SAXSdb — 3sri

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Apical membrane antigen 1

Plasmodium falciparum

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Rhoptry neck protein 2 × 1 （Q8IKV6） water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	AMA1_PLAFC
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 3–348； UniProt 97–442

Rhoptry neck protein 2

物种未注明

UniProt Q8IKV6

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 2	Apical membrane antigen 1 × 1 （P50489） water × 2	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q8IKV6_PLAF7
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–29； UniProt 2027–2055

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3sri
沉积日期 deposition_date	2011-07-07
结构标题 title	Crystal structure of Plasmodium falciparum AMA1 in complex with a 29aa PfRON2 peptide
关键词 keywords	AMA1, Plasmodium falciparum, RON2, malaria, CELL INVASION; CELL INVASION
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3sri__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3sri__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3sri__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	21.01 Å
Rg（电子密度）	19.99 Å
总 Rg	20.90 Å
原子数	2460
残基数	311
排除体积	43388 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3sri__assembly_1__model_1`	dimeric （2）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Apical membrane antigen 1
分子量 formula_weight	43664.9 kDa
突变 mutation	N162K, T288V, S373D, N422D, S423K
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	2764

EFIEIVERSNYMGNPWTEYMAKYDIEEVHGSGIRVDLGEDAEVAGTQYRLPSGKCPVFGKGIIIENSKTTFLKPVATGNQDLKDGGFAFPPTEPLISPMTLNGMRDFYKNNEYVKNLDELTLCSRHAGNMNPDKDENSNYKYPAVYDDKDKKCHILYIAAQENNGPRYCNKDESKRNSMFCFRPAKDKSFQNYVYLSKNVVDNWEKVCPRKNLENAKFGLWVDGNCEDIPHVNEFSANDLFECNKLVFELSASDQPKQYEQHLTDYEKIKEGFKNKNADMIKSAFLPTGAFKADRYKSHGKGYNWGNYNRKTHKCEIFNVKPTCLINDKSYIATTALSHPIEVENNFPMVPRAAAAASFLEQKLISEEDLNSAVDHHHHHH

来源 Source

来源生物 organism	Plasmodium falciparum
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	5835
宿主生物 host_organism	Pichia pastoris

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Rhoptry neck protein 2
分子量 formula_weight	3036.5 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B

KDIGAGPVASCFTTRMSPPQQICLNSVVN

实体 3 Entity 3 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	265

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

结构域编号 domain_id	3sriA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	50 — 3-Layer(bba) Sandwich
拓扑 Topology topology	4 — Hepatocyte Growth Factor
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Hepatocyte Growth Factor

▶

晶胞边长 a length_a	70.724 Å
晶胞边长 b length_b	38.137 Å
晶胞边长 c length_c	72.078 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	97.72 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	2

空间群 space_group	P 1 21 1
空间群编号 int_tables_number	4
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	1.600 Å
最低分辨率 resolution_low	35.040 Å
R 因子 r_factor	0.1772
R_work r_work	0.1763
R_free r_free	0.1948

Crystal structure of Plasmodium falciparum AMA1 in complex with a 29aa PfRON2 peptide

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Apical membrane antigen 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Rhoptry neck protein 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3sri__assembly_1__model_1

3sri__assembly_1__model_1 | I(q)

3sri__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal structure of Plasmodium falciparum AMA1 in complex with a 29aa PfRON2 peptide

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Apical membrane antigen 1

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Rhoptry neck protein 2

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3sri__assembly_1__model_1

3sri__assembly_1__model_1 | I(q)

3sri__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 1 domains

CATH v4.4 (1 domains)

7. 引用文献 (1)