3o3i

Crystal Structure of human Hiwi1 PAZ domain (residues 277-399) in complex with 14-mer RNA (12-bp + 2-nt overhang) containing 2'-OH at its 3'-end

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Piwi-like protein 1

Homo sapiens

UniProt Q96J94

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 同源多聚体 蛋白 2 RNA 2 ;RNA (5'-R(*GP*CP*GP*AP*AP*UP*AP*UP*UP*CP*GP*CP*UP*U)-3') ; × 2 water × 4 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PIWL1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 X; PDB构建体 2–124; UniProt 277–399

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3o3i
沉积日期 deposition_date2010-07-24
结构标题 titleCrystal Structure of human Hiwi1 PAZ domain (residues 277-399) in complex with 14-mer RNA (12-bp + 2-nt overhang) containing 2'-OH at its 3'-end
关键词 keywordsPiwi, PAZ, RNA silencing, pi-RNA, Hiwi1, Hili, PAZ domain, RNA BINDING PROTEIN; RNA BINDING PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3o3i__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3o3i__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 107 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3o3i__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)21.41 Å
Rg(电子密度)20.26 Å
总 Rg21.13 Å
原子数2326
残基数244
排除体积39408 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3o3i__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id3o3iX00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture170 — Beta Complex
拓扑 Topology topology260 — paz domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10 — paz domain
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7. 引用文献 (1)