Escherichia coli
| Assembly | 物理组成 | 蛋白状态 | 分子拷贝数 | 共同组分 | 数据核对 |
|---|---|---|---|---|---|
| 1 | 蛋白单体 | 单体 | 蛋白 1 | 5'-S-[1-(2-{[(2-amino-7,7-dimethyl-4-oxo-3,4,7,8-tetrahydropteridin-6-yl)methyl]amino}ethyl)piperidin-4-yl]-5'-thioadenosine × 1 ACETATE ION × 1 water × 1 | 与蛋白数一致 |
| UniProt名称 | HPPK_ECOLI |
| Isoform | — |
| PDB实体 | 1 |
| 链与序列区间 | 作者链 A； PDB构建体 1–158； UniProt 2–159 |
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| 条目编号 entry_id | 3ude |
| 沉积日期 deposition_date | 2011-10-28 |
| 结构标题 title | Crystal structure of E. coli HPPK in complex with bisubstrate analogue inhibitor J1B |
| 关键词 keywords | Alpha Beta, Kinase, ATP Binding, Pyrophosphoryl Transfer, TRANSFERASE-TRANSFERASE INHIBITOR complex; TRANSFERASE/TRANSFERASE INHIBITOR |
| 实验方法 method | X-RAY DIFFRACTION |
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Assembly 1 · Model 1 · CRYSOL 4.1.3-1-20251215 (887e7ef)
| Rg（Guinier） | 16.20 Å |
| Rg（电子密度） | 14.79 Å |
| 总 Rg | 15.92 Å |
| 原子数 | 1282 |
| 残基数 | 154 |
| 排除体积 | 22819 ų |
| 最大 q | 0.500 Å⁻¹ |
| 结构域编号 domain_id | d3udea_ |
| 类 Class class | d — Alpha and beta proteins (a+b) |
| 折叠类型 Fold fold | d.58 — Ferredoxin-like |
| 超家族 Superfamily superfamily | d.58.30 — 6-hydroxymethyl-7,8-dihydropterin pyrophosphokinase, HPPK |
| 家族 Family family | d.58.30.1 — 6-hydroxymethyl-7,8-dihydropterin pyrophosphokinase, HPPK |
| 结构域编号 domain_id | 3udeA00 |
| 类 Class class | 3 — Alpha Beta |
| 架构 Architecture architecture | 30 — 2-Layer Sandwich |
| 拓扑 Topology topology | 70 — Alpha-Beta Plaits |
| 同源超家族 H-superfamily homologous superfamily | 560 — 7,8-Dihydro-6-hydroxymethylpterin-pyrophosphokinase HPPK |