SAXSdb — 3k1o

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Sterol 14 alpha-demethylase

Trypanosoma cruzi

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白单体	单体	蛋白 1	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE × 1 ;2,5-anhydro-1,3,4-trideoxy-2-(2,4-difluorophenyl)-6-O-{4-[4-(4-{1-[(1S,2S)-1-ethyl-2-hydroxypropyl]-5-oxo-1,5-dihydro-4H-1,2,4-triazol-4-yl}phenyl)piperazin-1-yl]phenyl}-1-(1H-1,2,4-triazol-1-yl)-D-erythro-hexitol ; × 1 water × 1	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q5I4E1_TRYCR
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 2–452； UniProt 30–481

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3k1o
沉积日期 deposition_date	2009-09-28
结构标题 title	Crystal structure of sterol 14-alpha demethylase (CYP51) from Trypanosoma cruzi in complex with a potential antichagasic drug, posaconazole
关键词 keywords	;sterol 14-alpha demethylase, eburicol 14a-demethylase, CYP51, cytochrome P450, heme, oxidoreductase, monooxygenase, endoplasmic reticulum, transmembrane protein, sterol biosynthesis, lipids, membrane, Iron, heme-thiolate protein ;; OXIDOREDUCTASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3k1o__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3k1o__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3k1o__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	23.18 Å
Rg（电子密度）	22.07 Å
总 Rg	22.98 Å
原子数	3585
残基数	442
排除体积	64320 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3k1o__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Sterol 14 alpha-demethylase
分子量 formula_weight	52352.6 kDa
EC 编号 ec_number	1.14.13.70
突变 mutation	T30K, D31T
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3595

KTPPVYPVTVPFLGHIVQFGKNPLEFMQRCKRDLKSGVFTISIGGQRVTIVGDPHEHSRFFSPRNEILSPREVYTIMTPVFGEGVAYAAPYPRMREQLNFLAEELTIAKFQNFVPAIQHEVRKFMAENWKEDEGVINLLEDCGAMIINTACQCLFGEDLRKRLNARHFAQLLSKMESSLIPAAVFMPWLLRLPLPQSARCREARAELQKILGEIIVAREKEEASKDNNTSDLLGGLLKAVYRDGTRMSLHEVCGMIVAAMFAGQHTSTITTSWSMLHLMHPKNKKWLDKLHKEIDEFPAQLNYDNVMDEMPFAERCVRESIRRDPPLLMVMRMVKAEVKVGSYVVPKGDIIACSPLLSHHDEEAFPNPRLWDPERDEKVDGAFIGFGAGVHKCIGQKFALLQVKTILATAFREYDFQLLRDEVPDPDYHTMVVGPTLNQCLVKYTRKKKLPSHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Trypanosoma cruzi
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	5693
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	PROTOPORPHYRIN IX CONTAINING FE
分子量 formula_weight	616.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	;2,5-anhydro-1,3,4-trideoxy-2-(2,4-difluorophenyl)-6-O-{4-[4-(4-{1-[(1S,2S)-1-ethyl-2-hydroxypropyl]-5-oxo-1,5-dihydro-4H-1,2,4-triazol-4-yl}phenyl)piperazin-1-yl]phenyl}-1-(1H-1,2,4-triazol-1-yl)-D-erythro-hexitol ;
分子量 formula_weight	700.8 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 4 Entity 4 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	10

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d3k1oa_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.104 — Cytochrome P450
超家族 Superfamily superfamily	a.104.1 — Cytochrome P450
家族 Family family	a.104.1.0 — automated matches

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	3k1oA00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	630 — Cytochrome p450
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Cytochrome P450

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晶胞边长 a length_a	63.121 Å
晶胞边长 b length_b	63.121 Å
晶胞边长 c length_c	229.302 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	6

空间群 space_group	P 31 2 1
空间群编号 int_tables_number	152
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.890 Å
最低分辨率 resolution_low	29.170 Å
R 因子 r_factor	0.2303
R_work r_work	0.2281
R_free r_free	0.2760

Crystal structure of sterol 14-alpha demethylase (CYP51) from Trypanosoma cruzi in complex with a potential antichagasic drug, posaconazole

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Sterol 14 alpha-demethylase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3k1o__assembly_1__model_1

3k1o__assembly_1__model_1 | I(q)

3k1o__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of sterol 14-alpha demethylase (CYP51) from Trypanosoma cruzi in complex with a potential antichagasic drug, posaconazole

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Sterol 14 alpha-demethylase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3k1o__assembly_1__model_1

3k1o__assembly_1__model_1 | I(q)

3k1o__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (4)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)