SAXSdb — 3sja

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATPase GET3

Saccharomyces cerevisiae

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Golgi to ER traffic protein 1 × 2 （P53192） ZINC ION × 1 PHOSPHATE ION × 4 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Golgi to ER traffic protein 1 × 2 （P53192） ZINC ION × 1 PHOSPHATE ION × 2 water × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	Golgi to ER traffic protein 1 × 2 （P53192） ZINC ION × 2 PHOSPHATE ION × 2 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GET3_YEAST
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–354； UniProt 1–354 作者链 B； PDB构建体 1–354； UniProt 1–354 作者链 E； PDB构建体 1–354； UniProt 1–354 作者链 F； PDB构建体 1–354； UniProt 1–354 作者链 I； PDB构建体 1–354； UniProt 1–354

Golgi to ER traffic protein 1

Saccharomyces cerevisiae

UniProt P53192

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	ATPase GET3 × 2 （Q12154） ZINC ION × 1 PHOSPHATE ION × 4 water × 2	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	ATPase GET3 × 2 （Q12154） ZINC ION × 1 PHOSPHATE ION × 2 water × 1	与蛋白数一致
3	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 4	ATPase GET3 × 2 （Q12154） ZINC ION × 2 PHOSPHATE ION × 2 water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	GET1_YEAST
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 2–59； UniProt 36–93 作者链 D； PDB构建体 2–59； UniProt 36–93 作者链 G； PDB构建体 2–59； UniProt 36–93 作者链 H； PDB构建体 2–59； UniProt 36–93 作者链 J； PDB构建体 2–59； UniProt 36–93

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3sja
沉积日期 deposition_date	2011-06-21
结构标题 title	Crystal structure of S. cerevisiae Get3 in the open state in complex with Get1 cytosolic domain
关键词 keywords	Coiled-coil, receptor complex, TA-protein biogenesis, GET pathway, HYDROLASE-TRANSPORT PROTEIN complex; HYDROLASE/TRANSPORT PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3sja__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3sja__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3sja__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	30.64 Å
Rg（电子密度）	29.62 Å
总 Rg	30.45 Å
原子数	6357
残基数	801
排除体积	112920 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3sja__assembly_1__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`3sja__assembly_2__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
3	1	`3sja__assembly_3__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	ATPase GET3
分子量 formula_weight	40464.7 kDa
EC 编号 ec_number	3.6.-.-
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	5

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,B,E,F,I
原子数 atom_count	15873

MDLTVEPNLHSLITSTTHKWIFVGGKGGVGKTTSSCSIAIQMALSQPNKQFLLISTDPAHNLSDAFGEKFGKDARKVTGMNNLSCMEIDPSAALKDMNDMAVSRANNNGSDGQGDDLGSLLQGGALADLTGSIPGIDEALSFMEVMKHIKRQEQGEGETFDTVIFDTAPTGHTLRFLQLPNTLSKLLEKFGEITNKLGPMLNSFMGAGNVDISGKLNELKANVETIRQQFTDPDLTTFVCVCISEFLSLYETERLIQELISYDMDVNSIIVNQLLFAENDQEHNCKRCQARWKMQKKYLDQIDELYEDFHVVKMPLCAGEIRGLNNLTKFSQFLNKEYNPITDGKVIYELEDKELEHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Golgi to ER traffic protein 1
分子量 formula_weight	7896.8 kDa
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	5

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,D,G,H,J

MNELSKKYLAKVKERHELKEFNNSISAQDNYAKWTKNNRKLDSLDKEINNLKDEIQSENHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Saccharomyces cerevisiae
通用名 common_name	;Baker's yeast ;
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	559292
宿主生物 host_organism	Escherichia coli

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	ZINC ION
分子量 formula_weight	65.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	3

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	PHOSPHATE ION
分子量 formula_weight	95.0 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	7

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	5

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

CATH v4.4 (10 domains)

结构域编号 domain_id	3sjaA00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	3sjaB00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	3sjaC00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	660 — Helix hairpin bin

结构域编号 domain_id	3sjaD00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	660 — Helix hairpin bin

结构域编号 domain_id	3sjaE00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	3sjaF00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	3sjaG00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	660 — Helix hairpin bin

结构域编号 domain_id	3sjaH00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	660 — Helix hairpin bin

结构域编号 domain_id	3sjaI00
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	40 — 3-Layer(aba) Sandwich
拓扑 Topology topology	50 — Rossmann fold
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	300 — P-loop containing nucleotide triphosphate hydrolases

结构域编号 domain_id	3sjaJ00
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	287 — Helix Hairpins
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	660 — Helix hairpin bin

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晶胞边长 a length_a	204.120 Å
晶胞边长 b length_b	91.460 Å
晶胞边长 c length_c	149.180 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	20

空间群 space_group	P 21 21 2
空间群编号 int_tables_number	18
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	3.000 Å
最低分辨率 resolution_low	51.300 Å
R 因子 r_factor	0.1834
R_work r_work	0.1808
R_free r_free	0.2314

Crystal structure of S. cerevisiae Get3 in the open state in complex with Get1 cytosolic domain

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATPase GET3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Golgi to ER traffic protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3sja__assembly_1__model_1

3sja__assembly_1__model_1 | I(q)

3sja__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

CATH v4.4 (10 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of S. cerevisiae Get3 in the open state in complex with Get1 cytosolic domain

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

ATPase GET3

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Golgi to ER traffic protein 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3sja__assembly_1__model_1

3sja__assembly_1__model_1 | I(q)

3sja__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

CATH v4.4 (10 domains)

7. 引用文献 (1)