3hkz

The X-ray crystal structure of RNA polymerase from Archaea

Method: X-RAY DIFFRACTION

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;DNA-directed RNA polymerase subunit A' ;

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 13	;DNA-directed RNA polymerase subunit A'' ; × 1 （P58192） DNA-directed RNA polymerase subunit B × 1 DNA-directed RNA polymerase subunit D × 1 （P95989） ;DNA-directed RNA polymerase, subunit E' (RpoE1) ; × 1 （Q980A3） DNA-directed RNA polymerase, subunit F (RpoF) × 1 （Q9UXD9） DNA-directed RNA polymerase, subunit G (RpoG) × 1 （Q980L5） DNA-directed RNA polymerase subunit H × 1 （Q980Q9） DNA-directed RNA polymerase subunit K × 1 （Q97ZJ9） DNA-directed RNA polymerase subunit L × 1 （Q980K0） DNA-directed RNA polymerase subunit N × 1 （Q980Z8） DNA-directed RNA polymerase subunit P × 1 （Q97ZX7） DNA-directed RNA polymerase subunit 13 × 1 （Q980B8） ZINC ION × 5 MAGNESIUM ION × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 13	;DNA-directed RNA polymerase subunit A'' ; × 1 （P58192） DNA-directed RNA polymerase subunit B × 1 DNA-directed RNA polymerase subunit D × 1 （P95989） ;DNA-directed RNA polymerase, subunit E' (RpoE1) ; × 1 （Q980A3） DNA-directed RNA polymerase, subunit F (RpoF) × 1 （Q9UXD9） DNA-directed RNA polymerase, subunit G (RpoG) × 1 （Q980L5） DNA-directed RNA polymerase subunit H × 1 （Q980Q9） DNA-directed RNA polymerase subunit K × 1 （Q97ZJ9） DNA-directed RNA polymerase subunit L × 1 （Q980K0） DNA-directed RNA polymerase subunit N × 1 （Q980Z8） DNA-directed RNA polymerase subunit P × 1 （Q97ZX7） DNA-directed RNA polymerase subunit 13 × 1 （Q980B8） ZINC ION × 5 MAGNESIUM ION × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPOA1_SULSO
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–880； UniProt 1–880 作者链 I； PDB构建体 1–880； UniProt 1–880

;DNA-directed RNA polymerase subunit A'' ;

物种未注明

UniProt P58192

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 13	;DNA-directed RNA polymerase subunit A' ; × 1 （Q980R2） DNA-directed RNA polymerase subunit B × 1 DNA-directed RNA polymerase subunit D × 1 （P95989） ;DNA-directed RNA polymerase, subunit E' (RpoE1) ; × 1 （Q980A3） DNA-directed RNA polymerase, subunit F (RpoF) × 1 （Q9UXD9） DNA-directed RNA polymerase, subunit G (RpoG) × 1 （Q980L5） DNA-directed RNA polymerase subunit H × 1 （Q980Q9） DNA-directed RNA polymerase subunit K × 1 （Q97ZJ9） DNA-directed RNA polymerase subunit L × 1 （Q980K0） DNA-directed RNA polymerase subunit N × 1 （Q980Z8） DNA-directed RNA polymerase subunit P × 1 （Q97ZX7） DNA-directed RNA polymerase subunit 13 × 1 （Q980B8） ZINC ION × 5 MAGNESIUM ION × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 13	;DNA-directed RNA polymerase subunit A' ; × 1 （Q980R2） DNA-directed RNA polymerase subunit B × 1 DNA-directed RNA polymerase subunit D × 1 （P95989） ;DNA-directed RNA polymerase, subunit E' (RpoE1) ; × 1 （Q980A3） DNA-directed RNA polymerase, subunit F (RpoF) × 1 （Q9UXD9） DNA-directed RNA polymerase, subunit G (RpoG) × 1 （Q980L5） DNA-directed RNA polymerase subunit H × 1 （Q980Q9） DNA-directed RNA polymerase subunit K × 1 （Q97ZJ9） DNA-directed RNA polymerase subunit L × 1 （Q980K0） DNA-directed RNA polymerase subunit N × 1 （Q980Z8） DNA-directed RNA polymerase subunit P × 1 （Q97ZX7） DNA-directed RNA polymerase subunit 13 × 1 （Q980B8） ZINC ION × 5 MAGNESIUM ION × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPOA2_SULSO
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 4–395； UniProt 1–392 作者链 M； PDB构建体 4–395； UniProt 1–392

DNA-directed RNA polymerase subunit D

物种未注明

UniProt P95989

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 13	;DNA-directed RNA polymerase subunit A' ; × 1 （Q980R2） ;DNA-directed RNA polymerase subunit A'' ; × 1 （P58192） DNA-directed RNA polymerase subunit B × 1 ;DNA-directed RNA polymerase, subunit E' (RpoE1) ; × 1 （Q980A3） DNA-directed RNA polymerase, subunit F (RpoF) × 1 （Q9UXD9） DNA-directed RNA polymerase, subunit G (RpoG) × 1 （Q980L5） DNA-directed RNA polymerase subunit H × 1 （Q980Q9） DNA-directed RNA polymerase subunit K × 1 （Q97ZJ9） DNA-directed RNA polymerase subunit L × 1 （Q980K0） DNA-directed RNA polymerase subunit N × 1 （Q980Z8） DNA-directed RNA polymerase subunit P × 1 （Q97ZX7） DNA-directed RNA polymerase subunit 13 × 1 （Q980B8） ZINC ION × 5 MAGNESIUM ION × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 13	;DNA-directed RNA polymerase subunit A' ; × 1 （Q980R2） ;DNA-directed RNA polymerase subunit A'' ; × 1 （P58192） DNA-directed RNA polymerase subunit B × 1 ;DNA-directed RNA polymerase, subunit E' (RpoE1) ; × 1 （Q980A3） DNA-directed RNA polymerase, subunit F (RpoF) × 1 （Q9UXD9） DNA-directed RNA polymerase, subunit G (RpoG) × 1 （Q980L5） DNA-directed RNA polymerase subunit H × 1 （Q980Q9） DNA-directed RNA polymerase subunit K × 1 （Q97ZJ9） DNA-directed RNA polymerase subunit L × 1 （Q980K0） DNA-directed RNA polymerase subunit N × 1 （Q980Z8） DNA-directed RNA polymerase subunit P × 1 （Q97ZX7） DNA-directed RNA polymerase subunit 13 × 1 （Q980B8） ZINC ION × 5 MAGNESIUM ION × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPOD_SULSO
Isoform	—
PDB实体	4
链与序列区间	作者链 D； PDB构建体 1–265； UniProt 1–265 作者链 O； PDB构建体 1–265； UniProt 1–265

;DNA-directed RNA polymerase, subunit E' (RpoE1) ;

物种未注明

UniProt Q980A3

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 13	;DNA-directed RNA polymerase subunit A' ; × 1 （Q980R2） ;DNA-directed RNA polymerase subunit A'' ; × 1 （P58192） DNA-directed RNA polymerase subunit B × 1 DNA-directed RNA polymerase subunit D × 1 （P95989） DNA-directed RNA polymerase, subunit F (RpoF) × 1 （Q9UXD9） DNA-directed RNA polymerase, subunit G (RpoG) × 1 （Q980L5） DNA-directed RNA polymerase subunit H × 1 （Q980Q9） DNA-directed RNA polymerase subunit K × 1 （Q97ZJ9） DNA-directed RNA polymerase subunit L × 1 （Q980K0） DNA-directed RNA polymerase subunit N × 1 （Q980Z8） DNA-directed RNA polymerase subunit P × 1 （Q97ZX7） DNA-directed RNA polymerase subunit 13 × 1 （Q980B8） ZINC ION × 5 MAGNESIUM ION × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 13	;DNA-directed RNA polymerase subunit A' ; × 1 （Q980R2） ;DNA-directed RNA polymerase subunit A'' ; × 1 （P58192） DNA-directed RNA polymerase subunit B × 1 DNA-directed RNA polymerase subunit D × 1 （P95989） DNA-directed RNA polymerase, subunit F (RpoF) × 1 （Q9UXD9） DNA-directed RNA polymerase, subunit G (RpoG) × 1 （Q980L5） DNA-directed RNA polymerase subunit H × 1 （Q980Q9） DNA-directed RNA polymerase subunit K × 1 （Q97ZJ9） DNA-directed RNA polymerase subunit L × 1 （Q980K0） DNA-directed RNA polymerase subunit N × 1 （Q980Z8） DNA-directed RNA polymerase subunit P × 1 （Q97ZX7） DNA-directed RNA polymerase subunit 13 × 1 （Q980B8） ZINC ION × 5 MAGNESIUM ION × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q980A3_SULSO
Isoform	—
PDB实体	5
链与序列区间	作者链 E； PDB构建体 1–180； UniProt 1–180 作者链 Q； PDB构建体 1–180； UniProt 1–180

DNA-directed RNA polymerase, subunit F (RpoF)

物种未注明

UniProt Q9UXD9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 13	;DNA-directed RNA polymerase subunit A' ; × 1 （Q980R2） ;DNA-directed RNA polymerase subunit A'' ; × 1 （P58192） DNA-directed RNA polymerase subunit B × 1 DNA-directed RNA polymerase subunit D × 1 （P95989） ;DNA-directed RNA polymerase, subunit E' (RpoE1) ; × 1 （Q980A3） DNA-directed RNA polymerase, subunit G (RpoG) × 1 （Q980L5） DNA-directed RNA polymerase subunit H × 1 （Q980Q9） DNA-directed RNA polymerase subunit K × 1 （Q97ZJ9） DNA-directed RNA polymerase subunit L × 1 （Q980K0） DNA-directed RNA polymerase subunit N × 1 （Q980Z8） DNA-directed RNA polymerase subunit P × 1 （Q97ZX7） DNA-directed RNA polymerase subunit 13 × 1 （Q980B8） ZINC ION × 5 MAGNESIUM ION × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 13	;DNA-directed RNA polymerase subunit A' ; × 1 （Q980R2） ;DNA-directed RNA polymerase subunit A'' ; × 1 （P58192） DNA-directed RNA polymerase subunit B × 1 DNA-directed RNA polymerase subunit D × 1 （P95989） ;DNA-directed RNA polymerase, subunit E' (RpoE1) ; × 1 （Q980A3） DNA-directed RNA polymerase, subunit G (RpoG) × 1 （Q980L5） DNA-directed RNA polymerase subunit H × 1 （Q980Q9） DNA-directed RNA polymerase subunit K × 1 （Q97ZJ9） DNA-directed RNA polymerase subunit L × 1 （Q980K0） DNA-directed RNA polymerase subunit N × 1 （Q980Z8） DNA-directed RNA polymerase subunit P × 1 （Q97ZX7） DNA-directed RNA polymerase subunit 13 × 1 （Q980B8） ZINC ION × 5 MAGNESIUM ION × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q9UXD9_SULSO
Isoform	—
PDB实体	6
链与序列区间	作者链 F； PDB构建体 1–113； UniProt 1–113 作者链 R； PDB构建体 1–113； UniProt 1–113

DNA-directed RNA polymerase, subunit G (RpoG)

物种未注明

UniProt Q980L5

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 13	;DNA-directed RNA polymerase subunit A' ; × 1 （Q980R2） ;DNA-directed RNA polymerase subunit A'' ; × 1 （P58192） DNA-directed RNA polymerase subunit B × 1 DNA-directed RNA polymerase subunit D × 1 （P95989） ;DNA-directed RNA polymerase, subunit E' (RpoE1) ; × 1 （Q980A3） DNA-directed RNA polymerase, subunit F (RpoF) × 1 （Q9UXD9） DNA-directed RNA polymerase subunit H × 1 （Q980Q9） DNA-directed RNA polymerase subunit K × 1 （Q97ZJ9） DNA-directed RNA polymerase subunit L × 1 （Q980K0） DNA-directed RNA polymerase subunit N × 1 （Q980Z8） DNA-directed RNA polymerase subunit P × 1 （Q97ZX7） DNA-directed RNA polymerase subunit 13 × 1 （Q980B8） ZINC ION × 5 MAGNESIUM ION × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 13	;DNA-directed RNA polymerase subunit A' ; × 1 （Q980R2） ;DNA-directed RNA polymerase subunit A'' ; × 1 （P58192） DNA-directed RNA polymerase subunit B × 1 DNA-directed RNA polymerase subunit D × 1 （P95989） ;DNA-directed RNA polymerase, subunit E' (RpoE1) ; × 1 （Q980A3） DNA-directed RNA polymerase, subunit F (RpoF) × 1 （Q9UXD9） DNA-directed RNA polymerase subunit H × 1 （Q980Q9） DNA-directed RNA polymerase subunit K × 1 （Q97ZJ9） DNA-directed RNA polymerase subunit L × 1 （Q980K0） DNA-directed RNA polymerase subunit N × 1 （Q980Z8） DNA-directed RNA polymerase subunit P × 1 （Q97ZX7） DNA-directed RNA polymerase subunit 13 × 1 （Q980B8） ZINC ION × 5 MAGNESIUM ION × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	Q980L5_SULSO
Isoform	—
PDB实体	7
链与序列区间	作者链 G； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132 作者链 S； PDB构建体 1–132； UniProt 1–132

DNA-directed RNA polymerase subunit H

物种未注明

UniProt Q980Q9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 13	;DNA-directed RNA polymerase subunit A' ; × 1 （Q980R2） ;DNA-directed RNA polymerase subunit A'' ; × 1 （P58192） DNA-directed RNA polymerase subunit B × 1 DNA-directed RNA polymerase subunit D × 1 （P95989） ;DNA-directed RNA polymerase, subunit E' (RpoE1) ; × 1 （Q980A3） DNA-directed RNA polymerase, subunit F (RpoF) × 1 （Q9UXD9） DNA-directed RNA polymerase, subunit G (RpoG) × 1 （Q980L5） DNA-directed RNA polymerase subunit K × 1 （Q97ZJ9） DNA-directed RNA polymerase subunit L × 1 （Q980K0） DNA-directed RNA polymerase subunit N × 1 （Q980Z8） DNA-directed RNA polymerase subunit P × 1 （Q97ZX7） DNA-directed RNA polymerase subunit 13 × 1 （Q980B8） ZINC ION × 5 MAGNESIUM ION × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 13	;DNA-directed RNA polymerase subunit A' ; × 1 （Q980R2） ;DNA-directed RNA polymerase subunit A'' ; × 1 （P58192） DNA-directed RNA polymerase subunit B × 1 DNA-directed RNA polymerase subunit D × 1 （P95989） ;DNA-directed RNA polymerase, subunit E' (RpoE1) ; × 1 （Q980A3） DNA-directed RNA polymerase, subunit F (RpoF) × 1 （Q9UXD9） DNA-directed RNA polymerase, subunit G (RpoG) × 1 （Q980L5） DNA-directed RNA polymerase subunit K × 1 （Q97ZJ9） DNA-directed RNA polymerase subunit L × 1 （Q980K0） DNA-directed RNA polymerase subunit N × 1 （Q980Z8） DNA-directed RNA polymerase subunit P × 1 （Q97ZX7） DNA-directed RNA polymerase subunit 13 × 1 （Q980B8） ZINC ION × 5 MAGNESIUM ION × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPOH_SULSO
Isoform	—
PDB实体	8
链与序列区间	作者链 H； PDB构建体 1–84； UniProt 1–84 作者链 T； PDB构建体 1–84； UniProt 1–84

DNA-directed RNA polymerase subunit K

物种未注明

UniProt Q97ZJ9

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 13	;DNA-directed RNA polymerase subunit A' ; × 1 （Q980R2） ;DNA-directed RNA polymerase subunit A'' ; × 1 （P58192） DNA-directed RNA polymerase subunit B × 1 DNA-directed RNA polymerase subunit D × 1 （P95989） ;DNA-directed RNA polymerase, subunit E' (RpoE1) ; × 1 （Q980A3） DNA-directed RNA polymerase, subunit F (RpoF) × 1 （Q9UXD9） DNA-directed RNA polymerase, subunit G (RpoG) × 1 （Q980L5） DNA-directed RNA polymerase subunit H × 1 （Q980Q9） DNA-directed RNA polymerase subunit L × 1 （Q980K0） DNA-directed RNA polymerase subunit N × 1 （Q980Z8） DNA-directed RNA polymerase subunit P × 1 （Q97ZX7） DNA-directed RNA polymerase subunit 13 × 1 （Q980B8） ZINC ION × 5 MAGNESIUM ION × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 13	;DNA-directed RNA polymerase subunit A' ; × 1 （Q980R2） ;DNA-directed RNA polymerase subunit A'' ; × 1 （P58192） DNA-directed RNA polymerase subunit B × 1 DNA-directed RNA polymerase subunit D × 1 （P95989） ;DNA-directed RNA polymerase, subunit E' (RpoE1) ; × 1 （Q980A3） DNA-directed RNA polymerase, subunit F (RpoF) × 1 （Q9UXD9） DNA-directed RNA polymerase, subunit G (RpoG) × 1 （Q980L5） DNA-directed RNA polymerase subunit H × 1 （Q980Q9） DNA-directed RNA polymerase subunit L × 1 （Q980K0） DNA-directed RNA polymerase subunit N × 1 （Q980Z8） DNA-directed RNA polymerase subunit P × 1 （Q97ZX7） DNA-directed RNA polymerase subunit 13 × 1 （Q980B8） ZINC ION × 5 MAGNESIUM ION × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPOK_SULSO
Isoform	—
PDB实体	9
链与序列区间	作者链 K； PDB构建体 1–95； UniProt 1–95 作者链 U； PDB构建体 1–95； UniProt 1–95

DNA-directed RNA polymerase subunit L

物种未注明

UniProt Q980K0

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 13	;DNA-directed RNA polymerase subunit A' ; × 1 （Q980R2） ;DNA-directed RNA polymerase subunit A'' ; × 1 （P58192） DNA-directed RNA polymerase subunit B × 1 DNA-directed RNA polymerase subunit D × 1 （P95989） ;DNA-directed RNA polymerase, subunit E' (RpoE1) ; × 1 （Q980A3） DNA-directed RNA polymerase, subunit F (RpoF) × 1 （Q9UXD9） DNA-directed RNA polymerase, subunit G (RpoG) × 1 （Q980L5） DNA-directed RNA polymerase subunit H × 1 （Q980Q9） DNA-directed RNA polymerase subunit K × 1 （Q97ZJ9） DNA-directed RNA polymerase subunit N × 1 （Q980Z8） DNA-directed RNA polymerase subunit P × 1 （Q97ZX7） DNA-directed RNA polymerase subunit 13 × 1 （Q980B8） ZINC ION × 5 MAGNESIUM ION × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 13	;DNA-directed RNA polymerase subunit A' ; × 1 （Q980R2） ;DNA-directed RNA polymerase subunit A'' ; × 1 （P58192） DNA-directed RNA polymerase subunit B × 1 DNA-directed RNA polymerase subunit D × 1 （P95989） ;DNA-directed RNA polymerase, subunit E' (RpoE1) ; × 1 （Q980A3） DNA-directed RNA polymerase, subunit F (RpoF) × 1 （Q9UXD9） DNA-directed RNA polymerase, subunit G (RpoG) × 1 （Q980L5） DNA-directed RNA polymerase subunit H × 1 （Q980Q9） DNA-directed RNA polymerase subunit K × 1 （Q97ZJ9） DNA-directed RNA polymerase subunit N × 1 （Q980Z8） DNA-directed RNA polymerase subunit P × 1 （Q97ZX7） DNA-directed RNA polymerase subunit 13 × 1 （Q980B8） ZINC ION × 5 MAGNESIUM ION × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPOL_SULSO
Isoform	—
PDB实体	10
链与序列区间	作者链 L； PDB构建体 1–92； UniProt 1–92 作者链 V； PDB构建体 1–92； UniProt 1–92

DNA-directed RNA polymerase subunit N

物种未注明

UniProt Q980Z8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 13	;DNA-directed RNA polymerase subunit A' ; × 1 （Q980R2） ;DNA-directed RNA polymerase subunit A'' ; × 1 （P58192） DNA-directed RNA polymerase subunit B × 1 DNA-directed RNA polymerase subunit D × 1 （P95989） ;DNA-directed RNA polymerase, subunit E' (RpoE1) ; × 1 （Q980A3） DNA-directed RNA polymerase, subunit F (RpoF) × 1 （Q9UXD9） DNA-directed RNA polymerase, subunit G (RpoG) × 1 （Q980L5） DNA-directed RNA polymerase subunit H × 1 （Q980Q9） DNA-directed RNA polymerase subunit K × 1 （Q97ZJ9） DNA-directed RNA polymerase subunit L × 1 （Q980K0） DNA-directed RNA polymerase subunit P × 1 （Q97ZX7） DNA-directed RNA polymerase subunit 13 × 1 （Q980B8） ZINC ION × 5 MAGNESIUM ION × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 13	;DNA-directed RNA polymerase subunit A' ; × 1 （Q980R2） ;DNA-directed RNA polymerase subunit A'' ; × 1 （P58192） DNA-directed RNA polymerase subunit B × 1 DNA-directed RNA polymerase subunit D × 1 （P95989） ;DNA-directed RNA polymerase, subunit E' (RpoE1) ; × 1 （Q980A3） DNA-directed RNA polymerase, subunit F (RpoF) × 1 （Q9UXD9） DNA-directed RNA polymerase, subunit G (RpoG) × 1 （Q980L5） DNA-directed RNA polymerase subunit H × 1 （Q980Q9） DNA-directed RNA polymerase subunit K × 1 （Q97ZJ9） DNA-directed RNA polymerase subunit L × 1 （Q980K0） DNA-directed RNA polymerase subunit P × 1 （Q97ZX7） DNA-directed RNA polymerase subunit 13 × 1 （Q980B8） ZINC ION × 5 MAGNESIUM ION × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPON_SULSO
Isoform	—
PDB实体	11
链与序列区间	作者链 N； PDB构建体 1–66； UniProt 1–66 作者链 W； PDB构建体 1–66； UniProt 1–66

DNA-directed RNA polymerase subunit P

物种未注明

UniProt Q97ZX7

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 13	;DNA-directed RNA polymerase subunit A' ; × 1 （Q980R2） ;DNA-directed RNA polymerase subunit A'' ; × 1 （P58192） DNA-directed RNA polymerase subunit B × 1 DNA-directed RNA polymerase subunit D × 1 （P95989） ;DNA-directed RNA polymerase, subunit E' (RpoE1) ; × 1 （Q980A3） DNA-directed RNA polymerase, subunit F (RpoF) × 1 （Q9UXD9） DNA-directed RNA polymerase, subunit G (RpoG) × 1 （Q980L5） DNA-directed RNA polymerase subunit H × 1 （Q980Q9） DNA-directed RNA polymerase subunit K × 1 （Q97ZJ9） DNA-directed RNA polymerase subunit L × 1 （Q980K0） DNA-directed RNA polymerase subunit N × 1 （Q980Z8） DNA-directed RNA polymerase subunit 13 × 1 （Q980B8） ZINC ION × 5 MAGNESIUM ION × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 13	;DNA-directed RNA polymerase subunit A' ; × 1 （Q980R2） ;DNA-directed RNA polymerase subunit A'' ; × 1 （P58192） DNA-directed RNA polymerase subunit B × 1 DNA-directed RNA polymerase subunit D × 1 （P95989） ;DNA-directed RNA polymerase, subunit E' (RpoE1) ; × 1 （Q980A3） DNA-directed RNA polymerase, subunit F (RpoF) × 1 （Q9UXD9） DNA-directed RNA polymerase, subunit G (RpoG) × 1 （Q980L5） DNA-directed RNA polymerase subunit H × 1 （Q980Q9） DNA-directed RNA polymerase subunit K × 1 （Q97ZJ9） DNA-directed RNA polymerase subunit L × 1 （Q980K0） DNA-directed RNA polymerase subunit N × 1 （Q980Z8） DNA-directed RNA polymerase subunit 13 × 1 （Q980B8） ZINC ION × 5 MAGNESIUM ION × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

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UniProt名称	RPOP_SULSO
Isoform	—
PDB实体	12
链与序列区间	作者链 P； PDB构建体 1–48； UniProt 1–48 作者链 X； PDB构建体 1–48； UniProt 1–48

DNA-directed RNA polymerase subunit 13

物种未注明

UniProt Q980B8

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 13	;DNA-directed RNA polymerase subunit A' ; × 1 （Q980R2） ;DNA-directed RNA polymerase subunit A'' ; × 1 （P58192） DNA-directed RNA polymerase subunit B × 1 DNA-directed RNA polymerase subunit D × 1 （P95989） ;DNA-directed RNA polymerase, subunit E' (RpoE1) ; × 1 （Q980A3） DNA-directed RNA polymerase, subunit F (RpoF) × 1 （Q9UXD9） DNA-directed RNA polymerase, subunit G (RpoG) × 1 （Q980L5） DNA-directed RNA polymerase subunit H × 1 （Q980Q9） DNA-directed RNA polymerase subunit K × 1 （Q97ZJ9） DNA-directed RNA polymerase subunit L × 1 （Q980K0） DNA-directed RNA polymerase subunit N × 1 （Q980Z8） DNA-directed RNA polymerase subunit P × 1 （Q97ZX7） ZINC ION × 5 MAGNESIUM ION × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 13	;DNA-directed RNA polymerase subunit A' ; × 1 （Q980R2） ;DNA-directed RNA polymerase subunit A'' ; × 1 （P58192） DNA-directed RNA polymerase subunit B × 1 DNA-directed RNA polymerase subunit D × 1 （P95989） ;DNA-directed RNA polymerase, subunit E' (RpoE1) ; × 1 （Q980A3） DNA-directed RNA polymerase, subunit F (RpoF) × 1 （Q9UXD9） DNA-directed RNA polymerase, subunit G (RpoG) × 1 （Q980L5） DNA-directed RNA polymerase subunit H × 1 （Q980Q9） DNA-directed RNA polymerase subunit K × 1 （Q97ZJ9） DNA-directed RNA polymerase subunit L × 1 （Q980K0） DNA-directed RNA polymerase subunit N × 1 （Q980Z8） DNA-directed RNA polymerase subunit P × 1 （Q97ZX7） ZINC ION × 5 MAGNESIUM ION × 1 FE3-S4 CLUSTER × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q980B8_SULSO
Isoform	—
PDB实体	13
链与序列区间	作者链 Y； PDB构建体 1–104； UniProt 1–104 作者链 Z； PDB构建体 1–104； UniProt 1–104

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3hkz
沉积日期 deposition_date	2009-05-26
结构标题 title	The X-ray crystal structure of RNA polymerase from Archaea
关键词 keywords	;RNA polymerase, archaea, Sulfolobus solfataricus, DNA-directed RNA polymerase, Metal-binding, Nucleotidyltransferase, Transcription, Transferase, Zinc, Zinc-finger ;; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3hkz__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3hkz__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3hkz__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	48.85 Å
Rg（电子密度）	48.45 Å
总 Rg	48.82 Å
原子数	26536
残基数	3338
排除体积	476810 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3hkz__assembly_1__model_1`	tridecameric （13）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`3hkz__assembly_2__model_1`	tridecameric （13）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (16)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	;DNA-directed RNA polymerase subunit A' ;
分子量 formula_weight	99815.7 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,I
原子数 atom_count	53072

MSEKNIKGIKFGILSPDEIRKMSVTAIITPDVYDEDGTPIEGSVMDPRLGVIEPGQKCPTCGNTLGNCPGHFGHIELVRPVIHVGLVKHIYEFLKATCRRCGRVKISEDEIEKYSRIYNAIKKRWPSAARRLTEYVKKTAMKAQVCPHCNEKQYKIKLEKPYNFYEERKEGVAKLTPSDIRERLEKIPDSDVEILGYDPTTSRPEWMILTVLPVPPITIRPSIMIESGIRAEDDLTHKLVDIVRINERLKESIDAGAPQLIIEDLWDLLQYHVATYFDNEIPGLPPSKHRSGRPLRTLAQRLKGKEGRFRGNLSGKRVDFSSRTVISPDPNISIDEVGVPEIIAKTLTVPERITPWNIEKLRQFVINGPDKWPGANYVIRPDGRRIDLRYVKDRKELASTLAPGYIIERHLIDGDIVLFNRQPSLHRISMMAHRVRVLKGLTFRLNLLVCPPYNADFDGDEMNLHVPQSEEAIAEAKEIMLVHKNIITPRYGGPIIGAAQDYISGAYLLTVKTTLLTKEEAQQILGVADVKIDLGEPAILAPREYYTGKQVISAFLPKDFNFHGQANVSSGPRLCKNEDCPHDSYVVIKNGILLEGVFDKKAIGNQQPESILHWLIKEYSDEYGKWLMDNLFRVFIRFVELQGFTMRLEDVSLGDDVKKEIYNEIDRAKVEVDNLIQKYKNGELEPIPGRTLEESLENYILDTLDKLRSTAGDIASKYLDPFNFAYVMARTGARGSVLNITQMAAMLGQQSVRGERIKRGYMTRTLPHFKPYDISPEARGFIYSSFRTGLKPTELFFHAAGGREGLVDTAVRTSQSGYMQRRLINALSDLRAEYDGTVRSLYGEVVQVAYGDDGVFPMYSAHGKTVDVNRIFERVVGWKA

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	;DNA-directed RNA polymerase subunit A'' ;
分子量 formula_weight	43866.0 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,M

MEGMIDEKDKPYLEEKVKQASNILPQKIVDDLKNLILNKEIIVTRDEIDKIFDLAIKEYSEGLIAPGEAIGIVAAQSVGEPGTQMTLRTFHFAGIRELNVTLGLPRLIEIVDAKKVPSTPMMTIYLTDEYKRDRDKALEVARKLEYTKIENVVSSTSIDIASMSIILQLDNEMLKDKGVTVDDVKKAIGRLKLGDFMIEESEDSTLNINFANIDSIAALFKLRDKILNTKIKGIKGIKRAIVQKKGDEYIILTDGSNLSGVLSVKGVDVAKVETNNIREIEEVFGIEAAREIIIREISKVLAEQGLDVDIRHILLIADVMTRTGIVRQIGRHGVTGEKNSVLARAAFEVTVKHLLDAAARGDVEEFKGVVENIIIGHPIKLGTGMVELTMRPILR

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase subunit B
分子量 formula_weight	126721.2 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,J

MASNLTIDERWRVIEAYFKSKGLVRQHLDSYNDFVRNKLQEIIDEQGEIPTEIPGLKVRLGKIRIGKPRVRESDRGEREISPMEARLRNLTYAAPLWLTMIPVENNIEAEPEEVYIGDLPIMLKSAIDPISQYTLDKLIEIGEDPKDPGGYFIVNGSERVIVTQEDLAPNRVLVDTGKTGSNITHTAKIISSTAGYRVPVTIERLKDGTFHVSFPAVPGKIPFVILMRALGILTDRDIVYAVSLDPEVQNELFPSLEQASSIANVDDALDFIGSRVAIGQKRENRIEKAQQIIDKYFLPHLGTSAEDRKKKAYYLAYAISKVIELYLGRREPDDKDHYANKRLRLAGDLFASLFRVAFKAFVKDLTYQLEKSKVRGRKLALKALVRPDIVTERIRHALATGNWVGGRTGVSQLLDRTNWLSMLSHLRRVISSLARGQPNFEARDLHGTQWGRMCPFETPEGPNSGLVKNLALMAQIAVGINERIVEKTLYEMGVVPVEEVIRRVTEGGEDQNEYLKWSKVILNGRLIGYYQDGGELANKIRERRRKGEISDEVNVGHIVTDFINEVHVNCDSGRVRRPLIIVSNGNPLVTIEDIEKLESGAITFDDLVRQGKIEYLDAEEEENAYVALEPNDLTPDHTHLEIWSPAILGITASIIPYPEHNQSPRNTYQSAMAKQALGLYAANYQLRTDTRAHLLHYPQRPLVQTRALDIIGYTNRPAGNNAILAVMSFTGYNMEDSIIMNRSSVERGMYRSTFFRLYSTEEVKYPGGQEDKIVMPEAGVRGYKGKEYYRLLEDNGVVSPEVEVKGGDVLIGKVSPPRFLQEFKELSPEQAKRDTSIVTRHGEMGIVDLVLITETAEGNKLVKVRVRDLRIPTIGDKFASRHGQKGVIGMLIPQVDMPYTVKGVVPDIILNPHALPSRMTLGQIMEGIAGKYAALSGNIVDATPFYKTPIEQLQNEILRYGYLPDATEVVYDGRTGQKIKSRIYFGVVYYQKLHHMVADKLHARARGPVQILTRQPTEGRAREGGLRFGEMERDCLIGFGTAMLLKDRLLDNSDRTMIYVCDQCGYIGWYDKNKNKYVCPIHGDKSNLFPVTVSYAFKLLIQELMSMIISPRLVLEDKVGLSGG

实体 4 Entity 4 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase subunit D
分子量 formula_weight	30330.2 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	D,O

MSINLLHKDDTRIDLVFEGYPLEFVNAIRRASMLYVPIMAVDDVYFIENNSPLYDEILAHRLALIPFMSEEALDTYRWPEECIECTENCEKCYTKIYIEAEAPNEPRMIYSKDIKSEDPSVVPISGDIPIVLLGTNQKISLEARLRLGYGKEHAKFIPVSLSVVRYYPKVEILANCEKAVNVCPEGVFELKDGKLSVKNELSCTLCEECLRYCNGSIRISFVEDKYILEIESVGSLKPERILLEAGKSIIRKIEELEKKLVEVVK

实体 5 Entity 5 polymer

描述 description	;DNA-directed RNA polymerase, subunit E' (RpoE1) ;
分子量 formula_weight	20354.7 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	E,Q

MYKLIKARSIVRIPPNEFGKPLNEIALNELRQQYQEKILKDLGLVLAILNVKTSEEGILVFGDGATYHEVEFDMITYVPVVQEVVEGEVLQVDNYGIFVNLGPMDGLVHISQITDDTLKYDNVRGIIFGEKSKKVIQKGDKVRARVISVASTVTGRLPRIALTMRQPYLGKLEWITQTKK

实体 6 Entity 6 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase, subunit F (RpoF)
分子量 formula_weight	12825.6 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	F,R

MSSVYIVEEHYIPYSVAKKLLTDVIRSGGSSNLLQRTYDYLNSVEKCDAESAQKVIEELSNIVSREDVRAILASICPTTSDEVRSILVMDTNKTYTSEDIQKIIDIIRKYIKS

实体 7 Entity 7 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase, subunit G (RpoG)
分子量 formula_weight	14985.2 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	G,S

MMESVAQEIILSCEINSIERGSLKNLSMVNMSCNGFNVSFDIIDSINIFSQKEKVKVIISKNRPSYSHDDFCGHGYIVTELKDSSLNNGNKYTTIISLYGLLVKIISNKESFLRTSQLNIMDHVYFCVKKNN

实体 8 Entity 8 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase subunit H
分子量 formula_weight	9687.3 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	H,T

MRGSSNKKIDPRIHYLVPKHEVLNIDEAYKILKELGIRPEQLPWIRASDPVARSINAKPGDIIRIIRKSQLYGEVVSYRYVISG

实体 9 Entity 9 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase subunit K
分子量 formula_weight	10871.7 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	K,U

MGLERDEILSQDLHFNEVFISLWQNRLTRYEIARVISARALQLAMGAPALIDINNLSSTDVISIAEEEFRRGVLPITIRRRLPNGKIILLSLRKS

实体 10 Entity 10 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase subunit L
分子量 formula_weight	10298.8 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	L,V

MEIRILKSESNYLELEIEGEDHTLGNLIAGTLRRISGVSFASYYQPHPLSDKIIVKILTDGSITPKDALLKAIENIRGMTSHYIDEIKGLTK

实体 11 Entity 11 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase subunit N
分子量 formula_weight	7602.0 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	N,W

MLIPIRCFTCGSLIADKWQSFITRVNAGENPGKVLDDLGVKRYCCRRMLLSHVDIINEVIHYTRPI

实体 12 Entity 12 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase subunit P
分子量 formula_weight	5607.0 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.7.6
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	P,X

MAVYRCGKCWKTFTDEQLKVLPGVRCPYCGYKIIFMVRKPTIKIVKAI

实体 13 Entity 13 polymer

描述 description	DNA-directed RNA polymerase subunit 13
分子量 formula_weight	12198.7 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	Y,Z

MVSGMSTDEEKEGTSDEEVNEEKEVEETSEDEFPKLSIQDIELLMRNTEIWDNLLNGKITLEEAKKLFEDNYKEYEKRDSRRKAKKAVSKKVKKTKKKEKSVEG

实体 14 Entity 14 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	10

实体 15 Entity 15 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 16 Entity 16 non-polymer

描述 description	FE3-S4 CLUSTER
分子量 formula_weight	295.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 56 domains

CATH v4.4 (56 domains)

结构域编号 domain_id	3hkzA02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	40 — Barwin-like endoglucanases
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	3hkzA03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1490 — Dna Ligase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	180 — RNA polymerase ii

结构域编号 domain_id	3hkzA04
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1950 —

结构域编号 domain_id	3hkzA05
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	320 — Dihydrolipoamide Transferase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 —

结构域编号 domain_id	3hkzA06
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2940 —

结构域编号 domain_id	3hkzA07
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	132 — Topoisomerase I; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — RNA polymerase Rpb1 funnel domain

结构域编号 domain_id	3hkzA08
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	250 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2940 —

结构域编号 domain_id	3hkzA09
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	20 — Other non-globular
拓扑 Topology topology	50 — N-terminal domain of TfIIb
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 —

结构域编号 domain_id	3hkzB04
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1110 — Dna-directed Rna Polymerase Ii 140kd Polypeptide; Chain: B; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA polymerase Rpb2, domain 2

结构域编号 domain_id	3hkzB05
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1070 — Hypothetical Protein Ta0175; Chain: A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	3hkzB06
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	270 — Dna-directed Rna Polymerase Ii 140kd Polypeptide; Chain: B; Domain 6
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — DNA-directed RNA polymerase, subunit 2, domain 6

结构域编号 domain_id	3hkzB07
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — RNA polymerase II, Rpb2 subunit, wall domain

结构域编号 domain_id	3hkzB08
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1800 — DCoH-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA polymerase alpha subunit dimerisation domain

结构域编号 domain_id	3hkzC02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	150 — DNA polymerase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	390 —

结构域编号 domain_id	3hkzD01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA polymerase, RBP11-like subunit

结构域编号 domain_id	3hkzD02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology	120 — RNA Polymerase Alpha Subunit; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	12 — DNA-directed RNA polymerase, insert domain

结构域编号 domain_id	3hkzD03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	3hkzE01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1490 — Dna Ligase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	120 — RNA polymerase Rpb7-like, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	3hkzE02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	3hkzF01
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	140 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	930 —

结构域编号 domain_id	3hkzF02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	150 — DNA polymerase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 — HRDC domain

结构域编号 domain_id	3hkzG00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	3hkzH00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	940 — Eukaryotic RPB6 RNA polymerase subunit
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — RPB5-like RNA polymerase subunit

结构域编号 domain_id	3hkzI02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	40 — Barwin-like endoglucanases
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	3hkzI03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1490 — Dna Ligase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	180 — RNA polymerase ii

结构域编号 domain_id	3hkzI04
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1950 —

结构域编号 domain_id	3hkzI05
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	320 — Dihydrolipoamide Transferase
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	40 —

结构域编号 domain_id	3hkzI06
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	60 — Sandwich
拓扑 Topology topology	40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2940 —

结构域编号 domain_id	3hkzI07
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	132 — Topoisomerase I; Chain A, domain 4
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — RNA polymerase Rpb1 funnel domain

结构域编号 domain_id	3hkzI08
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	250 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	2940 —

结构域编号 domain_id	3hkzI09
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	20 — Other non-globular
拓扑 Topology topology	50 — N-terminal domain of TfIIb
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 —

结构域编号 domain_id	3hkzJ04
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1110 — Dna-directed Rna Polymerase Ii 140kd Polypeptide; Chain: B; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA polymerase Rpb2, domain 2

结构域编号 domain_id	3hkzJ05
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1070 — Hypothetical Protein Ta0175; Chain: A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	3hkzJ06
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	270 — Dna-directed Rna Polymerase Ii 140kd Polypeptide; Chain: B; Domain 6
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — DNA-directed RNA polymerase, subunit 2, domain 6

结构域编号 domain_id	3hkzJ07
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	150 — RNA polymerase II, Rpb2 subunit, wall domain

结构域编号 domain_id	3hkzJ08
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	1800 — DCoH-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA polymerase alpha subunit dimerisation domain

结构域编号 domain_id	3hkzK00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	940 — Eukaryotic RPB6 RNA polymerase subunit
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA polymerase subunit, RPB6/omega

结构域编号 domain_id	3hkzL00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA polymerase, RBP11-like subunit

结构域编号 domain_id	3hkzM02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	150 — DNA polymerase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	390 —

结构域编号 domain_id	3hkzN00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — Homeodomain-like

结构域编号 domain_id	3hkzO01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA polymerase, RBP11-like subunit

结构域编号 domain_id	3hkzO02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology	120 — RNA Polymerase Alpha Subunit; Chain A, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	12 — DNA-directed RNA polymerase, insert domain

结构域编号 domain_id	3hkzO03
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 —

结构域编号 domain_id	3hkzP00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology	28 — Rubrerythrin, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — RNA polymerase ii, chain L

结构域编号 domain_id	3hkzQ01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1490 — Dna Ligase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	120 — RNA polymerase Rpb7-like, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	3hkzQ02
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	3hkzR01
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology	140 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	930 —

结构域编号 domain_id	3hkzR02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	150 — DNA polymerase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	80 — HRDC domain

结构域编号 domain_id	3hkzS00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology	50 — OB fold (Dihydrolipoamide Acetyltransferase, E2P)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	140 — Nucleic acid-binding proteins

结构域编号 domain_id	3hkzT00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	940 — Eukaryotic RPB6 RNA polymerase subunit
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — RPB5-like RNA polymerase subunit

结构域编号 domain_id	3hkzU00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology	940 — Eukaryotic RPB6 RNA polymerase subunit
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA polymerase subunit, RPB6/omega

结构域编号 domain_id	3hkzV00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — RNA polymerase, RBP11-like subunit

结构域编号 domain_id	3hkzW00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 — Homeodomain-like

结构域编号 domain_id	3hkzX00
类 Class class	2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture	20 — Single Sheet
拓扑 Topology topology	28 — Rubrerythrin, domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	30 — RNA polymerase ii, chain L

结构域编号 domain_id	3hkzY00
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	20 — Other non-globular
拓扑 Topology topology	450 — DNA Excision Repair, Uvrb; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

结构域编号 domain_id	3hkzZ00
类 Class class	6 — Special
架构 Architecture architecture	20 — Other non-globular
拓扑 Topology topology	450 — DNA Excision Repair, Uvrb; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 —

▶

晶胞边长 a length_a	125.820 Å
晶胞边长 b length_b	201.235 Å
晶胞边长 c length_c	196.050 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	100.92 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	4

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.400 Å
最低分辨率 resolution_low	40.000 Å
R 因子 r_factor	0.2692
R_work r_work	0.2654
R_free r_free	0.3409

The X-ray crystal structure of RNA polymerase from Archaea

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

;DNA-directed RNA polymerase subunit A' ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

;DNA-directed RNA polymerase subunit A'' ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase subunit D

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

;DNA-directed RNA polymerase, subunit E' (RpoE1) ;

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase, subunit F (RpoF)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase, subunit G (RpoG)

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase subunit H

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase subunit K

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase subunit L

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

DNA-directed RNA polymerase subunit N

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体