3t97

Molecular Architecture of the Transport Channel of the Nuclear Pore Complex: Nup62/Nup54

Method: X-RAY DIFFRACTION
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1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Nuclear pore complex protein Nup54

Rattus norvegicus

UniProt P70582

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 Nuclear pore glycoprotein p62 × 2 (P17955) water × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NUP54_RAT
Isoform —
PDB实体 1
链与序列区间 作者链 B; PDB构建体 4–65; UniProt 346–407

Nuclear pore glycoprotein p62

Rattus norvegicus

UniProt P17955

当前结构中的状态

Assembly 物理组成 蛋白状态 分子拷贝数 共同组分 数据核对
1 蛋白异源复合物 异源复合物 蛋白 3 Nuclear pore complex protein Nup54 × 1 (P70582) water × 3 与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据
UniProt名称 NUP62_RAT
Isoform —
PDB实体 2
链与序列区间 作者链 A; PDB构建体 1–64; UniProt 362–425 作者链 C; PDB构建体 1–64; UniProt 362–425

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。 链映射与序列区间收在“数据证据”中;数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护,因此不在读者页面展示。

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2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id3t97
沉积日期 deposition_date2011-08-02
结构标题 titleMolecular Architecture of the Transport Channel of the Nuclear Pore Complex: Nup62/Nup54
关键词 keywords;nucleoporin, coiled-coil, nuclear pore complex, central transport channel, alpha helical proteins, triple helix, buried polar residues, structural proteins, nucleoporins, FG repeat, nucleocytoplasmic transport, Nup58, Nup88, Nup93, karyopherin, nuclear envelope, nuclear pore membrane domain, central channel, PROTEIN TRANSPORT ;; PROTEIN TRANSPORT
实验方法 methodX-RAY DIFFRACTION
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3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3t97__assembly_1__model_1

Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3t97__assembly_1__model_1 | I(q)

10-2 10-1 105 106 q (1/Angstrom) I(q)
100 个绘图点;横轴和纵轴均采用对数尺度。

3t97__assembly_1__model_1 | P(r) · Pending

新版 assembly/model P(r) 尚未计算 此处仅保留位置,不展示旧数据 r (Angstrom) P(r)
P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。
Rg(Guinier)24.80 Å
Rg(电子密度)25.16 Å
总 Rg25.40 Å
原子数1405
残基数168
排除体积25075 ų
最大 q0.500 Å⁻¹
Assembly Model 结构单元 聚集说明 状态 CRYSOL 操作
1 1 3t97__assembly_1__model_1 trimeric (3) 成功 4.1.3-1-20251215 (887e7ef) 查看 下载
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4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

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5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (3)

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6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 3 domains

CATH v4.4 (3 domains)

结构域编号 domain_id3t97A00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
结构域编号 domain_id3t97B00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily490 — Single helix bin
结构域编号 domain_id3t97C00
类 Class class1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture20 — Up-down Bundle
拓扑 Topology topology5 — Single alpha-helices involved in coiled-coils or other helix-helix interfaces
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily170 —
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7. 引用文献 (1)