SAXSdb — 3lj1

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Serine/threonine-protein kinase/endoribonuclease IRE1

Saccharomyces cerevisiae

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	5-AMINO-3-{[4-(AMINOSULFONYL)PHENYL]AMINO}-N-(2,6-DIFLUOROPHENYL)-1H-1,2,4-TRIAZOLE-1-CARBOTHIOAMIDE × 2	与蛋白数一致
2	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 2	5-AMINO-3-{[4-(AMINOSULFONYL)PHENYL]AMINO}-N-(2,6-DIFLUOROPHENYL)-1H-1,2,4-TRIAZOLE-1-CARBOTHIOAMIDE × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	IRE1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–434； UniProt 658–1115 作者链 B； PDB构建体 1–434； UniProt 658–1115

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3lj1
沉积日期 deposition_date	2010-01-25
结构标题 title	IRE1 complexed with Cdk1/2 Inhibitor III
关键词 keywords	;kinase, kinase inhibitor, nuclease activator, ATP-binding, Endoplasmic reticulum, Glycoprotein, Hydrolase, Magnesium, Membrane, Metal-binding, Multifunctional enzyme, Nucleotide-binding, Phosphoprotein, Serine/threonine-protein kinase, Transcription, Transcription regulation, Transferase, Transmembrane, Unfolded protein response ;; TRANSFERASE, HYDROLASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3lj1__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3lj1__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3lj1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	30.50 Å
Rg（电子密度）	29.42 Å
总 Rg	30.07 Å
原子数	6348
残基数	808
排除体积	112940 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3lj1__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`3lj1__assembly_2__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Serine/threonine-protein kinase/endoribonuclease IRE1
分子量 formula_weight	50278.3 kDa
EC 编号 ec_number	2.7.11.1, 3.1.26.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B
原子数 atom_count	6348

SRIANIPNFEQSLKNLVVSEKILGYGSSGTVVFQGSFQGRPVAVKRMLIDFCDIALMEIKLLTESDDHPNVIRYYCSETTDRFLYIALELCNLNLQDLVESKNVSDENLKLQKEYNPISLLRQIASGVAHLHSLKIIHRDLKPQNILVSTSSRFTADQQTGAENLRILISDFGLCKKLDSGQSSFRTNLNNPSGTSGWRAPELLEESNNLQTKRRLTRSIDIFSMGCVFYYILSKGKHPFGDKYSRESNIIRGIFSLDEMKCLHDRSLIAEATDLISQMIDHDPLKRPTAMKVLRHPLFWPKSKKLEFLLKVSDRLEIENRDPPSALLMKFDAGSDFVIPSGDWTVKFDKTFMDNLERYRKYHSSKLMDLLRALRNKYHHFMDLPEDIAELMGPVPDGFYDYFTKRFPNLLIGVYMIVKENLSDDQILREFLYS

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	yeast
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	4932
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	5-AMINO-3-{[4-(AMINOSULFONYL)PHENYL]AMINO}-N-(2,6-DIFLUOROPHENYL)-1H-1,2,4-TRIAZOLE-1-CARBOTHIOAMIDE
分子量 formula_weight	425.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id	3lj1A01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	3lj1A02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

结构域编号 domain_id	3lj1A03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1440 — de novo design (two linked rop proteins)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	180 — KEN domain

结构域编号 domain_id	3lj1B01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	200 — Phosphorylase Kinase; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	20 — Phosphorylase Kinase; domain 1

结构域编号 domain_id	3lj1B02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	510 — Transferase(Phosphotransferase); domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Transferase(Phosphotransferase) domain 1

结构域编号 domain_id	3lj1B03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology	1440 — de novo design (two linked rop proteins)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	180 — KEN domain

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晶胞边长 a length_a	125.550 Å
晶胞边长 b length_b	125.550 Å
晶胞边长 c length_c	174.390 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	12

空间群 space_group	P 32 1 2
空间群编号 int_tables_number	153
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.330 Å
最低分辨率 resolution_low	51.260 Å
R 因子 r_factor	0.2640
R_work r_work	0.2630
R_free r_free	0.2840

IRE1 complexed with Cdk1/2 Inhibitor III

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Serine/threonine-protein kinase/endoribonuclease IRE1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3lj1__assembly_1__model_1

3lj1__assembly_1__model_1 | I(q)

3lj1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)

IRE1 complexed with Cdk1/2 Inhibitor III

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Serine/threonine-protein kinase/endoribonuclease IRE1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3lj1__assembly_1__model_1

3lj1__assembly_1__model_1 | I(q)

3lj1__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 6 domains

CATH v4.4 (6 domains)

7. 引用文献 (1)