← 返回搜索
3lon

HCV NS3-4a protease domain with ketoamide inhibitor narlaprevir

Method: X-RAY DIFFRACTION
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Genome polyprotein

Hepatitis C virus subtype 1a

UniProt Q9ELS8

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 4 KK-NS4a(21-39)-KK × 2 ZINC ION × 2 ;(1R,2S,5S)-3-[N-({1-[(tert-butylsulfonyl)methyl]cyclohexyl}carbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-N-{(1S)-1-[(1R)-2-(cyclopropylamino)-1-hydroxy-2-oxoethyl]pentyl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide ; × 1 BETA-MERCAPTOETHANOL × 1 water × 4 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 KK-NS4a(21-39)-KK × 1 ZINC ION × 1 ;(1R,2S,5S)-3-[N-({1-[(tert-butylsulfonyl)methyl]cyclohexyl}carbamoyl)-3-methyl-L-valyl]-N-{(1S)-1-[(1R)-2-(cyclopropylamino)-1-hydroxy-2-oxoethyl]pentyl}-6,6-dimethyl-3-azabicyclo[3.1.0]hexane-2-carboxamide ; × 1 BETA-MERCAPTOETHANOL × 1 water × 2 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 KK-NS4a(21-39)-KK × 1 ZINC ION × 1 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

单体

暂无

同源二聚体
3eyd 3eyd 3knx 3knx

共 4 个 assembly

同源四聚体
3eyd

共 1 个 assembly

其他同源多聚体

暂无

异源或核酸复合物
2o8m 2obq 2oc0 2oc1 2oc7 2oc8 2oin 2oin 2oin 3kn2 3kn2 3kn2

共 16 个 assembly，这里只显示前 12 个

查看构建体与数据证据
UniProt名称 Q9ELS8_9HEPC
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A； PDB构建体 12–192； UniProt 1027–1207 作者链 C； PDB构建体 12–192； UniProt 1027–1207

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3lon
沉积日期 deposition_date2010-02-04
结构标题 titleHCV NS3-4a protease domain with ketoamide inhibitor narlaprevir
关键词 keywords;HEPATITIS C VIRUS, NS3 PROTEASE DOMAIN, SERINE PROTEASE, MACROCYCLIC KETOAMIDE INHIBITOR, HYDROLASE, ATP-binding, Capsid protein, Envelope protein, Helicase, Host membrane, Membrane, Nucleotide-binding, RNA replication, Transmembrane, Virion, VIRAL PROTEIN, VIRAL PROTEIN-INHIBITOR complex ;; VIRAL PROTEIN/INHIBITOR
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3lon__assembly_3__model_1

Assembly 3 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3lon__assembly_3__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3lon__assembly_3__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置，不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg（Guinier）16.04 Å
Rg（电子密度）14.86 Å
总 Rg16.09 Å
原子数1225
残基数167
排除体积21916 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3lon__assembly_1__model_1 tetrameric （4） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 3lon__assembly_2__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 3lon__assembly_3__model_1 dimeric （2） 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 4 domains

CATH v4.4 (4 domains)

结构域编号 domain_id3lonA01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily120 —
结构域编号 domain_id3lonA02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Trypsin-like serine proteases
结构域编号 domain_id3lonC01
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily120 —
结构域编号 domain_id3lonC02
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture40 — Beta Barrel
拓扑 Topology topology10 — Thrombin, subunit H
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — Trypsin-like serine proteases
▶

7. 引用文献 (1)