3smp

Monoclinic crystal structure of human pantothenate kinase 1 alpha

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Pantothenate kinase 1

Homo sapiens

UniProt Q8TE04

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白同源多聚体 同源多聚体 蛋白 2 ARSENIC × 6 ACETYL COENZYME *A × 2 CHLORIDE ION × 5 UNKNOWN ATOM OR ION × 6 water × 2 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 PANK1_HUMAN
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 20–386; UniProt 231–597 作者链 B; PDB构建体 20–386; UniProt 231–597

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3smp
沉积日期 deposition_date2011-06-28
结构标题 titleMonoclinic crystal structure of human pantothenate kinase 1 alpha
关键词 keywordsStructural Genomics Consortium, SGC, structural genomics, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3smp__assembly_1__model_1 dimeric (2) 排除 — —
排除原因: 来源记录无法明确判定原子或离子的元素,因此不能可靠计算。
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 10 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_idd3smpa1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.55 — Ribonuclease H-like motif
超家族 Superfamily superfamilyc.55.1 — Actin-like ATPase domain
家族 Family familyc.55.1.14 — Fumble-like
结构域编号 domain_idd3smpa2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.55 — Ribonuclease H-like motif
超家族 Superfamily superfamilyc.55.1 — Actin-like ATPase domain
家族 Family familyc.55.1.14 — Fumble-like
结构域编号 domain_idd3smpb1
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.55 — Ribonuclease H-like motif
超家族 Superfamily superfamilyc.55.1 — Actin-like ATPase domain
家族 Family familyc.55.1.14 — Fumble-like
结构域编号 domain_idd3smpb2
类 Class classc — Alpha and beta proteins (a/b)
折叠类型 Fold foldc.55 — Ribonuclease H-like motif
超家族 Superfamily superfamilyc.55.1 — Actin-like ATPase domain
家族 Family familyc.55.1.14 — Fumble-like

CATH v4.4 (6 domains)

结构域编号 domain_id3smpA01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily510 —
结构域编号 domain_id3smpA02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — ATPase, nucleotide binding domain
结构域编号 domain_id3smpA03
类 Class class6 — Special
架构 Architecture architecture10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology10 — Helicase, Ruva Protein; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 —
结构域编号 domain_id3smpB01
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily510 —
结构域编号 domain_id3smpB02
类 Class class3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture30 — 2-Layer Sandwich
拓扑 Topology topology420 — Nucleotidyltransferase; domain 5
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily40 — ATPase, nucleotide binding domain
结构域编号 domain_id3smpB03
类 Class class6 — Special
架构 Architecture architecture10 — Helix non-globular
拓扑 Topology topology10 — Helicase, Ruva Protein; domain 3
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily60 —
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7. 引用文献 (1)