SAXSdb — 3f7i

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Baculoviral IAP repeat-containing protein 7

Homo sapiens

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白单体	单体	蛋白 1	ZINC ION × 1 N-[(3aR,6S,6aS)-1-(N-methyl-L-alanyl-3-methyl-L-valyl)octahydrocyclopenta[b]pyrrol-6-yl]naphthalene-1-carboxamide × 1 water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白单体	单体	蛋白 1	ZINC ION × 1 N-[(3aR,6S,6aS)-1-(N-methyl-L-alanyl-3-methyl-L-valyl)octahydrocyclopenta[b]pyrrol-6-yl]naphthalene-1-carboxamide × 1 LITHIUM ION × 1 2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 1,2-ETHANEDIOL × 2 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q6R308_HUMAN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 24–133； UniProt 63–172 作者链 B； PDB构建体 24–133； UniProt 63–172

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3f7i
沉积日期 deposition_date	2008-11-09
结构标题 title	Structure of an ML-IAP/XIAP chimera bound to a peptidomimetic
关键词 keywords	;ZINC BINDING, PEPTIDE COMPLEX, APOPTOSIS INHIBITION, PEPTIDOMIMETIC, SMALL MOLECULE, DRUG DESIGN, Apoptosis, Metal-binding, Nucleus, Zinc-finger ;; APOPTOSIS
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3f7i__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3f7i__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3f7i__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	13.62 Å
Rg（电子密度）	12.30 Å
总 Rg	13.63 Å
原子数	763
残基数	90
排除体积	13529 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3f7i__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`3f7i__assembly_2__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Baculoviral IAP repeat-containing protein 7
分子量 formula_weight	14977.6 kDa
突变 mutation	S150G; R160Q; D161E; F162Y; V163I; H164N; S165N; V166I; Q167H; E168L; Q172L
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	1772

MGSSHHHHHHSSGEVPRGSHMLETEEEEEEGAGATLSRGPAFPGMGSEELRLASFYDWPLTAEVPPELLAAAGFFHTGHQDKVRCFFCYGGLQSWKRGDDPWTEHAKWFPGCQFLLRSKGQEYINNIHLTHSL

来源 Source

来源生物 organism	Homo sapiens
通用名 common_name	Human
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	9606
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	N-[(3aR,6S,6aS)-1-(N-methyl-L-alanyl-3-methyl-L-valyl)octahydrocyclopenta[b]pyrrol-6-yl]naphthalene-1-carboxamide
分子量 formula_weight	478.6 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	LITHIUM ION
分子量 formula_weight	6.9 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	2-[BIS-(2-HYDROXY-ETHYL)-AMINO]-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL
分子量 formula_weight	209.2 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 6 Entity 6 non-polymer

描述 description	1,2-ETHANEDIOL
分子量 formula_weight	62.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 7 Entity 7 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	198

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_id	d3f7ia_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.52 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
超家族 Superfamily superfamily	g.52.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
家族 Family family	g.52.1.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat

结构域编号 domain_id	d3f7ib_
类 Class class	g — Small proteins
折叠类型 Fold fold	g.52 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
超家族 Superfamily superfamily	g.52.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat
家族 Family family	g.52.1.1 — Inhibitor of apoptosis (IAP) repeat

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	3f7iA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1170 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A

结构域编号 domain_id	3f7iB00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1170 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Inhibitor Of Apoptosis Protein (2mihbC-IAP-1); Chain A

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晶胞边长 a length_a	87.163 Å
晶胞边长 b length_b	87.163 Å
晶胞边长 c length_c	73.685 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	16

空间群 space_group	P 41 21 2
空间群编号 int_tables_number	92
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.900 Å
最低分辨率 resolution_low	19.800 Å
R 因子 r_factor	0.1565
R_work r_work	0.1552
R_free r_free	0.1810

Structure of an ML-IAP/XIAP chimera bound to a peptidomimetic

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Baculoviral IAP repeat-containing protein 7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3f7i__assembly_1__model_1

3f7i__assembly_1__model_1 | I(q)

3f7i__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (4)

Structure of an ML-IAP/XIAP chimera bound to a peptidomimetic

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Baculoviral IAP repeat-containing protein 7

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3f7i__assembly_1__model_1

3f7i__assembly_1__model_1 | I(q)

3f7i__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (7)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 non-polymer

实体 7 Entity 7 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (4)