3ts5

Crystal Structure of a Light Chain Domain of Scallop Smooth Muscle Myosin

Method: X-RAY DIFFRACTION

▼

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Myosin heavy chain

物种未注明

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Myosin regulatory light chain × 1 （Q26069） Myosin essential light chain × 1 （Q26066） MAGNESIUM ION × 1 CALCIUM ION × 1 water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Myosin regulatory light chain × 1 （Q26069） Myosin essential light chain × 1 （Q26066） MAGNESIUM ION × 1 CALCIUM ION × 1 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q26080_PLAMG
Isoform	—
PDB实体	1
链与序列区间	作者链 A； PDB构建体 1–69； UniProt 771–839 作者链 D； PDB构建体 1–69； UniProt 771–839

Myosin regulatory light chain

物种未注明

UniProt Q26069

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Myosin heavy chain × 1 （Q26080） Myosin essential light chain × 1 （Q26066） MAGNESIUM ION × 1 CALCIUM ION × 1 water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Myosin heavy chain × 1 （Q26080） Myosin essential light chain × 1 （Q26066） MAGNESIUM ION × 1 CALCIUM ION × 1 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q26069_PLAMG
Isoform	—
PDB实体	2
链与序列区间	作者链 B； PDB构建体 1–161； UniProt 2–162 作者链 E； PDB构建体 1–161； UniProt 2–162

Myosin essential light chain

物种未注明

UniProt Q26066

当前结构中的状态

Assembly	物理组成	蛋白状态	分子拷贝数	共同组分	数据核对
1	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Myosin heavy chain × 1 （Q26080） Myosin regulatory light chain × 1 （Q26069） MAGNESIUM ION × 1 CALCIUM ION × 1 water × 3	与蛋白数一致
2	蛋白异源复合物	异源复合物	蛋白 3	Myosin heavy chain × 1 （Q26080） Myosin regulatory light chain × 1 （Q26069） MAGNESIUM ION × 1 CALCIUM ION × 1 water × 3	与蛋白数一致

数据库中的同蛋白其他状态

查看构建体与数据证据

UniProt名称	Q26066_PLAMG
Isoform	—
PDB实体	3
链与序列区间	作者链 C； PDB构建体 1–156； UniProt 2–157 作者链 F； PDB构建体 1–156； UniProt 2–157

页面优先展示蛋白身份、当前 assembly、共同组分、聚集状态和跨 PDB 结构链接。链映射与序列区间收在“数据证据”中；数据库内部编号、导入时间和 assembly 操作表达式仅用于维护，因此不在读者页面展示。

▼

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

条目编号 entry_id	3ts5
沉积日期 deposition_date	2011-09-12
结构标题 title	Crystal Structure of a Light Chain Domain of Scallop Smooth Muscle Myosin
关键词 keywords	alpha helix, Myosin regulation, Catch muscle, STRUCTURAL PROTEIN; STRUCTURAL PROTEIN
实验方法 method	X-RAY DIFFRACTION

▼

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

页面只读取最新 assembly 计算结果。每一条曲线都对应明确的 PDB、official biological assembly 和 coordinate model。

3ts5__assembly_2__model_1

Assembly 2 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)

下载该曲线 .dat

3ts5__assembly_2__model_1 | I(q)

100 个绘图点；横轴和纵轴均采用对数尺度。

3ts5__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

P(r) 将按相同 assembly/model 分别计算和展示。

Rg（Guinier）	29.31 Å
Rg（电子密度）	29.19 Å
总 Rg	29.64 Å
原子数	2978
残基数	366
排除体积	53139 Å³
最大 q	0.500 Å⁻¹

Assembly	Model	结构单元	聚集说明	状态	CRYSOL	操作
1	1	`3ts5__assembly_1__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载
2	1	`3ts5__assembly_2__model_1`	trimeric （3）	成功	4.1.3-1-20251215 (887e7ef)	查看下载

▶

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

▶

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

描述 description	Myosin heavy chain
分子量 formula_weight	8598.3 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	A,D
原子数 atom_count	6145

NLEEMRDERLSKIISMFQAHIRGYLIRKAYKKLQDQRIGLSVIQRNIRKWLVLRNWQWWKLYAKVKPLL

实体 2 Entity 2 polymer

描述 description	Myosin regulatory light chain
分子量 formula_weight	18402.8 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	B,E

ADKERAQRATSNVFARLPQKLMQEMKEAFTMIDQNRDGFIDINDLKEMFSSLGRTPDDKELTAMLKEAPGPLNFTMFLSIFSDKLSGTDSEETIRNAFGMFDELDTKKLNIEYIKDLLENMGDNFNKDEMRMTFKEAPVEGGKFDYVRFVAMIKGSGDDDA

实体 3 Entity 3 polymer

描述 description	Myosin essential light chain
分子量 formula_weight	17680.6 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	2

聚合物 Polymer

聚合物类型 type	polypeptide(L)
链编号 strand_id	C,F

PKLSQDEIDDLKEVFELFDFWDGRDGAVDAFKIGDVCRCLGINPRNEDVFAVGGTHKMGEKSLPFEEFLPAYEGLMDCEQGTYADYMEAFKTFDREGQGFISGAELRHVLSGLGERLSDEEVDEIINLTDLQEDLEGNVKYEEFVKKVMTGPYPDK

实体 4 Entity 4 non-polymer

描述 description	MAGNESIUM ION
分子量 formula_weight	24.3 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 5 Entity 5 non-polymer

描述 description	CALCIUM ION
分子量 formula_weight	40.1 kDa
来源方法 src_method	syn
拷贝数 entity_count	2

实体 6 Entity 6 water

描述 description	water
分子量 formula_weight	18.0 kDa
来源方法 src_method	nat
拷贝数 entity_count	217

▼

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 14 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

结构域编号 domain_id	d3ts5b_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.39 — EF Hand-like
超家族 Superfamily superfamily	a.39.1 — EF-hand
家族 Family family	a.39.1.5 — Calmodulin-like

结构域编号 domain_id	d3ts5c_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.39 — EF Hand-like
超家族 Superfamily superfamily	a.39.1 — EF-hand
家族 Family family	a.39.1.5 — Calmodulin-like

结构域编号 domain_id	d3ts5e_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.39 — EF Hand-like
超家族 Superfamily superfamily	a.39.1 — EF-hand
家族 Family family	a.39.1.5 — Calmodulin-like

结构域编号 domain_id	d3ts5f_
类 Class class	a — All alpha proteins
折叠类型 Fold fold	a.39 — EF Hand-like
超家族 Superfamily superfamily	a.39.1 — EF-hand
家族 Family family	a.39.1.5 — Calmodulin-like

CATH v4.4 (10 domains)

结构域编号 domain_id	3ts5A00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	270 — Myosin, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Myosin, subunit A

结构域编号 domain_id	3ts5B01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

结构域编号 domain_id	3ts5B02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

结构域编号 domain_id	3ts5C01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

结构域编号 domain_id	3ts5C02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

结构域编号 domain_id	3ts5D00
类 Class class	4 — Few Secondary Structures
架构 Architecture architecture	10 — Irregular
拓扑 Topology topology	270 — Myosin, subunit A
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — Myosin, subunit A

结构域编号 domain_id	3ts5E01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

结构域编号 domain_id	3ts5E02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

结构域编号 domain_id	3ts5F01
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

结构域编号 domain_id	3ts5F02
类 Class class	1 — Mainly Alpha
架构 Architecture architecture	10 — Orthogonal Bundle
拓扑 Topology topology	238 — Recoverin; domain 1
同源超家族 H-superfamily homologous superfamily	10 — EF-hand

▶

晶胞边长 a length_a	50.811 Å
晶胞边长 b length_b	68.775 Å
晶胞边长 c length_c	79.418 Å
晶胞夹角 α angle_alpha	77.33 °
晶胞夹角 β angle_beta	85.99 °
晶胞夹角 γ angle_gamma	73.65 °
晶胞分子数 Z z_pdb	2

空间群 space_group	P 1
空间群编号 int_tables_number	1
晶系 crystal_system	—

分辨率 resolution	2.393 Å
最低分辨率 resolution_low	48.753 Å
R 因子 r_factor	0.1947
R_work r_work	0.1907
R_free r_free	0.2414

Crystal Structure of a Light Chain Domain of Scallop Smooth Muscle Myosin

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Myosin heavy chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Myosin regulatory light chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

Myosin essential light chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3ts5__assembly_2__model_1

3ts5__assembly_2__model_1 | I(q)

3ts5__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 14 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (10 domains)

7. 引用文献 (1)

Crystal Structure of a Light Chain Domain of Scallop Smooth Muscle Myosin

1. 蛋白身份与相关结构 Protein Identity & Related Structures

Myosin heavy chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Myosin regulatory light chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

Myosin essential light chain

当前结构中的状态

数据库中的同蛋白其他状态

单体

同源二聚体

同源四聚体

其他同源多聚体

异源或核酸复合物

2. 结构基本信息 2. Structure Basics

3. Official assembly/model 理论 SAXS Official SAXS Profiles

3ts5__assembly_2__model_1

3ts5__assembly_2__model_1 | I(q)

3ts5__assembly_2__model_1 | P(r) · Pending

4. 晶体学与实验 4. Crystallography & Experiment

晶胞参数 Unit Cell

对称性 Symmetry

精修参数 Refinement

衍射实验 Diffraction

5. 实体与聚合物信息 Entities & Polymers (6)

实体 1 Entity 1 polymer

聚合物 Polymer

实体 2 Entity 2 polymer

聚合物 Polymer

实体 3 Entity 3 polymer

聚合物 Polymer

实体 4 Entity 4 non-polymer

实体 5 Entity 5 non-polymer

实体 6 Entity 6 water

6. 折叠分类 (SCOP + CATH) 14 domains

SCOP 2.08 (4 domains)

CATH v4.4 (10 domains)

7. 引用文献 (1)