3jt0

Crystal Structure of the C-terminal fragment (426-558) Lamin-B1 from Homo sapiens, Northeast Structural Genomics Consortium Target HR5546A

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Lamin-B1

Homo sapiens

UniProt P20700

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 water × 1 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 LMNB1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 12–144; UniProt 426–558 作者链 B; PDB构建体 12–144; UniProt 426–558

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3jt0
沉积日期 deposition_date2009-09-11
结构标题 titleCrystal Structure of the C-terminal fragment (426-558) Lamin-B1 from Homo sapiens, Northeast Structural Genomics Consortium Target HR5546A
关键词 keywords;Structural Genomics, PSI-2, Protein Structure Initiative, Northeast Structural Genomics Consortium, NESG, HR5546A, LMNB1_HUMAN, Lamin-B1, Acetylation, Chromosomal rearrangement, Coiled coil, Intermediate filament, Leukodystrophy, Lipoprotein, Membrane, Nucleus, Phosphoprotein, Polymorphism, Prenylation, STRUCTURAL PROTEIN ;; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3jt0__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3jt0__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3jt0__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)14.59 Å
Rg(电子密度)13.10 Å
总 Rg14.33 Å
原子数829
残基数105
排除体积14687 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3jt0__assembly_1__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 3jt0__assembly_2__model_1 monomeric (1) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

SCOP 2.08 (2 domains)

结构域编号 domain_idd3jt0a_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.16 — Lamin A/C globular tail domain
家族 Family familyb.1.16.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd3jt0b_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.1 — Immunoglobulin-like beta-sandwich
超家族 Superfamily superfamilyb.1.16 — Lamin A/C globular tail domain
家族 Family familyb.1.16.0 — automated matches

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id3jt0A00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1260 — Lamin Tail domain
结构域编号 domain_id3jt0B00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture60 — Sandwich
拓扑 Topology topology40 — Immunoglobulin-like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily1260 — Lamin Tail domain
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7. 引用文献 (1)