3g7l

Chromodomain of Chp1 in complex with Histone H3K9me3 peptide

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Chromo domain-containing protein 1

Schizosaccharomyces pombe

UniProt Q10103

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Histone H3.1/H3.2 × 1 (P09988) ACETIC ACID × 1 ZINC ION × 4 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CHP1_SCHPO
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–61; UniProt 15–75

Histone H3.1/H3.2

物种未注明

UniProt P09988

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Chromo domain-containing protein 1 × 1 (Q10103) ACETIC ACID × 1 ZINC ION × 4 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 H31_SCHPO
Isoform
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 P; PDB构建体 1–16; UniProt 2–17

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3g7l
沉积日期 deposition_date2009-02-10
结构标题 titleChromodomain of Chp1 in complex with Histone H3K9me3 peptide
关键词 keywords;chromodomain, protein-peptide complex, silencing, Cell cycle, Chromosome partition, DNA-binding, Nucleus, RNA-mediated gene silencing, Acetylation, Chromosomal protein, DNA damage, DNA repair, Methylation, Nucleosome core, Phosphoprotein, NUCLEAR PROTEIN ;; NUCLEAR PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3g7l__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3g7l__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3g7l__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)12.85 Å
Rg(电子密度)11.40 Å
总 Rg13.13 Å
原子数1065
残基数61
排除体积9726 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3g7l__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id3g7lA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40

7. 引用文献 (1)