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 23–111（89 aa）	未记录	K POTASSIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.2；292 K；1.4 M Na/K phosphate, pH 8.2, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.74 Å R-free 0.217
3JZQ Human MDMX liganded with a 12mer peptide inhibitor (pDIQ) 提交 2009-09-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 23–111（89 aa）	未记录	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；292 K；2.1 M ammonium sulfate, 10 mM Tris HCl, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.80 Å R-free 0.224
3JZQ Human MDMX liganded with a 12mer peptide inhibitor (pDIQ) 提交 2009-09-24	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 23–111（89 aa）	未记录	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.4；292 K；2.1 M ammonium sulfate, 10 mM Tris HCl, pH 7.4, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 292K	分辨率 1.80 Å R-free 0.224
3LBJ Structure of human MDMX protein in complex with a small molecule inhibitor 提交 2010-01-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 E 23–111（89 aa）片段：p53 binding domain	未记录	WW8 N-[(3S)-1-({6-chloro-3-[1-(4-chlorobenzyl)-4-phenyl-1H-imidazol-5-yl]-1H-indol-2-yl}carbonyl)pyrrolidin-3-yl]-N,N',N'-trimethylpropane-1,3-diamine × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 5.6；300 K；0.2M Na/K-tartrate, 0.1M Tri-sodium-citrate, 2M ammonium sulfate, pH 5.6, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 300K	分辨率 1.50 Å R-free 0.206
3U15 Structure of hDMX with Dimer Inducing Indolyl Hydantoin RO-2443 提交 2011-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 14–111（98 aa）片段：unp residues 14-111 链 B 14–111（98 aa）片段：unp residues 14-111	突变：C17S 突变：C17S	03M (5Z)-5-[(6-chloro-7-methyl-1H-indol-3-yl)methylidene]-3-(3,4-difluorobenzyl)imidazolidine-2,4-dione × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；1.4-2.0M ammonium sulfate 1.4-2.0M NaCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.80 Å R-free 0.238
3U15 Structure of hDMX with Dimer Inducing Indolyl Hydantoin RO-2443 提交 2011-09-29	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白同源多聚体同源多聚体；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 14–111（98 aa）片段：unp residues 14-111 链 D 14–111（98 aa）片段：unp residues 14-111	突变：C17S 突变：C17S	03M (5Z)-5-[(6-chloro-7-methyl-1H-indol-3-yl)methylidene]-3-(3,4-difluorobenzyl)imidazolidine-2,4-dione × 2 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；277 K；1.4-2.0M ammonium sulfate 1.4-2.0M NaCl, pH 7.5, VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP, temperature 277K	分辨率 1.80 Å R-free 0.238
4RXZ Crystal Structure of MDMX phosporylated Tyr99 in complex with a 12-mer peptide 提交 2014-12-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–108（85 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；12% isopropanol, 0.1M MES pH 6.5 and 10% PEG5000 MME, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.55 Å R-free 0.220
4RXZ Crystal Structure of MDMX phosporylated Tyr99 in complex with a 12-mer peptide 提交 2014-12-12	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 24–108（85 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6.5；298 K；12% isopropanol, 0.1M MES pH 6.5 and 10% PEG5000 MME, VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP, temperature 298K	分辨率 1.55 Å R-free 0.220
5MNJ Structure of MDM2-MDMX-UbcH5B-ubiquitin complex 提交 2016-12-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 D 427–490（64 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；0.1 M Tris-HCl, pH 8.5, 0.175 M Li2SO4 and 16-20 %(v/v) PEG 3350	分辨率 2.16 Å R-free 0.231
5MNJ Structure of MDM2-MDMX-UbcH5B-ubiquitin complex 提交 2016-12-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 H 427–490（64 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 4 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；292 K；0.1 M Tris-HCl, pH 8.5, 0.175 M Li2SO4 and 16-20 %(v/v) PEG 3350	分辨率 2.16 Å R-free 0.231
5UML CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN MDMX IN COMPLEX WITH 12-MER PEPTIDE INHIBITOR M3 提交 2017-01-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–108（85 aa）片段：residues 24-108	突变：Q68A,Q69A,E70A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；14% (v/v) 2-Propanol ,70 mM Sodium acetate/ Hydrochloric acid pH 4.6, 140 mM Calcium chloride, 30% (v/v) Glycerol	分辨率 3.00 Å R-free 0.315
5UML CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN MDMX IN COMPLEX WITH 12-MER PEPTIDE INHIBITOR M3 提交 2017-01-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 B 24–108（85 aa）片段：residues 24-108	突变：Q68A,Q69A,E70A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；14% (v/v) 2-Propanol ,70 mM Sodium acetate/ Hydrochloric acid pH 4.6, 140 mM Calcium chloride, 30% (v/v) Glycerol	分辨率 3.00 Å R-free 0.315
5UML CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN MDMX IN COMPLEX WITH 12-MER PEPTIDE INHIBITOR M3 提交 2017-01-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 24–108（85 aa）片段：residues 24-108	突变：Q68A,Q69A,E70A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；14% (v/v) 2-Propanol ,70 mM Sodium acetate/ Hydrochloric acid pH 4.6, 140 mM Calcium chloride, 30% (v/v) Glycerol	分辨率 3.00 Å R-free 0.315
5UML CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN MDMX IN COMPLEX WITH 12-MER PEPTIDE INHIBITOR M3 提交 2017-01-27	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 24–108（85 aa）片段：residues 24-108	突变：Q68A,Q69A,E70A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 4.6；298 K；14% (v/v) 2-Propanol ,70 mM Sodium acetate/ Hydrochloric acid pH 4.6, 140 mM Calcium chloride, 30% (v/v) Glycerol	分辨率 3.00 Å R-free 0.315
5VK1 Crystal structure of human MDM4 in complex with a 12-mer lysine-cysteine side chain dithiocarbamate stapled peptide inhibitor PMI 提交 2017-04-20	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 24–108（85 aa）片段：residues 24-108	突变：Q68A, Q69A, E70A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；294 K；30% 2-propanol, 30% PEG 3350, and 100 mM Tris-HCl pH 8.5	分辨率 2.69 Å R-free 0.335
5VK1 Crystal structure of human MDM4 in complex with a 12-mer lysine-cysteine side chain dithiocarbamate stapled peptide inhibitor PMI 提交 2017-04-20	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 C 24–108（85 aa）片段：residues 24-108	突变：Q68A, Q69A, E70A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；294 K；30% 2-propanol, 30% PEG 3350, and 100 mM Tris-HCl pH 8.5	分辨率 2.69 Å R-free 0.335
5VK1 Crystal structure of human MDM4 in complex with a 12-mer lysine-cysteine side chain dithiocarbamate stapled peptide inhibitor PMI 提交 2017-04-20	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 E 24–108（85 aa）片段：residues 24-108	突变：Q68A, Q69A, E70A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；294 K；30% 2-propanol, 30% PEG 3350, and 100 mM Tris-HCl pH 8.5	分辨率 2.69 Å R-free 0.335
5VK1 Crystal structure of human MDM4 in complex with a 12-mer lysine-cysteine side chain dithiocarbamate stapled peptide inhibitor PMI 提交 2017-04-20	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 G 24–108（85 aa）片段：residues 24-108	突变：Q68A, Q69A, E70A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；294 K；30% 2-propanol, 30% PEG 3350, and 100 mM Tris-HCl pH 8.5	分辨率 2.69 Å R-free 0.335
5VK1 Crystal structure of human MDM4 in complex with a 12-mer lysine-cysteine side chain dithiocarbamate stapled peptide inhibitor PMI 提交 2017-04-20	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 5 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 I 24–108（85 aa）片段：residues 24-108	突变：Q68A, Q69A, E70A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；294 K；30% 2-propanol, 30% PEG 3350, and 100 mM Tris-HCl pH 8.5	分辨率 2.69 Å R-free 0.335
5VK1 Crystal structure of human MDM4 in complex with a 12-mer lysine-cysteine side chain dithiocarbamate stapled peptide inhibitor PMI 提交 2017-04-20	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 6 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 K 24–108（85 aa）片段：residues 24-108	突变：Q68A, Q69A, E70A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；294 K；30% 2-propanol, 30% PEG 3350, and 100 mM Tris-HCl pH 8.5	分辨率 2.69 Å R-free 0.335
5VK1 Crystal structure of human MDM4 in complex with a 12-mer lysine-cysteine side chain dithiocarbamate stapled peptide inhibitor PMI 提交 2017-04-20	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 7 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 M 24–108（85 aa）片段：residues 24-108	突变：Q68A, Q69A, E70A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；294 K；30% 2-propanol, 30% PEG 3350, and 100 mM Tris-HCl pH 8.5	分辨率 2.69 Å R-free 0.335
5VK1 Crystal structure of human MDM4 in complex with a 12-mer lysine-cysteine side chain dithiocarbamate stapled peptide inhibitor PMI 提交 2017-04-20	构建体不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 8 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 O 24–108（85 aa）片段：residues 24-108	突变：Q68A, Q69A, E70A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 8.5；294 K；30% 2-propanol, 30% PEG 3350, and 100 mM Tris-HCl pH 8.5	分辨率 2.69 Å R-free 0.335
6Q9Q HDMX (14-111; C17S) COMPLEXED WITH COMPOUND 13 AT 2.1A; Structural states of Hdm2 and HdmX: X-ray elucidation of adaptations and binding interactions for different chemical compound classes 提交 2018-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 14–111（98 aa）片段：N-terminal domain, p53 binding domain	突变：C17S	HUE 6-chloranyl-3-[3-[(1~{S})-1-(4-chlorophenyl)ethyl]-5-phenyl-imidazol-4-yl]-~{N}-[2-(4-cyclohexylpiperazin-1-yl)ethyl]-1~{H}-indole-2-carboxamide × 1 O4B 1,4,7,10,13,16-HEXAOXACYCLOOCTADECANE × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.6M AmSO4, 4% w/v 18-crown-ether, 0.1M HEPES	分辨率 2.10 Å R-free 0.252
6Q9Q HDMX (14-111; C17S) COMPLEXED WITH COMPOUND 13 AT 2.1A; Structural states of Hdm2 and HdmX: X-ray elucidation of adaptations and binding interactions for different chemical compound classes 提交 2018-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 14–111（98 aa）片段：N-terminal domain, p53 binding domain	突变：C17S	HUE 6-chloranyl-3-[3-[(1~{S})-1-(4-chlorophenyl)ethyl]-5-phenyl-imidazol-4-yl]-~{N}-[2-(4-cyclohexylpiperazin-1-yl)ethyl]-1~{H}-indole-2-carboxamide × 1 O4B 1,4,7,10,13,16-HEXAOXACYCLOOCTADECANE × 2 SO4 SULFATE ION × 1 GOL GLYCEROL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.6M AmSO4, 4% w/v 18-crown-ether, 0.1M HEPES	分辨率 2.10 Å R-free 0.252
6Q9Q HDMX (14-111; C17S) COMPLEXED WITH COMPOUND 13 AT 2.1A; Structural states of Hdm2 and HdmX: X-ray elucidation of adaptations and binding interactions for different chemical compound classes 提交 2018-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 14–111（98 aa）片段：N-terminal domain, p53 binding domain	突变：C17S	HUE 6-chloranyl-3-[3-[(1~{S})-1-(4-chlorophenyl)ethyl]-5-phenyl-imidazol-4-yl]-~{N}-[2-(4-cyclohexylpiperazin-1-yl)ethyl]-1~{H}-indole-2-carboxamide × 1 O4B 1,4,7,10,13,16-HEXAOXACYCLOOCTADECANE × 1 SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.6M AmSO4, 4% w/v 18-crown-ether, 0.1M HEPES	分辨率 2.10 Å R-free 0.252
6Q9Q HDMX (14-111; C17S) COMPLEXED WITH COMPOUND 13 AT 2.1A; Structural states of Hdm2 and HdmX: X-ray elucidation of adaptations and binding interactions for different chemical compound classes 提交 2018-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 4 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 D 14–111（98 aa）片段：N-terminal domain, p53 binding domain	突变：C17S	HUE 6-chloranyl-3-[3-[(1~{S})-1-(4-chlorophenyl)ethyl]-5-phenyl-imidazol-4-yl]-~{N}-[2-(4-cyclohexylpiperazin-1-yl)ethyl]-1~{H}-indole-2-carboxamide × 1 O4B 1,4,7,10,13,16-HEXAOXACYCLOOCTADECANE × 1 SO4 SULFATE ION × 3	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.6M AmSO4, 4% w/v 18-crown-ether, 0.1M HEPES	分辨率 2.10 Å R-free 0.252
6Q9S HDMX (14-111; C17S) COMPLEXED WITH COMPOUND 14 AT 2.4A: Structural states of Hdm2 and HdmX: X-ray elucidation of adaptations and binding interactions for different chemical compound classes 提交 2018-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 14–111（98 aa）片段：N-terminal domain, p53 binding domain	突变：C17S	HRN 3-[[6-chloranyl-3-[3-[(1~{S})-1-(2,4-dichlorophenyl)ethyl]-5-phenyl-imidazol-4-yl]-1~{H}-indol-2-yl]carbonylamino]-4-[4-(2-oxidanylidene-1,3-oxazinan-3-yl)piperidin-1-yl]benzoic acid × 1 O4B 1,4,7,10,13,16-HEXAOXACYCLOOCTADECANE × 4 SO4 SULFATE ION × 1 NA SODIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.25M AmSO4, 6% w/v 18-crown-ether, 0.1M HEPES	分辨率 2.40 Å R-free 0.268
6Q9S HDMX (14-111; C17S) COMPLEXED WITH COMPOUND 14 AT 2.4A: Structural states of Hdm2 and HdmX: X-ray elucidation of adaptations and binding interactions for different chemical compound classes 提交 2018-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 C 14–111（98 aa）片段：N-terminal domain, p53 binding domain	突变：C17S	HRN 3-[[6-chloranyl-3-[3-[(1~{S})-1-(2,4-dichlorophenyl)ethyl]-5-phenyl-imidazol-4-yl]-1~{H}-indol-2-yl]carbonylamino]-4-[4-(2-oxidanylidene-1,3-oxazinan-3-yl)piperidin-1-yl]benzoic acid × 1 O4B 1,4,7,10,13,16-HEXAOXACYCLOOCTADECANE × 7 SO4 SULFATE ION × 2 NA SODIUM ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.25M AmSO4, 6% w/v 18-crown-ether, 0.1M HEPES	分辨率 2.40 Å R-free 0.268
6Q9S HDMX (14-111; C17S) COMPLEXED WITH COMPOUND 14 AT 2.4A: Structural states of Hdm2 and HdmX: X-ray elucidation of adaptations and binding interactions for different chemical compound classes 提交 2018-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 3 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 14–111（98 aa）片段：N-terminal domain, p53 binding domain	突变：C17S	HRN 3-[[6-chloranyl-3-[3-[(1~{S})-1-(2,4-dichlorophenyl)ethyl]-5-phenyl-imidazol-4-yl]-1~{H}-indol-2-yl]carbonylamino]-4-[4-(2-oxidanylidene-1,3-oxazinan-3-yl)piperidin-1-yl]benzoic acid × 1 O4B 1,4,7,10,13,16-HEXAOXACYCLOOCTADECANE × 2 SO4 SULFATE ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.25M AmSO4, 6% w/v 18-crown-ether, 0.1M HEPES	分辨率 2.40 Å R-free 0.268
6Q9U HDMX (14-111; C17S) COMPLEXED WITH COMPOUND 12 AT 2.4A; Structural states of Hdm2 and HdmX: X-ray elucidation of adaptations and binding interactions for different chemical compound classes 提交 2018-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 14–111（98 aa）片段：N-terminal domain, p53 binding domain	突变：C17S	HRE 4-[(4~{S})-5-(5-chloranyl-2-oxidanylidene-1~{H}-pyridin-3-yl)-2-[2-(dimethylamino)-4-methoxy-pyrimidin-5-yl]-6-oxidanylidene-3-propan-2-yl-4~{H}-pyrrolo[3,4-c]pyrazol-4-yl]benzenecarbonitrile × 1 O4B 1,4,7,10,13,16-HEXAOXACYCLOOCTADECANE × 1 CL CHLORIDE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.3M AmSO4, 2% w/v 18-crown-ether, 0.1M HEPES	分辨率 2.40 Å R-free 0.265
6Q9W X-ray structure of compound 15 bound to HdmX: Structural states of Hdm2 and HdmX: X-ray elucidation of adaptations and binding interactions for different chemical compound classes 提交 2018-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 14–111（98 aa）片段：N-terminal domain, p53 binding domain	突变：C17S	HRT (4~{S})-4-(4-chlorophenyl)-5-[(1~{S})-1-(3-chlorophenyl)ethyl]-2-(2,4-dimethoxypyrimidin-5-yl)-3-propan-2-yl-4~{H}-pyrrolo[3,4-d]imidazol-6-one × 1 SO4 SULFATE ION × 1 O4B 1,4,7,10,13,16-HEXAOXACYCLOOCTADECANE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.25M AmSO4, 4% w/v 18-crown-ether, 0.1M HEPES	分辨率 1.55 Å R-free 0.240
6Q9W X-ray structure of compound 15 bound to HdmX: Structural states of Hdm2 and HdmX: X-ray elucidation of adaptations and binding interactions for different chemical compound classes 提交 2018-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 14–111（98 aa）片段：N-terminal domain, p53 binding domain	突变：C17S	HRT (4~{S})-4-(4-chlorophenyl)-5-[(1~{S})-1-(3-chlorophenyl)ethyl]-2-(2,4-dimethoxypyrimidin-5-yl)-3-propan-2-yl-4~{H}-pyrrolo[3,4-d]imidazol-6-one × 1 SO4 SULFATE ION × 1 O4B 1,4,7,10,13,16-HEXAOXACYCLOOCTADECANE × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7.5；298 K；2.25M AmSO4, 4% w/v 18-crown-ether, 0.1M HEPES	分辨率 1.55 Å R-free 0.240
6Q9Y HDMX (14-111; C17S) COMPLEXED WITH COMPOUND 16 AT 1.20A; Structural states of Hdm2 and HdmX: X-ray elucidation of adaptations and binding interactions for different chemical compound classes 提交 2018-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 14–111（98 aa）片段：N-terminal domain, p53 binding domain	突变：C17S	HRQ 7-methoxy-~{N}-[(3~{S})-1-(4-methylphenyl)pyrrolidin-3-yl]-1~{H}-indole-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；2.5M AmSO4, 0.1M KSCN, 1% v/v MPD, 0.1M MES	分辨率 1.20 Å R-free 0.184
6Q9Y HDMX (14-111; C17S) COMPLEXED WITH COMPOUND 16 AT 1.20A; Structural states of Hdm2 and HdmX: X-ray elucidation of adaptations and binding interactions for different chemical compound classes 提交 2018-12-18	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 B 14–111（98 aa）片段：N-terminal domain, p53 binding domain	突变：C17S	HRQ 7-methoxy-~{N}-[(3~{S})-1-(4-methylphenyl)pyrrolidin-3-yl]-1~{H}-indole-3-carboxamide × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 6；298 K；2.5M AmSO4, 0.1M KSCN, 1% v/v MPD, 0.1M MES	分辨率 1.20 Å R-free 0.184
6YR5 14-3-3 sigma in complex with hDMX-367 peptide 提交 2020-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 O 361–374（14 aa）链 P 361–374（14 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	SO4 SULFATE ION × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；0.1M Bis-Tris propane pH 7, 0.2 M Sodium citrate, 20% PEG3350	分辨率 2.25 Å R-free 0.222
6YR5 14-3-3 sigma in complex with hDMX-367 peptide 提交 2020-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 2 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 Q 361–374（14 aa）链 R 361–374（14 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, HANGING DROP；pH 7；277 K；0.1M Bis-Tris propane pH 7, 0.2 M Sodium citrate, 20% PEG3350	分辨率 2.25 Å R-free 0.222
6YR7 14-3-3 sigma in complex with hDMX-342+367 peptide 提交 2020-04-19	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 4 PDB 声明：tetrameric	链 C 335–374（40 aa）链 Q 335–374（40 aa）	非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）非标准单体：是（mmCIF未提供具体位点）	B3P 2-[3-(2-HYDROXY-1,1-DIHYDROXYMETHYL-ETHYLAMINO)-PROPYLAMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 8；277 K；Sodium citrate tribasic dihydrate, PEG3350, Bis-Tris propane pH8	分辨率 2.10 Å R-free 0.246
7C3Q Human MdmX protein in complex with Nutlin3a 提交 2020-05-13	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 23–108（86 aa）	未记录	O4B 1,4,7,10,13,16-HEXAOXACYCLOOCTADECANE × 1 NUT 4-({(4S,5R)-4,5-bis(4-chlorophenyl)-2-[4-methoxy-2-(propan-2-yloxy)phenyl]-4,5-dihydro-1H-imidazol-1-yl}carbonyl)piperazin-2-one × 1 PEG DI(HYDROXYETHYL)ETHER × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1 M HEPES sodium salt pH 7.5, 1.6 M Ammonium sulfate, 2%(w/v) PEG 1000	分辨率 1.80 Å R-free 0.241
7C3Y Crystal structure of the N-terminal domain of human MdmX protein in complex with Nutlin3a 提交 2020-05-14	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 23–108（86 aa）	未记录	O4B 1,4,7,10,13,16-HEXAOXACYCLOOCTADECANE × 1 NUT 4-({(4S,5R)-4,5-bis(4-chlorophenyl)-2-[4-methoxy-2-(propan-2-yloxy)phenyl]-4,5-dihydro-1H-imidazol-1-yl}carbonyl)piperazin-2-one × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；20% v/v Tacsimate pH 7.0, 0.1 M HEPES sodium salt pH 7.5, 2% (w/v) PEG 200	分辨率 1.63 Å R-free 0.227
7C44 Crystal structure of the p53-binding domain of human MdmX protein in complex with Nutlin3a 提交 2020-05-15	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白单体单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 23–108（86 aa）	未记录	NUT 4-({(4S,5R)-4,5-bis(4-chlorophenyl)-2-[4-methoxy-2-(propan-2-yloxy)phenyl]-4,5-dihydro-1H-imidazol-1-yl}carbonyl)piperazin-2-one × 1 O4B 1,4,7,10,13,16-HEXAOXACYCLOOCTADECANE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；291 K；20% v/v Tacsimate pH 7.0, 0.1 M HEPES sodium salt pH 7.5, 2% (w/v) PEG 200	分辨率 1.65 Å R-free 0.265
7EL4 The crystal structure of p53p peptide fragment in complex with the N-terminal domain of MdmX 提交 2021-04-08	构建体不同突变/修饰不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 信息不足单体；蛋白 × 1 PDB 声明：monomeric	链 A 23–111（89 aa）	未记录	O4B 1,4,7,10,13,16-HEXAOXACYCLOOCTADECANE × 2 MG MAGNESIUM ION × 2	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.16；291 K；0.1 M MES pH 6.5, 2 M MgSO4	分辨率 2.11 Å R-free 0.225
7KJN CRYSTAL STRUCTURE OF HUMAN MDMX IN COMPLEX WITH D-PEPTIDE INHIBITOR (DPMI-OMEGA) 提交 2020-10-26	构建体不同聚集状态不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 3 PDB 声明：trimeric	链 A 24–108（85 aa）	突变：Q68A, Q69A, E70A	未记录非水小分子	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 7.5；294 K；4M sodium chloride, 5% isopropanol, 0.1M HEPES pH 7.5	分辨率 2.80 Å R-free 0.244
7MLA Solution NMR structure of HDMX in complex with Zn and MCo-52-2 提交 2021-04-28	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验方法不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 428–490（63 aa）	未记录	ZN ZINC ION × 2	SOLUTION NMR NMR测量条件 pH 7；298 K；离子强度（mmCIF原始值）0.15；压力 1 NMR样品组成 0.100 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] Hdmx, 0.100 mM MCo-52-2, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O NMR样品组成 0.100 mM Hdmx, 0.100 mM [U-100% 13C; U-100% 15N] MCo-52-2, 90% H2O/10% D2O \| 90% H2O/10% D2O	分辨率未提供
8IA5 Small peptide enhances the binding of nutline-3a to N-terminal domain of MdmX 提交 2023-02-07	构建体不同突变/修饰不同配体/离子不同实验环境不同结构质量不同	Assembly 1 蛋白异源复合物异源复合物；蛋白 × 2 PDB 声明：dimeric	链 A 23–111（89 aa）	未记录	NUT 4-({(4S,5R)-4,5-bis(4-chlorophenyl)-2-[4-methoxy-2-(propan-2-yloxy)phenyl]-4,5-dihydro-1H-imidazol-1-yl}carbonyl)piperazin-2-one × 1 O4B 1,4,7,10,13,16-HEXAOXACYCLOOCTADECANE × 1	X-RAY DIFFRACTION X-ray结晶条件 VAPOR DIFFUSION, SITTING DROP；pH 6.5；291 K；0.1M HEPES pH6.0, 1.6M Ammonium sulfate	分辨率 1.93 Å R-free 0.284

共 36 个其他 PDB 条目、65 个 assembly。打开独立比较页并筛选聚集状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MDM4_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–85； UniProt 24–108 作者链 B； PDB构建体 1–85； UniProt 24–108

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

下载 Download SAXS (.dat) P(r) (.pr.out) CIF

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3eqy
沉积日期 deposition_date	2008-10-01
结构标题 title	Crystal structure of human MDMX in complex with a 12-mer peptide inhibitor
关键词 keywords	MDM4, MDMX, MDMX-peptide inhibitor complex, oncoprotein, Metal-binding, Nucleus, Zinc-finger; ONCOPROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

回转半径 Rg (Guinier) rg_guinier	19.74 Å
回转半径 Rg (电子) rg_electron	18.90 Å
零角强度 I(0) i0	9035550.00
分子量 molecular_weight	22256.0 kDa
排除体积 excluded_volume	27898 Å³
包络体积 envelope_volume	32822 Å³
水化壳体积 shell_volume	15379 Å³
包络直径 envelope_diameter	68.3 Å
壳层 Rg shell_rg	23.85 Å
包络 Rg envelope_rg	19.07 Å
形状 Rg shape_rg	18.85 Å
总 Rg total_rg	19.83 Å
总原子数 total_atoms	1556
残基数 n_residues	192
球谐函数阶数 n_harmonics	20
q 范围 q_range	— – 0.5000 Å⁻¹
数据点数 n_points	101
壳层类型 shell_type	directional
溶剂电子密度 solvent_density	0.3340 e/Å³
壳层衬度 contrast_shell	0.0300 e/Å³
CRYSOL 版本 crysol_version	4.1.3

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4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

最大尺寸 Dmax dmax	68.4 Å
Rg (实空间) rg_real	19.84 Å
Rg 误差 (实空间) rg_real_error	0.64 Å
I(0) (实空间) i0_real	9.0360e+06
I(0) 误差 (实空间) i0_real_error	1.2550e+05
Rg (倒空间) rg_reciprocal	19.83 Å
I(0) (倒空间) i0_reciprocal	9035000.0000
解质量估计 total_estimate	0.8455
解质量评级 solution_quality	GOOD a GOOD solution
P(r) 峰数 n_peaks	1
主峰位置 r_peak_primary	67.5 Å
偏度 Skewness skewness	0.484
峰度 Kurtosis kurtosis	-0.211
角度范围 angular_range	— – 0.4050 Å⁻¹
当前正则化参数 α current_alpha	0.0000
最高正则化参数 α highest_alpha	1970000.0000
实空间数据点数 n_real_points	72
GNOM 版本 gnom_version	4.1.3
质量判据 quality_criteria	AN1: 0.000; Oscil: 0.712; Stabil: 1.000; Sysdev: 1.000; Positv: 1.000; Valcen: 0.861; Smooth: 0.993

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5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

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6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Mdm4 protein
分子量 formula_weight	9575.3 kDa
突变 mutation	Q68A, Q69A, E70A
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	1910

INQVRPKLPLLKILHAAGAQGEMFTVKEVMHYLGQYIMVKQLYDAAAQHMVYCGGDLLGELLGRQSFSVKDPSPLYDMLRKNLVT

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	12-mer peptide inhibitor
分子量 formula_weight	1427.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D

TSFAEYWNLLSP

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	GUANIDINE
分子量 formula_weight	59.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	PHOSPHATE ION
分子量 formula_weight	95.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	4

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	260

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7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	3eqyA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	245 — MDM2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — SWIB/MDM2 domain

结构域编号 domain_id	3eqyB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	245 — MDM2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — SWIB/MDM2 domain

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8. 引用文献 (1)

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晶胞边长 a length_a	75.627 Å
晶胞边长 b length_b	75.627 Å
晶胞边长 c length_c	35.181 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 31
空间群编号 int_tables_number	144
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.630 Å
最低分辨率 resolution_low	15.000 Å
R 因子 r_factor	0.1555
R_work r_work	0.1548
R_free r_free	0.1687

fit	/app/data/saxs_computation/eq/3eqy/3eqy.fit
pddf	/app/data/pr_computation/eq/3eqy/3eqy.pr.out
profile	/app/data/saxs_computation/eq/3eqy/3eqy.dat

Crystal structure of human MDMX in complex with a 12-mer peptide inhibitor

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Mdm4 protein

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

SAXS 散射曲线 SAXS Profile

P(r) 距离分布 P(r) Distribution

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. SAXS 参数 (CRYSOL 理论计算) 3. SAXS Parameters (CRYSOL)

4. P(r) 距离分布 (GNOM 反演) 4. P(r) Analysis (GNOM)

5. 晶体学与实验 5. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

6. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

7. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

CATH v4.4 (2 domains)

8. 引用文献 (1)

9. 文件与曲线 (10)

Files (7)

Curves (3)