Ephrin type-A receptor 4
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Ephrin-B2 × 1 （P52799） water × 2 | 与蛋白数一致 |
数据库中的同蛋白其他状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | EPHA4_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–175； UniProt 29–203 |
3gxu
Crystal structure of Eph receptor and ephrin complex
1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures
Ephrin-B2
Homo sapiens
当前结构中的状态
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白异源复合物 | 异源复合物 | 蛋白 2 | Ephrin type-A receptor 4 × 1 （P54764） water × 2 | 与蛋白数一致 |
数据库中的同蛋白其他状态
查看构建体与数据证据
| UniProt名称 | EFNB2_HUMAN |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 2 |
| 链与序列区间 | 作者链 B； PDB构建体 1–143； UniProt 27–169 |
页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。
2. 结构基本信息 2. Structure Basics
| 条目编号 entry_id | 3gxu |
| 沉积日期 deposition_date | 2009-04-03 |
| 结构标题 title | Crystal structure of Eph receptor and ephrin complex |
| 关键词 keywords | ;Complex structure, Eph, ephrin, ATP-binding, Glycoprotein, Kinase, Membrane, Nucleotide-binding, Phosphoprotein, Receptor, Transferase, Transmembrane, Tyrosine-protein kinase, Developmental protein, Differentiation, Disulfide bond, Host-virus interaction, Neurogenesis ;; TRANSFERASE |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles
页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。
3gxu__assembly_1__model_1
Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
3gxu__assembly_1__model_1 | I(q)
3gxu__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending
| Rg（Guinier） | 21.99 Å |
| Rg（电子密度） | 20.88 Å |
| 总 Rg | 21.74 Å |
| 原子数 | 2494 |
| 残基数 | 309 |
| 排除体积 | 44475 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment
5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)
6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains
SCOP 2.08 (2 domains)
| 结构域编号 domain_id | d3gxua_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.18 — Galactose-binding domain-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.18.1 — Galactose-binding domain-like |
| 家族 Family family | b.18.1.4 — Ephrin receptor ligand binding domain |
| 结构域编号 domain_id | d3gxub_ |
| 类 Class class | b — All beta proteins |
| 折叠类型 Fold fold | b.6 — Cupredoxin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | b.6.1 — Cupredoxins |
| 家族 Family family | b.6.1.5 — Ephrin ectodomain |
CATH v4.4 (2 domains)
| 结构域编号 domain_id | 3gxuA00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 120 — Jelly Rolls |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 260 — Galactose-binding domain-like |
| 结构域编号 domain_id | 3gxuB00 |
| 类 Class class | 2 — Mainly Beta |
| 架构 Architecture architecture | 60 — Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 40 — Immunoglobulin-like |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 420 — Cupredoxins - blue copper proteins |