SAXSdb — 3swe

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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase

Haemophilus influenzae

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白单体	单体	蛋白 1	SULFATE ION × 5 GLYCEROL × 2 ;(2R)-2-{[(2R,3R,4R,5S,6R)-3-(acetylamino)-2-{[(S)-{[(R)-{[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-5-hydroxy-6-(hydroxymethyl)tetrahydro-2H-pyran-4-yl]oxy}propanoic acid ; × 1 water × 1	与蛋白数一致
2	蛋白同源多聚体	同源多聚体	蛋白 4	SULFATE ION × 20 GLYCEROL × 8 ;(2R)-2-{[(2R,3R,4R,5S,6R)-3-(acetylamino)-2-{[(S)-{[(R)-{[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-5-hydroxy-6-(hydroxymethyl)tetrahydro-2H-pyran-4-yl]oxy}propanoic acid ; × 4 water × 4	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	MURA_HAEIN
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–424； UniProt 1–424

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3swe
沉积日期 deposition_date	2011-07-13
结构标题 title	Haemophilus influenzae MurA in complex with UDP-N-acetylmuramic acid and covalent adduct of PEP with Cys117
关键词 keywords	MURA, CLOSE ENZYME STATE, CELL WALL, BIOGENESIS/DEGRADATION, PEPTIDOGLYCAN SYNTHESIS, TRANSFERASE; TRANSFERASE
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3swe__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3swe__assembly_1__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3swe__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	22.53 Å
Rg（电子密度）	21.43 Å
总 Rg	22.22 Å
原子数	3229
残基数	419
排除体积	57556 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3swe__assembly_1__model_1`	monomeric （1）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`3swe__assembly_2__model_1`	tetrameric （4）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase
分子量 formula_weight	45404.9 kDa
EC 编号 ec_number	2.5.1.7
来源方法 src_method	man
拷贝数 entity_count	1

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A
原子数 atom_count	3547

MDKFRVYGQSRLSGSVNISGAKNAALPILFAAILATEPVKLTNVPELKDIETTLKILRQLGVVVDRDATGAVLLDASNINHFTAPYELVKTMRASIWALAPLVARFHQGQVSLPGGCSIGARPVDLHISGLEKLGADIVLEEGYVKAQVSDRLVGTRIVIEKVSVGATLSIMMAATLAKGTTVIENAAREPEIVDTADFLNKMGAKITGAGSAHITIEGVERLTGCEHSVVPDRIETGTFLIAAAISGGCVVCQNTKADTLDAVIDKLREAGAQVDVTENSITLDMLGNRPKAVNIRTAPHPGFPTDMQAQFTLLNMVAEGTSIITETIFENRFMHIPELIRMGGKAEIEGNTAVCHGVEQLSGTEVIATDLRASISLVLAGCIATGETIVDRIYHIDRGYEHIEDKLRGLGAKIERFSGSDEA

来源 Source

来源生物 organism	Haemophilus influenzae
NCBI 分类编号 ncbi_taxonomy_id	71421
宿主生物 host_organism	ESCHERICHIA COLI

实体 2 Entity 2 non-polymer

描述 description	SULFATE ION
分子量 formula_weight	96.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	5

实体 3 Entity 3 non-polymer

描述 description	GLYCEROL
分子量 formula_weight	92.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	;(2R)-2-{[(2R,3R,4R,5S,6R)-3-(acetylamino)-2-{[(S)-{[(R)-{[(2R,3S,4R,5R)-5-(2,4-dioxo-3,4-dihydropyrimidin-1(2H)-yl)-3,4-dihydroxytetrahydrofuran-2-yl]methoxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}(hydroxy)phosphoryl]oxy}-5-hydroxy-6-(hydroxymethyl)tetrahydro-2H-pyran-4-yl]oxy}propanoic acid ;
分子量 formula_weight	679.4 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	1

实体 5 Entity 5 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	318

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

结构域编号 domain_id	d3swea_
类 Class class	d — Alpha and beta proteins (a+b)
折叠类型 Fold fold	d.68 — IF3-like
超家族 Superfamily superfamily	d.68.2 — EPT/RTPC-like
家族 Family family	d.68.2.2 — Enolpyruvate transferase, EPT

CATH v4.4 (2 domains)

结构域编号 domain_id	3sweA01
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	65 — Alpha-beta prism
拓扑 Topology topology	10 — UDP-n-acetylglucosamine1-carboxyvinyl-transferase; Chain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Enolpyruvate transferase domain

结构域编号 domain_id	3sweA02
类 Class class	3 — Alpha Beta
架构 Architecture architecture	65 — Alpha-beta prism
拓扑 Topology topology	10 — UDP-n-acetylglucosamine1-carboxyvinyl-transferase; Chain
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Enolpyruvate transferase domain

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晶胞边长 a length_a	63.910 Å
晶胞边长 b length_b	123.380 Å
晶胞边长 c length_c	127.630 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	90.00 °
晶胞夹角 β angle_beta	90.00 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	90.00 °
晶胞分子数 Z z_pdb	8

空间群 space_group	I 2 2 2
空间群编号 int_tables_number	23
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.200 Å
最低分辨率 resolution_low	28.570 Å
R 因子 r_factor	0.1860
R_work r_work	0.1860
R_free r_free	0.2380

Haemophilus influenzae MurA in complex with UDP-N-acetylmuramic acid and covalent adduct of PEP with Cys117

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3swe__assembly_1__model_1

3swe__assembly_1__model_1 | I(q)

3swe__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (2)

Haemophilus influenzae MurA in complex with UDP-N-acetylmuramic acid and covalent adduct of PEP with Cys117

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3swe__assembly_1__model_1

3swe__assembly_1__model_1 | I(q)

3swe__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (5)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

来源 Source

实体 2 Entity 2 non-polymer

实体 3 Entity 3 non-polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

SCOP 2.08 (1 domains)

CATH v4.4 (2 domains)

7. 引用文献 (2)