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3gys

Crystal structure determination of cat (Felis silvestris catus) hemoglobin at 2.9 angstrom resolution

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hemoglobin subunit alpha

物种未注明

UniProt P07405

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Hemoglobin subunit beta-A/B × 2 （P07412） PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 water × 3 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Hemoglobin subunit beta-A/B × 2 （P07412） PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 water × 4 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Hemoglobin subunit beta-A/B × 1 （P07412） PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 water × 1 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Hemoglobin subunit beta-A/B × 1 （P07412） PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 water × 2 与蛋白数一致
5 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Hemoglobin subunit beta-A/B × 1 （P07412） PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 water × 2 与蛋白数一致
6 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Hemoglobin subunit beta-A/B × 1 （P07412） PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
3d4x 3gqp 3gqr 3gqr 3gys 3gys 3gys 3gys 3gys 3gys

共 10 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 HBA_FELCA
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–141； UniProt 1–141 作者链 C； PDB构建体 1–141； UniProt 1–141 作者链 E； PDB构建体 1–141； UniProt 1–141 作者链 G； PDB构建体 1–141； UniProt 1–141

Hemoglobin subunit beta-A/B

物种未注明

UniProt P07412

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Hemoglobin subunit alpha × 2 （P07405） PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 water × 3 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 Hemoglobin subunit alpha × 2 （P07405） PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 4 water × 4 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Hemoglobin subunit alpha × 1 （P07405） PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 water × 1 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Hemoglobin subunit alpha × 1 （P07405） PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 water × 2 与蛋白数一致
5 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Hemoglobin subunit alpha × 1 （P07405） PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 water × 2 与蛋白数一致
6 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Hemoglobin subunit alpha × 1 （P07405） PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 2 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
3d4x 3gqp 3gqr 3gqr 3gys 3gys 3gys 3gys 3gys 3gys

共 10 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 HBB_FELCA
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 B； PDB构建体 1–145； UniProt 2–146 作者链 D； PDB构建体 1–145； UniProt 2–146 作者链 F； PDB构建体 1–145； UniProt 2–146 作者链 H； PDB构建体 1–145； UniProt 2–146

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3gys
沉积日期 deposition_date2009-04-05
结构标题 titleCrystal structure determination of cat (Felis silvestris catus) hemoglobin at 2.9 angstrom resolution
关键词 keywords;METHEMOGLOBIN, LOW-OXYGEN AFFINITY, ORTHORHOMBIC, chromatography, Heme, Iron, Oxygen transport, Transport, Polymorphism, Oxygen storage ;; Oxygen storage, Oxygen transport
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3gys__assembly_6__model_1

Assembly 6 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3gys__assembly_6__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3gys__assembly_6__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）20.24 Å
Rg（电子密度）19.06 Å
总 Rg20.01 Å
原子数2255
残基数283
排除体积40196 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3gys__assembly_1__model_1 tetrameric （4） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 3gys__assembly_2__model_1 tetrameric （4） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 3gys__assembly_3__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
4 1 3gys__assembly_4__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
5 1 3gys__assembly_5__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
6 1 3gys__assembly_6__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 16 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

结构域编号 domain_idd3gysa_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamilya.1.1 — Globin-like
家族 Family familya.1.1.2 — Globins
结构域编号 domain_idd3gysb_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamilya.1.1 — Globin-like
家族 Family familya.1.1.2 — Globins
结构域编号 domain_idd3gysc_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamilya.1.1 — Globin-like
家族 Family familya.1.1.2 — Globins
结构域编号 domain_idd3gysd_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamilya.1.1 — Globin-like
家族 Family familya.1.1.2 — Globins
结构域编号 domain_idd3gyse_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamilya.1.1 — Globin-like
家族 Family familya.1.1.2 — Globins
结构域编号 domain_idd3gysf_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamilya.1.1 — Globin-like
家族 Family familya.1.1.2 — Globins
结构域编号 domain_idd3gysg_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamilya.1.1 — Globin-like
家族 Family familya.1.1.2 — Globins
结构域编号 domain_idd3gysh_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.1 — Globin-like
超家族 Superfamily superfamilya.1.1 — Globin-like
家族 Family familya.1.1.2 — Globins

CATH v4.4 (8 domains)

结构域编号 domain_id3gysA00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Globins
结构域编号 domain_id3gysB00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Globins
结构域编号 domain_id3gysC00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Globins
结构域编号 domain_id3gysD00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Globins
结构域编号 domain_id3gysE00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Globins
结构域编号 domain_id3gysF00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Globins
结构域编号 domain_id3gysG00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Globins
结构域编号 domain_id3gysH00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology490 — Globin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Globins
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7. 引用文献 (5)