3kfq

Unreduced cathepsin V in complex with stefin A

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Cathepsin L2

Homo sapiens

UniProt O60911

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Cystatin-A × 1 (P01040) water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Cystatin-A × 1 (P01040) water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CATL2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–221; UniProt 114–334 作者链 B; PDB构建体 1–221; UniProt 114–334

Cystatin-A

Homo sapiens

UniProt P01040

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Cathepsin L2 × 1 (O60911) water × 2 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Cathepsin L2 × 1 (O60911) water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CYTA_HUMAN
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 C; PDB构建体 1–98; UniProt 1–98 作者链 D; PDB构建体 1–98; UniProt 1–98

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3kfq
沉积日期 deposition_date2009-10-27
结构标题 titleUnreduced cathepsin V in complex with stefin A
关键词 keywords;papain-like cysteine protease, cathepsin, protease-inhibitor complex, Hydrolase, Lysosome, Protease, Thiol protease, Zymogen, Protease inhibitor, Thiol protease inhibitor, Hydrolase-Hydrolase inhibitor complex ;; Hydrolase/Hydrolase inhibitor
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3kfq__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3kfq__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3kfq__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)21.36 Å
Rg(电子密度)20.63 Å
总 Rg21.50 Å
原子数2466
残基数318
排除体积43709 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3kfq__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 3kfq__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd3kfqa_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.3 — Cysteine proteinases
超家族 Superfamily superfamilyd.3.1 — Cysteine proteinases
家族 Family familyd.3.1.1 — Papain-like
结构域编号 domain_idd3kfqb_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.3 — Cysteine proteinases
超家族 Superfamily superfamilyd.3.1 — Cysteine proteinases
家族 Family familyd.3.1.1 — Papain-like
结构域编号 domain_idd3kfqc_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.17 — Cystatin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.17.1 — Cystatin/monellin
家族 Family familyd.17.1.2 — Cystatins
结构域编号 domain_idd3kfqd_
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.17 — Cystatin-like
超家族 Superfamily superfamilyd.17.1 — Cystatin/monellin
家族 Family familyd.17.1.2 — Cystatins

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id3kfqA00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology70 — Cathepsin B; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cysteine proteinases
结构域编号 domain_id3kfqB00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology70 — Cathepsin B; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Cysteine proteinases
结构域编号 domain_id3kfqC00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology450 — Nuclear Transport Factor 2; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
结构域编号 domain_id3kfqD00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology450 — Nuclear Transport Factor 2; Chain: A,
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 —
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7. 引用文献 (1)