3q1r

Crystal structure of a bacterial RNase P holoenzyme in complex with TRNA and in the presence of 5' leader

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Ribonuclease P protein component

Thermotoga maritima

UniProt Q9X1H4

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白–RNA 单体 蛋白 1 RNA 3 RNase P RNA × 1 TRNA (PHE) × 1 ;TRNA 5' LEADER ; × 1 MAGNESIUM ION × 5 与全部聚合物一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 RNPA_THEMA
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 4–118; UniProt 3–117

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3q1r
沉积日期 deposition_date2010-12-17
结构标题 titleCrystal structure of a bacterial RNase P holoenzyme in complex with TRNA and in the presence of 5' leader
关键词 keywords;RNASE P, RIBOZYME, RIBONUCLEASE P, TRNA, PRE-TRNA, TETRALOOP-RECEPTOR, RIBOSE ZIPPER, A-MINOR INTERACTION, BASE STACKING, INTERMOLECULAR BASE PAIRS, INTERMOLECULAR RNA-RNA CONTACTS, RNP, RIBONUCLEOPROTEIN COMPLEX, ENZYME-PRODUCT COMPLEX, METALLOENZYME, RNA-METAL INTERACTIONS, SHAPE COMPLEMENTARITY, SUBSTRATE RECOGNITION, ENDONUCLEASE, HYDROLASE-RNA COMPLEX ;; HYDROLASE/RNA
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3q1r__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3q1r__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 106 107 108 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3q1r__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)41.50 Å
Rg(电子密度)41.56 Å
总 Rg41.70 Å
原子数10186
残基数550
排除体积147740 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3q1r__assembly_1__model_1 tetrameric (4) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

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7. 引用文献 (1)