Aeropyrum pernix
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白–DNA | 同源多聚体 | 蛋白 2 DNA 2 | ;DNA (5'-D(*CP*CP*GP*GP*C)-3') ; × 1 ;DNA (5'-D(*GP*GP*CP*CP*G)-3') ; × 1 PHOSPHATE ION × 1 water × 4 | 与全部聚合物一致 |
| UniProt名称 | ALBA2_AERPE |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–102； UniProt 1–102 作者链 C； PDB构建体 1–102； UniProt 1–102 |
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| 条目编号 entry_id | 3u6y |
| 沉积日期 deposition_date | 2011-10-13 |
| 结构标题 title | Crystal structure of ALBA2-DNA complex |
| 关键词 keywords | ;ALBA 2, Archaea, DNA-Binding Protein, Structural Genomics, NPPSFA, National Project on Protein Structural and Functional Analyses, RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative, RSGI, DNA Binding Protein-DNA complex ;; DNA BINDING PROTEIN/DNA |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 21.22 Å |
| Rg（电子密度） | 19.65 Å |
| 总 Rg | 20.52 Å |
| 原子数 | 1750 |
| 残基数 | 208 |
| 排除体积 | 30628 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d3u6ya_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.68 — IF3-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.68.6 — AlbA-like |
| 家族 Family family | d.68.6.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | d3u6yc_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.68 — IF3-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.68.6 — AlbA-like |
| 家族 Family family | d.68.6.0 — automated matches |
| 结构域编号 domain_id | 3u6yA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 110 — Translation Initiation Factor IF3 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 20 — Alba-like domain |
| 结构域编号 domain_id | 3u6yC00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 110 — Translation Initiation Factor IF3 |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 20 — Alba-like domain |