3qj6

The crystal structure of PWWP domain of human Hepatoma-derived growth factor 2 in complex with H3K79me3 peptide

Method: X-RAY DIFFRACTION
▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Hepatoma-derived growth factor-related protein 2

Homo sapiens

UniProt Q7Z4V5

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 2 H3K79me3 × 1 SULFATE ION × 1 UNKNOWN ATOM OR ION × 2 water × 1 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 HDGR2_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 2–94; UniProt 1–93

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3qj6
沉积日期 deposition_date2011-01-28
结构标题 titleThe crystal structure of PWWP domain of human Hepatoma-derived growth factor 2 in complex with H3K79me3 peptide
关键词 keywordsstructural genomics consortium, histone, SGC, PROTEIN BINDING PROTEIN, PROTEIN BINDING- NUCLEAR PROTEIN complex; PROTEIN BINDING/ NUCLEAR PROTEIN
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3qj6__assembly_1__model_1 dimeric (2) 排除 — —
排除原因: 来源记录无法明确判定原子或离子的元素,因此不能可靠计算。
▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 2 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_idd3qj6a_
类 Class classb — All beta proteins
折叠类型 Fold foldb.34 — SH3-like barrel
超家族 Superfamily superfamilyb.34.9 — Tudor/PWWP/MBT
家族 Family familyb.34.9.2 — PWWP domain

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id3qj6A00
类 Class class2 — Mainly Beta
架构 Architecture architecture30 — Roll
拓扑 Topology topology30 — SH3 type barrels.
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily140 —
▶

7. 引用文献 (1)