3gov

Crystal structure of the catalytic region of human MASP-1

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

MASP-1

Homo sapiens

UniProt P48740

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 GLYCEROL × 2 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MASP1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1, 2
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 5–155; UniProt 298–448 作者链 B; PDB构建体 1–251; UniProt 449–699

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3gov
沉积日期 deposition_date2009-03-20
结构标题 titleCrystal structure of the catalytic region of human MASP-1
关键词 keywords;Complement, serine protease, beta barrel, Hydrolase, Hydroxylation, Immune response, Innate immunity, Sushi, Coagulation, Complement pathway, Disulfide bond, EGF-like domain, Glycoprotein, Protease ;; HYDROLASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3gov__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3gov__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3gov__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)31.79 Å
Rg(电子密度)32.83 Å
总 Rg32.88 Å
原子数3077
残基数398
排除体积54726 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3gov__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 7 domains

SCOP 2.08 (3 domains)

结构域编号 domain_idd3gova1
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.18 — Complement control module/SCR domain
超家族 Superfamily superfamilyg.18.1 — Complement control module/SCR domain
家族 Family familyg.18.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd3gova2
类 Class classg — Small proteins
折叠类型 Fold foldg.18 — Complement control module/SCR domain
超家族 Superfamily superfamilyg.18.1 — Complement control module/SCR domain
家族 Family familyg.18.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd3govb_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.47 — Trypsin-like serine proteases
超家族 Superfamily superfamilyb.47.1 — Trypsin-like serine proteases
家族 Family familyb.47.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id3govA01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology70 — Complement Module; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Complement Module, domain 1
结构域编号 domain_id3govA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture10 — Ribbon
拓扑 Topology topology70 — Complement Module; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Complement Module, domain 1
结构域编号 domain_id3govB01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Trypsin-like serine proteases
结构域编号 domain_id3govB02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Trypsin-like serine proteases
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7. 引用文献 (1)