3phf

Crystal Structure of the Epstein-Barr virus gH and gL complex

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Envelope glycoprotein H

Human herpesvirus 4

UniProt P03231

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein L × 1 (P03212) 与蛋白数一致
10 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein L × 1 (P03212) 与蛋白数一致
11 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein L × 1 (P03212) 与蛋白数一致
12 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein L × 1 (P03212) 与蛋白数一致
13 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein L × 1 (P03212) 与蛋白数一致
14 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein L × 1 (P03212) 与蛋白数一致
15 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein L × 1 (P03212) 与蛋白数一致
16 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein L × 1 (P03212) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein L × 1 (P03212) 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein L × 1 (P03212) 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein L × 1 (P03212) 与蛋白数一致
5 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein L × 1 (P03212) 与蛋白数一致
6 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein L × 1 (P03212) 与蛋白数一致
7 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein L × 1 (P03212) 与蛋白数一致
8 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein L × 1 (P03212) 与蛋白数一致
9 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein L × 1 (P03212) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GH_EBVB9
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 1; PDB构建体 1–653; UniProt 20–672 作者链 3; PDB构建体 1–653; UniProt 20–672 作者链 5; PDB构建体 1–653; UniProt 20–672 作者链 A; PDB构建体 1–653; UniProt 20–672 作者链 C; PDB构建体 1–653; UniProt 20–672 作者链 E; PDB构建体 1–653; UniProt 20–672 作者链 G; PDB构建体 1–653; UniProt 20–672 作者链 I; PDB构建体 1–653; UniProt 20–672 作者链 K; PDB构建体 1–653; UniProt 20–672 作者链 M; PDB构建体 1–653; UniProt 20–672 作者链 O; PDB构建体 1–653; UniProt 20–672 作者链 Q; PDB构建体 1–653; UniProt 20–672 作者链 S; PDB构建体 1–653; UniProt 20–672 作者链 U; PDB构建体 1–653; UniProt 20–672 作者链 W; PDB构建体 1–653; UniProt 20–672 作者链 Y; PDB构建体 1–653; UniProt 20–672

Envelope glycoprotein L

Human herpesvirus 4

UniProt P03212

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein H × 1 (P03231) 与蛋白数一致
10 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein H × 1 (P03231) 与蛋白数一致
11 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein H × 1 (P03231) 与蛋白数一致
12 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein H × 1 (P03231) 与蛋白数一致
13 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein H × 1 (P03231) 与蛋白数一致
14 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein H × 1 (P03231) 与蛋白数一致
15 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein H × 1 (P03231) 与蛋白数一致
16 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein H × 1 (P03231) 与蛋白数一致
2 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein H × 1 (P03231) 与蛋白数一致
3 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein H × 1 (P03231) 与蛋白数一致
4 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein H × 1 (P03231) 与蛋白数一致
5 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein H × 1 (P03231) 与蛋白数一致
6 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein H × 1 (P03231) 与蛋白数一致
7 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein H × 1 (P03231) 与蛋白数一致
8 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein H × 1 (P03231) 与蛋白数一致
9 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 Envelope glycoprotein H × 1 (P03231) 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 GL_EBVB9
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 2; PDB构建体 1–108; UniProt 24–131 作者链 4; PDB构建体 1–108; UniProt 24–131 作者链 6; PDB构建体 1–108; UniProt 24–131 作者链 B; PDB构建体 1–108; UniProt 24–131 作者链 D; PDB构建体 1–108; UniProt 24–131 作者链 F; PDB构建体 1–108; UniProt 24–131 作者链 H; PDB构建体 1–108; UniProt 24–131 作者链 J; PDB构建体 1–108; UniProt 24–131 作者链 L; PDB构建体 1–108; UniProt 24–131 作者链 N; PDB构建体 1–108; UniProt 24–131 作者链 P; PDB构建体 1–108; UniProt 24–131 作者链 R; PDB构建体 1–108; UniProt 24–131 作者链 T; PDB构建体 1–108; UniProt 24–131 作者链 V; PDB构建体 1–108; UniProt 24–131 作者链 X; PDB构建体 1–108; UniProt 24–131 作者链 Z; PDB构建体 1–108; UniProt 24–131

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3phf
沉积日期 deposition_date2010-11-04
结构标题 titleCrystal Structure of the Epstein-Barr virus gH and gL complex
关键词 keywordsVIRUS ENTRY, MEMBRANE FUSION, GLYCOPROTEIN, VIRAL PROTEIN; VIRAL PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3phf__assembly_16__model_1

Assembly 16 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3phf__assembly_16__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3phf__assembly_16__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)34.33 Å
Rg(电子密度)34.08 Å
总 Rg34.33 Å
原子数5916
残基数761
排除体积106190 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3phf__assembly_1__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
2 1 3phf__assembly_2__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
3 1 3phf__assembly_3__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
4 1 3phf__assembly_4__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
5 1 3phf__assembly_5__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
6 1 3phf__assembly_6__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
7 1 3phf__assembly_7__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
8 1 3phf__assembly_8__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
9 1 3phf__assembly_9__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
10 1 3phf__assembly_10__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
11 1 3phf__assembly_11__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
12 1 3phf__assembly_12__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
13 1 3phf__assembly_13__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
14 1 3phf__assembly_14__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
15 1 3phf__assembly_15__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
16 1 3phf__assembly_16__model_1 dimeric (2) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 32 domains

CATH v4.4 (32 domains)

结构域编号 domain_id3phf101
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology380 — Naphthalene 1,2-dioxygenase Alpha Subunit; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Herpesvirus glycoprotein H, domain D-II
结构域编号 domain_id3phf200
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology390 — SAND domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Viral glycoprotein L
结构域编号 domain_id3phf301
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology380 — Naphthalene 1,2-dioxygenase Alpha Subunit; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Herpesvirus glycoprotein H, domain D-II
结构域编号 domain_id3phf400
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology390 — SAND domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Viral glycoprotein L
结构域编号 domain_id3phf501
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology380 — Naphthalene 1,2-dioxygenase Alpha Subunit; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Herpesvirus glycoprotein H, domain D-II
结构域编号 domain_id3phf600
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology390 — SAND domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Viral glycoprotein L
结构域编号 domain_id3phfA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology380 — Naphthalene 1,2-dioxygenase Alpha Subunit; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Herpesvirus glycoprotein H, domain D-II
结构域编号 domain_id3phfB00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology390 — SAND domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Viral glycoprotein L
结构域编号 domain_id3phfC01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology380 — Naphthalene 1,2-dioxygenase Alpha Subunit; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Herpesvirus glycoprotein H, domain D-II
结构域编号 domain_id3phfD00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology390 — SAND domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Viral glycoprotein L
结构域编号 domain_id3phfE01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology380 — Naphthalene 1,2-dioxygenase Alpha Subunit; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Herpesvirus glycoprotein H, domain D-II
结构域编号 domain_id3phfF00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology390 — SAND domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Viral glycoprotein L
结构域编号 domain_id3phfG01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology380 — Naphthalene 1,2-dioxygenase Alpha Subunit; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Herpesvirus glycoprotein H, domain D-II
结构域编号 domain_id3phfH00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology390 — SAND domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Viral glycoprotein L
结构域编号 domain_id3phfI01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology380 — Naphthalene 1,2-dioxygenase Alpha Subunit; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Herpesvirus glycoprotein H, domain D-II
结构域编号 domain_id3phfJ00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology390 — SAND domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Viral glycoprotein L
结构域编号 domain_id3phfK01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology380 — Naphthalene 1,2-dioxygenase Alpha Subunit; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Herpesvirus glycoprotein H, domain D-II
结构域编号 domain_id3phfL00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology390 — SAND domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Viral glycoprotein L
结构域编号 domain_id3phfM01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology380 — Naphthalene 1,2-dioxygenase Alpha Subunit; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Herpesvirus glycoprotein H, domain D-II
结构域编号 domain_id3phfN00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology390 — SAND domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Viral glycoprotein L
结构域编号 domain_id3phfO01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology380 — Naphthalene 1,2-dioxygenase Alpha Subunit; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Herpesvirus glycoprotein H, domain D-II
结构域编号 domain_id3phfP00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology390 — SAND domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Viral glycoprotein L
结构域编号 domain_id3phfQ01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology380 — Naphthalene 1,2-dioxygenase Alpha Subunit; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Herpesvirus glycoprotein H, domain D-II
结构域编号 domain_id3phfR00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology390 — SAND domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Viral glycoprotein L
结构域编号 domain_id3phfS01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology380 — Naphthalene 1,2-dioxygenase Alpha Subunit; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Herpesvirus glycoprotein H, domain D-II
结构域编号 domain_id3phfT00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology390 — SAND domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Viral glycoprotein L
结构域编号 domain_id3phfU01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology380 — Naphthalene 1,2-dioxygenase Alpha Subunit; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Herpesvirus glycoprotein H, domain D-II
结构域编号 domain_id3phfV00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology390 — SAND domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Viral glycoprotein L
结构域编号 domain_id3phfW01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology380 — Naphthalene 1,2-dioxygenase Alpha Subunit; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Herpesvirus glycoprotein H, domain D-II
结构域编号 domain_id3phfX00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology390 — SAND domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Viral glycoprotein L
结构域编号 domain_id3phfY01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture90 — Alpha-Beta Complex
拓扑 Topology topology380 — Naphthalene 1,2-dioxygenase Alpha Subunit; Chain A, domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Herpesvirus glycoprotein H, domain D-II
结构域编号 domain_id3phfZ00
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology390 — SAND domain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily20 — Viral glycoprotein L
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7. 引用文献 (1)