3qij

Primitive-monoclinic crystal structure of the FERM domain of protein 4.1R

Method: X-RAY DIFFRACTION

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Protein 4.1

Homo sapiens

UniProt P11171

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白单体 单体 蛋白 1 UNKNOWN ATOM OR ION × 10 water × 1 与蛋白数一致
2 蛋白单体 单体 蛋白 1 UNKNOWN ATOM OR ION × 9 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 41_HUMAN
Isoform
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 19–296; UniProt 211–488 作者链 B; PDB构建体 19–296; UniProt 211–488

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3qij
沉积日期 deposition_date2011-01-27
结构标题 titlePrimitive-monoclinic crystal structure of the FERM domain of protein 4.1R
关键词 keywordscytoskeleton, Structural Genomics, Structural Genomics Consortium, SGC, STRUCTURAL PROTEIN; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3qij__assembly_1__model_1 monomeric (1) 排除
排除原因: 来源记录无法明确判定原子或离子的元素,因此不能可靠计算。
2 1 3qij__assembly_2__model_1 monomeric (1) 排除
排除原因: 来源记录无法明确判定原子或离子的元素,因此不能可靠计算。

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 14 domains

SCOP 2.08 (8 domains)

结构域编号 domain_idd3qija1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamilyd.15.1 — Ubiquitin-like
家族 Family familyd.15.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd3qija2
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.11 — Acyl-CoA binding protein-like
超家族 Superfamily superfamilya.11.2 — Second domain of FERM
家族 Family familya.11.2.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd3qija3
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.55 — PH domain-like barrel
超家族 Superfamily superfamilyb.55.1 — PH domain-like
家族 Family familyb.55.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd3qija4
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags
结构域编号 domain_idd3qijb1
类 Class classd — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold foldd.15 — beta-Grasp (ubiquitin-like)
超家族 Superfamily superfamilyd.15.1 — Ubiquitin-like
家族 Family familyd.15.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd3qijb2
类 Class classa — All alpha proteins
折叠类型 Fold folda.11 — Acyl-CoA binding protein-like
超家族 Superfamily superfamilya.11.2 — Second domain of FERM
家族 Family familya.11.2.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd3qijb3
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.55 — PH domain-like barrel
超家族 Superfamily superfamilyb.55.1 — PH domain-like
家族 Family familyb.55.1.0 — automated matches
结构域编号 domain_idd3qijb4
类 Class classl — Artifacts
折叠类型 Fold foldl.1 — Tags
超家族 Superfamily superfamilyl.1.1 — Tags
家族 Family familyl.1.1.1 — Tags

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id3qijA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1
结构域编号 domain_id3qijA02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology80 — Acyl-CoA Binding Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id3qijA03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology29 — PH-domain like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — Pleckstrin-homology domain (PH domain)/Phosphotyrosine-binding domain (PTB)
结构域编号 domain_id3qijB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture10 — Roll
拓扑 Topology topology20 — Ubiquitin-like (UB roll)
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily90 — Phosphatidylinositol 3-kinase Catalytic Subunit; Chain A, domain 1
结构域编号 domain_id3qijB02
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology80 — Acyl-CoA Binding Protein
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily10
结构域编号 domain_id3qijB03
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology29 — PH-domain like
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily30 — Pleckstrin-homology domain (PH domain)/Phosphotyrosine-binding domain (PTB)

7. 引用文献 (1)