3pxg

Structure of MecA121 and ClpC1-485 complex

Method: X-RAY DIFFRACTION

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Adapter protein mecA 1

Bacillus subtilis

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Negative regulator of genetic competence ClpC/MecB × 6 （P37571）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MECA1_BACSU
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 a； PDB构建体 1–98； UniProt 121–218 作者链 b； PDB构建体 1–98； UniProt 121–218 作者链 c； PDB构建体 1–98； UniProt 121–218 作者链 d； PDB构建体 1–98； UniProt 121–218 作者链 e； PDB构建体 1–98； UniProt 121–218 作者链 f； PDB构建体 1–98； UniProt 121–218

Negative regulator of genetic competence ClpC/MecB

Bacillus subtilis

UniProt P37571

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 12	Adapter protein mecA 1 × 6 （P37958）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CLPC_BACSU
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–468； UniProt 1–485 作者链 B； PDB构建体 1–468； UniProt 1–485 作者链 C； PDB构建体 1–468； UniProt 1–485 作者链 D； PDB构建体 1–468； UniProt 1–485 作者链 E； PDB构建体 1–468； UniProt 1–485 作者链 F； PDB构建体 1–468； UniProt 1–485

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3pxg
沉积日期 deposition_date	2010-12-09
结构标题 title	Structure of MecA121 and ClpC1-485 complex
关键词 keywords	ClpB, proteolysis, ClpC, ClpX, Hsp100/Clp, AAA+ proteins, PROTEIN BINDING; PROTEIN BINDING
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3pxg__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3pxg__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3pxg__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	56.19 Å
Rg（电子密度）	55.47 Å
总 Rg	55.69 Å
原子数	24809
残基数	3195
排除体积	440260 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3pxg__assembly_1__model_1`	dodecameric （12）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Adapter protein mecA 1
分子量 formula_weight	11533.9 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a,b,c,d,e,f
原子数 atom_count	24809

EEKEQKLQFVLRFGDFEDVISLSKLNVNGSKTTLYSFENRYYLYVDFCNMTDEEVENQLSILLEYATESSISIHRLEEYGKLIISEHALETIKKHFAS

来源 Source

来源生物 organism	Bacillus subtilis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1423
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Negative regulator of genetic competence ClpC/MecB
分子量 formula_weight	52077.0 kDa
突变 mutation	E280A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	6

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C,D,E,F

MMFGRFTERAQKVLALAQEEALRLGHNNIGTEHILLGLVREGEGIAAKALQALGLGSEKIQKEVESLIGRGQEMSQTIHYTPRAKKVIELSMDEARKLGHSYVGTEHILLGLIREGEGVAARVLNNLGVSLNKARQQVLQLLGSNETGSSAAGTNSNANTPTLDSLARDLTAIAKEDSLDPVIGRSKEIQRVIEVLSRRTKNNPVLIGEPGVGKTAIAEGLAQQIINNEVPEILRDKRVMTLDMGTKYRGEFEDRLKKVMDEIRQAGNIILFIDAAIDASNILKPSLARGELQCIGATTLDEYRKYIEKDAALERRFQPIQVDQPSVDESIQILQGLRDRYEAHHRVSITDDAIEAAVKLSDRYISDRFLPDKAIDLIDEAGSKVRLRSFTTPPNLKELEQKLDEVRKEKDAAVQSQEFEKAASLRDTEQRLREQVEDTKKSWKEKQGQENSEVTVDDIAMVVSSWTG

来源 Source

来源生物 organism	Bacillus subtilis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1423
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 30 domains

CATH v4.4 (30 domains)

结构域编号 domain_id	3pxgA01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1780 — Double Clp-N motif
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Clp, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	3pxgA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	3pxgA03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	8 — Helicase, Ruva Protein; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 —

结构域编号 domain_id	3pxgA04
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	860 — DNA Excision Repair, Uvrb; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — UVR domain

结构域编号 domain_id	3pxgB01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1780 — Double Clp-N motif
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Clp, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	3pxgB02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	3pxgB03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	8 — Helicase, Ruva Protein; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 —

结构域编号 domain_id	3pxgB04
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	860 — DNA Excision Repair, Uvrb; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — UVR domain

结构域编号 domain_id	3pxgC01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1780 — Double Clp-N motif
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Clp, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	3pxgC02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	3pxgC03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	8 — Helicase, Ruva Protein; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 —

结构域编号 domain_id	3pxgC04
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	860 — DNA Excision Repair, Uvrb; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — UVR domain

结构域编号 domain_id	3pxgD01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1780 — Double Clp-N motif
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Clp, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	3pxgD02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	3pxgD03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	8 — Helicase, Ruva Protein; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 —

结构域编号 domain_id	3pxgD04
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	860 — DNA Excision Repair, Uvrb; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — UVR domain

结构域编号 domain_id	3pxgE01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1780 — Double Clp-N motif
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Clp, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	3pxgE02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	3pxgE03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	8 — Helicase, Ruva Protein; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 —

结构域编号 domain_id	3pxgE04
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	860 — DNA Excision Repair, Uvrb; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — UVR domain

结构域编号 domain_id	3pxgF01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	1780 — Double Clp-N motif
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Clp, N-terminal domain

结构域编号 domain_id	3pxgF02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	3pxgF03
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	8 — Helicase, Ruva Protein; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	60 —

结构域编号 domain_id	3pxgF04
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	860 — DNA Excision Repair, Uvrb; Chain A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — UVR domain

结构域编号 domain_id	3pxga00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1950 —

结构域编号 domain_id	3pxgb00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1950 —

结构域编号 domain_id	3pxgc00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1950 —

结构域编号 domain_id	3pxgd00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1950 —

结构域编号 domain_id	3pxge00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1950 —

结构域编号 domain_id	3pxgf00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology	70 — Alpha-Beta Plaits
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	1950 —

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晶胞边长 a length_a	137.560 Å
晶胞边长 b length_b	137.560 Å
晶胞边长 c length_c	445.650 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	36

空间群 space_group	P 31 2 1
空间群编号 int_tables_number	152
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.654 Å
最低分辨率 resolution_low	49.524 Å
R 因子 r_factor	0.2600
R_work r_work	0.2574
R_free r_free	0.3030

Structure of MecA121 and ClpC1-485 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Adapter protein mecA 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Negative regulator of genetic competence ClpC/MecB

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3pxg__assembly_1__model_1

3pxg__assembly_1__model_1 | I(q)

3pxg__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 30 domains

CATH v4.4 (30 domains)

7. 引用文献 (1)

Structure of MecA121 and ClpC1-485 complex

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Adapter protein mecA 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Negative regulator of genetic competence ClpC/MecB

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3pxg__assembly_1__model_1

3pxg__assembly_1__model_1 | I(q)

3pxg__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 30 domains

CATH v4.4 (30 domains)

7. 引用文献 (1)