← 返回搜索
3lap

The Structure of the Intermediate Complex of the Arginine Repressor from Mycobacterium tuberculosis Bound to its DNA Operator and L-canavanine.

Method: X-RAY DIFFRACTION
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Arginine repressor

Mycobacterium tuberculosis

UniProt P0A4Y8

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–DNA 同源多聚体 蛋白 6 DNA 6 5'-D(*TP*TP*GP*CP*AP*TP*AP*AP*CP*GP*AP*TP*GP*CP*AP*A)-3' × 3 5'-D(*TP*TP*GP*CP*AP*TP*CP*GP*TP*TP*AP*TP*GP*CP*AP*A)-3' × 3 L-CANAVANINE × 6 SULFATE ION × 8 water × 12 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体
2zfz 2zfz 2zfz 3bue 3bue 3bue 3cag 3cag 3cag

共 9 个 assembly

异源或核酸复合物
3ere 3ere 3fhz 3laj 3lap

共 5 个 assembly

查看构建体与数据证据
UniProt名称 ARGR_MYCTU
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 B； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 C； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 D； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 E； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170 作者链 F； PDB构建体 1–170； UniProt 1–170

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3lap
沉积日期 deposition_date2010-01-06
结构标题 titleThe Structure of the Intermediate Complex of the Arginine Repressor from Mycobacterium tuberculosis Bound to its DNA Operator and L-canavanine.
关键词 keywords;Mycobacterium tuberculosis, arginine repressor, DNA binding, ArgR-DNA-canavanine ternary complex, Structural Genomics, TB Structural Genomics Consortium, TBSGC, Mycobacterium Tuberculosis Structural Proteomics Project, XMTB, Amino-acid biosynthesis, Arginine biosynthesis, Cytoplasm, DNA-binding, Repressor, Transcription, Transcription regulation, TRANSCRIPTION REGULATOR, TRANSCRIPTION REGULATOR-DNA complex ;; TRANSCRIPTION REGULATOR/DNA
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3lap__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3lap__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3lap__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）34.23 Å
Rg（电子密度）32.59 Å
总 Rg33.26 Å
原子数8620
残基数1005
排除体积146210 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3lap__assembly_1__model_1 dodecameric （12） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 12 domains

CATH v4.4 (12 domains)

结构域编号 domain_id3lapA01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain
结构域编号 domain_id3lapA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 —
结构域编号 domain_id3lapB01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain
结构域编号 domain_id3lapB02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 —
结构域编号 domain_id3lapC01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain
结构域编号 domain_id3lapC02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 —
结构域编号 domain_id3lapD01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain
结构域编号 domain_id3lapD02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 —
结构域编号 domain_id3lapE01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain
结构域编号 domain_id3lapE02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 —
结构域编号 domain_id3lapF01
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology10 — Arc Repressor Mutant, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Winged helix-like DNA-binding domain superfamily/Winged helix DNA-binding domain
结构域编号 domain_id3lapF02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology1360 — Gyrase A; domain 2
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 —
▶

7. 引用文献 (1)