3fws

Crystal Structure of the CBS domains from the Bacillus subtilis CcpN repressor complexed with AppNp, phosphate and magnesium ions

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

YqzB protein

Bacillus subtilis

UniProt O34994

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 PHOSPHOAMINOPHOSPHONIC ACID-ADENYLATE ESTER × 2 PHOSPHATE ION × 2 MAGNESIUM ION × 3 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 O34994_BACSU
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 2–151; UniProt 63–212 作者链 B; PDB构建体 2–151; UniProt 63–212

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3fws
沉积日期 deposition_date2009-01-19
结构标题 titleCrystal Structure of the CBS domains from the Bacillus subtilis CcpN repressor complexed with AppNp, phosphate and magnesium ions
关键词 keywordsCBS DOMAIN DIMER, Metabolism regulator, Central glycolytic gene regulator, TRANSCRIPTION; TRANSCRIPTION
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3fws__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3fws__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3fws__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)20.83 Å
Rg(电子密度)20.17 Å
总 Rg20.91 Å
原子数2360
残基数291
排除体积42519 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3fws__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd3fwsa_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.37 — CBS-domain pair
超家族 Superfamily superfamilyd.37.1 — CBS-domain pair
家族 Family familyd.37.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd3fwsb_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.37 — CBS-domain pair
超家族 Superfamily superfamilyd.37.1 — CBS-domain pair
家族 Family familyd.37.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id3fwsA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology580 — CBS-domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CBS-domain
结构域编号 domain_id3fwsB00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology580 — CBS-domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — CBS-domain
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7. 引用文献 (1)