SAXSdb — 3pxi

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Adapter protein mecA 1

Bacillus subtilis

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Negative regulator of genetic competence ClpC/MecB × 3 （P37571）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MECA1_BACSU
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 a； PDB构建体 1–111； UniProt 108–218 作者链 b； PDB构建体 1–111； UniProt 108–218 作者链 c； PDB构建体 1–111； UniProt 108–218

Negative regulator of genetic competence ClpC/MecB

Bacillus subtilis

UniProt P37571

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 6	Adapter protein mecA 1 × 3 （P37958）	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	CLPC_BACSU
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–758； UniProt 1–810 作者链 B； PDB构建体 1–758； UniProt 1–810 作者链 C； PDB构建体 1–758； UniProt 1–810

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3pxi
沉积日期 deposition_date	2010-12-09
结构标题 title	Structure of MecA108:ClpC
关键词 keywords	ClpB, proteolysis, ClpC, ClpX, Hsp100/Clp, AAA+ proteins, PROTEIN BINDING; PROTEIN BINDING
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3pxi__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3pxi__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3pxi__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	52.15 Å
Rg（电子密度）	51.80 Å
总 Rg	51.93 Å
原子数	18645
残基数	2405
排除体积	331690 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3pxi__assembly_1__model_1`	hexameric （6）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Adapter protein mecA 1
分子量 formula_weight	13080.5 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	a,b,c
原子数 atom_count	18645

LDDFQKEEQAVNQEEKEQKLQFVLRFGDFEDVISLSKLNVNGSKTTLYSFENRYYLYVDFCNMTDEEVENQLSILLEYATESSISIHRLEEYGKLIISEHALETIKKHFAS

来源 Source

来源生物 organism	Bacillus subtilis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1423
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Negative regulator of genetic competence ClpC/MecB
分子量 formula_weight	84586.4 kDa
突变 mutation	E280A, E618A
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	3

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,C

MMFGRFTERAQKVLALAQEEALRLGHNNIGTEHILLGLVREGEGIAAKALQALGLGSEKIQKEVESLIGRGQEMSQTIHYTPRAKKVIELSMDEARKLGHSYVGTEHILLGLIREGEGVAARVLNNLGVSLNKARQQVLQLLGSNETGSSAAGTNSNANTPTLDSLARDLTAIAKEDSLDPVIGRSKEIQRVIEVLSRRTKNNPVLIGEPGVGKTAIAEGLAQQIINNEVPEILRDKRVMTLDMGTKYRGEFEDRLKKVMDEIRQAGNIILFIDAAIDASNILKPSLARGELQCIGATTLDEYRKYIEKDAALERRFQPIQVDQPSVDESIQILQGLRDRYEAHHRVSITDDAIEAAVKLSDRYISDRFLPDKAIDLIDEAGSKVRLRSFTTPPNLKELEQKLDEVRKEKDAAVQSQEFEKAASLRDTEQRLREQVEDTKKSWKEKQGQENSEVTVDDIAMVVSSWTGVPVSKIAQTETDKLLNMENILHSRVIGQDEAVVAVAKAVRRARAGLKDPKRPIGSFIFLGPTGVGKTELARALAESIFGDEESMIRIDMSEYMEKHSTSGGQLTEKVRRKPYSVVLLDAIEKAHPDVFNILLQVLEDGRLTDSKGRTVDFRNTILIMTSNVGASEKDKVMGELKRAFRPEFINRIDEIIVFHSLEKKHLTEIVSLMSDQLTKRLKEQDLSIELTDAAKAKVAEEGVDLEYGARPLRRAIQKHVEDRLSEELLRGNIHKGQHIVLDVEDGEFVVKTTAKTN

来源 Source

来源生物 organism	Bacillus subtilis
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	1423
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

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晶胞边长 a length_a	141.806 Å
晶胞边长 b length_b	141.806 Å
晶胞边长 c length_c	656.078 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	120.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	36

空间群 space_group	P 65 2 2
空间群编号 int_tables_number	179
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	6.926 Å
最低分辨率 resolution_low	49.153 Å
R 因子 r_factor	0.4081
R_work r_work	0.4074
R_free r_free	0.4219

Structure of MecA108:ClpC

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Adapter protein mecA 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Negative regulator of genetic competence ClpC/MecB

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3pxi__assembly_1__model_1

3pxi__assembly_1__model_1 | I(q)

3pxi__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)

Structure of MecA108:ClpC

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Adapter protein mecA 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Negative regulator of genetic competence ClpC/MecB

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3pxi__assembly_1__model_1

3pxi__assembly_1__model_1 | I(q)

3pxi__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (2)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

7. 引用文献 (1)