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3hch

Structure of the C-terminal domain (MsrB) of Neisseria meningitidis PilB (complex with substrate)

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Peptide methionine sulfoxide reductase msrA/msrB

Neisseria meningitidis serogroup A

UniProt Q9JWM8

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 (2S)-2-(acetylamino)-N-methyl-4-[(R)-methylsulfinyl]butanamide × 2 CITRIC ACID × 1 HEXAETHYLENE GLYCOL × 1 water × 1 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 (2S)-2-(acetylamino)-N-methyl-4-[(R)-methylsulfinyl]butanamide × 1 HEXAETHYLENE GLYCOL × 4 2-AMINO-2-HYDROXYMETHYL-PROPANE-1,3-DIOL × 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
2fy6 2jzr 2jzs 3bqe 3bqf 3bqg 3bqh 3hch 3hch

共 9 个 assembly

同源二聚体

暂无

同源四聚体
3hcg

共 1 个 assembly

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
2k9f

共 1 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 MSRAB_NEIMA
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–146； UniProt 377–522 作者链 B； PDB构建体 1–146； UniProt 377–522

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3hch
沉积日期 deposition_date2009-05-06
结构标题 titleStructure of the C-terminal domain (MsrB) of Neisseria meningitidis PilB (complex with substrate)
关键词 keywords;PilB, Methionine sulfoxide reductase B, complex with substrate, Disulfide bond, Electron transport, Multifunctional enzyme, Oxidoreductase, Redox-active center, Transport ;; OXIDOREDUCTASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3hch__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3hch__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3hch__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）15.76 Å
Rg（电子密度）14.68 Å
总 Rg15.83 Å
原子数1209
残基数145
排除体积21241 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3hch__assembly_1__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 3hch__assembly_2__model_1 monomeric （1） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd3hcha_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.88 — Mss4-like
超家族 Superfamily superfamilyb.88.1 — Mss4-like
家族 Family familyb.88.1.3 — SelR domain
结构域编号 domain_idd3hchb_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.88 — Mss4-like
超家族 Superfamily superfamilyb.88.1 — Mss4-like
家族 Family familyb.88.1.3 — SelR domain

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id3hchA00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology150 — Metal Binding Protein, Guanine Nucleotide Exchange Factor; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Peptide methionine sulfoxide reductase.
结构域编号 domain_id3hchB00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology150 — Metal Binding Protein, Guanine Nucleotide Exchange Factor; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Peptide methionine sulfoxide reductase.
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7. 引用文献 (1)