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3li6

Crystal structure and trimer-monomer transition of N-terminal domain of EhCaBP1 from Entamoeba histolytica

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Calcium-binding protein

Entamoeba histolytica

UniProt P38505

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 3 CALCIUM ION × 6 water × 3 与蛋白数一致
2 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 3 CALCIUM ION × 6 water × 3 与蛋白数一致
3 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 3 CALCIUM ION × 6 water × 3 与蛋白数一致
4 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 3 CALCIUM ION × 6 water × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体
1jfj 1jfk 2i18 2m7k 2m7m 2m7n 2nxq 2nxq

共 8 个 assembly

同源二聚体

暂无

同源四聚体

暂无

其他同源多聚体
2nxq 2nxq 2nxq 3li6 3li6 3li6 3li6 3px1 3px1 3qjk 3qjk 3ulg

共 13 个 assembly，这里只显示前 12 个

异源或核酸复合物

暂无

查看构建体与数据证据
UniProt名称 CALBP_ENTHI
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 1–66； UniProt 1–66 作者链 D； PDB构建体 1–66； UniProt 1–66 作者链 G； PDB构建体 1–66； UniProt 1–66 作者链 J； PDB构建体 1–66； UniProt 1–66

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3li6
沉积日期 deposition_date2010-01-24
结构标题 titleCrystal structure and trimer-monomer transition of N-terminal domain of EhCaBP1 from Entamoeba histolytica
关键词 keywords;calcium binding protein, Calcium signaling protein, assembled-domain, free energy, dynamic behaviour, cytoskeleton, METAL BINDING PROTEIN ;; METAL BINDING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3li6__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3li6__assembly_2__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3li6__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）24.77 Å
Rg（电子密度）23.31 Å
总 Rg24.04 Å
原子数1527
残基数195
排除体积27361 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3li6__assembly_1__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 3li6__assembly_2__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 3li6__assembly_3__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
4 1 3li6__assembly_4__model_1 trimeric （3） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 8 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd3li6a_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.39 — EF Hand-like
超家族 Superfamily superfamilya.39.1 — EF-hand
家族 Family familya.39.1.5 — Calmodulin-like
结构域编号 domain_idd3li6d_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.39 — EF Hand-like
超家族 Superfamily superfamilya.39.1 — EF-hand
家族 Family familya.39.1.5 — Calmodulin-like
结构域编号 domain_idd3li6g_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.39 — EF Hand-like
超家族 Superfamily superfamilya.39.1 — EF-hand
家族 Family familya.39.1.5 — Calmodulin-like
结构域编号 domain_idd3li6j_
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.39 — EF Hand-like
超家族 Superfamily superfamilya.39.1 — EF-hand
家族 Family familya.39.1.5 — Calmodulin-like

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id3li6A00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — EF-hand
结构域编号 domain_id3li6D00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — EF-hand
结构域编号 domain_id3li6G00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — EF-hand
结构域编号 domain_id3li6J00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — EF-hand
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7. 引用文献 (1)